IFI6

IFI6
識別子
エイリアス	IFI6、6-16、FAM14C、G1P3、IFI-6-16、IFI616、インターフェロンα誘導性タンパク質6
外部ID	オミム: 147572;ホモロジーン: 49720;ジーンカード：IFI6; OMA :IFI6 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 染色体1（ヒト）[1] バンド 1p35.3 始める 27,666,064 bp [1] 終わり 27,672,212 bp [1]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 下垂体前葉 下行胸部大動脈 右肺 単球 右副腎 右副腎皮質 右冠動脈 歯周繊維 右卵管 顆粒球 該当なし より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 細胞成分 膜の不可欠な構成要素 細胞膜 膜 ミトコンドリア 生物学的プロセス ミトコンドリアの脱分極の負の制御 アポトーシス過程に関与するシステイン型エンドペプチダーゼ活性の負の制御 リガンド非存在下での外因性アポトーシスシグナル伝達経路の負の制御 I型インターフェロンシグナル伝達経路 免疫反応 ミトコンドリアからのシトクロムcの放出 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 2537 該当なし アンサンブル ENSG00000126709 該当なし ユニプロット P09912 該当なし RefSeq (mRNA) NM_022873 NM_002038 NM_022872 該当なし RefSeq（タンパク質） NP_002029 NP_075010 NP_075011 該当なし 場所（UCSC） 1章: 27.67 – 27.67 Mb 該当なし PubMed検索 [2] 該当なし
ウィキデータ
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インターフェロンα誘導性タンパク質6は、ヒトではIFI6遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[3]

この遺伝子は、インターフェロンによって誘導される多くの遺伝子の一つとして初めて同定されました。コードされているタンパク質は、アポトーシスの制御において重要な役割を果たす可能性があります。哺乳類のスプライスドナーコンセンサス配列に類似した12ヌクレオチドの反復配列を26回繰り返したミニサテライトが、第2エクソンの末端付近から始まります。下流の2つの反復ユニットをスプライスドナー部位として利用することで、異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシング転写バリアントが報告されています。^[3]

IFI6は、フラビウイルス科（DENV、YFV、ZIKV、WNV）のいくつかのウイルスに対して抗ウイルス機能を持つことが知られています。IFI6は、ウイルスが誘導する複製小器官を形成する膜構造の形成を阻害することで、ウイルスの複製を阻害することができました。^[4]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000126709 – Ensembl、2017年5月
2. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
3. 「Entrez Gene: IFI6 インターフェロン、α誘導性タンパク質 6」。
4. Richardson RB, Ohlson MB, Eitson JL, Kumar A, McDougal MB, Boys IN, et al. (2018年11月). 「CRISPRスクリーニングにより、フラビウイルスの複製を阻害するER常在インターフェロンエフェクターとしてIFI6が同定された」Nature Microbiology . 3 (11): 1214– 1223. doi :10.1038/s41564-018-0244-1. PMC 6202210. PMID  30224801 . 

さらに読む

• Itzhaki JE, Barnett MA, MacCarthy AB, Buckle VJ, Brown WR, Porter AC (1992年12月). 「クローン化ヒトテロメアDNAによるヒト染色体の標的切断」. Nature Genetics . 2 (4): 283– 287. doi :10.1038/ng1292-283. PMID  1303280. S2CID  38466985.
• Clauss IM, Wathelet MG, Szpirer J, Content J, Islam MQ, Levan G, et al. (1990). 「インターフェロン、二本鎖RNA、およびウイルスによって誘導される2つのヒト遺伝子の染色体局在」. Cytogenetics and Cell Genetics . 53 ( 2–3 ): 166– 168. doi :10.1159/000132920. PMID  1695131.
• Itzhaki JE, Porter AC (1991年7月). 「ヒト成長ホルモン分泌によって検出されたヒトインターフェロン誘導性遺伝子の標的破壊」. Nucleic Acids Research . 19 (14): 3835– 3842. doi :10.1093/nar/19.14.3835. PMC 328471.  PMID 1713665  .
• Kelly JM, Porter AC, Chernajovsky Y, Gilbert CS, Stark GR, Kerr IM (1986年7月). 「α-およびβ-インターフェロンによって誘導されるヒト遺伝子の特性解析とマウス細胞における発現」. The EMBO Journal . 5 (7): 1601– 1606. doi :10.1002/j.1460-2075.1986.tb04402.x. PMC  1166985. PMID  3017706 .
• Porter AC, Chernajovsky Y, Dale TC, Gilbert CS, Stark GR, Kerr IM (1988年1月). 「ヒト遺伝子6-16のインターフェロン応答エレメント」. The EMBO Journal . 7 (1): 85– 92. doi :10.1002/j.1460-2075.1988.tb02786.x. PMC 454218.  PMID 3359997  .
• Friedman RL, Manly SP, McMahon M, Kerr IM, Stark GR (1984年10月). 「ヒト細胞におけるインターフェロン誘導性遺伝子発現の転写および転写後制御」. Cell . 38 (3): 745– 755. doi :10.1016/0092-8674(84)90270-8. PMID  6548414. S2CID  37810920.
• Turri MG, Cuin KA, Porter AC (1995年6月). 「インターフェロン誘導性転写産物において複数のスプライスドナー部位を提供する新規ミニサテライトの特性評価」. Nucleic Acids Research . 23 (11): 1854–1861 . doi :10.1093/nar/23.11.1854. PMC  306954. PMID  7596809 .
• Hofmann WA, Stojiljkovic L, Fuchsova B, Vargas GM, Mavrommatis E, Philimonenko V, et al. (2004年11月). 「アクチンは転写開始前複合体の一部であり、RNAポリメラーゼIIによる転写に必須である」. Nature Cell Biology . 6 (11): 1094– 1101. doi :10.1038/ncb1182. PMID  15502823. S2CID  23909479.
• 田原 英之、田原 秀一、菅野 正之、中 健一、武田 雄一、松崎 剛、他 (2005年8月). 「インターフェロン誘導遺伝子6-16であるG1P3は胃癌で発現し、胃癌細胞株TMK-1細胞におけるミトコンドリア介在性アポトーシスを阻害する」. Cancer Immunology, Immunotherapy . 54 (8): 729– 740. doi :10.1007/s00262-004-0645-2. PMC 11034321.  PMID 15685448.  S2CID 13399785  .