ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| ILF2 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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4AT7、4AT8、4AT9、4ATB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ILF2、NF45、PRO3063、インターロイキンエンハンサー結合因子2 |
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| 外部ID | オミム:603181; MGI : 1915031;ホモロジーン: 26894;ジーンカード:ILF2; OMA :ILF2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 3番染色体(マウス)[1] |
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| | バンド | 3|3 F1 | 始める | 90,383,433 bp [1] |
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| 終わり | 90,395,686 bp [1] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 神経節隆起
- ランゲルハンス島
- 下垂体前葉
- 直腸
- 膵臓の体
- 腹部の皮膚
- 甲状腺の左葉
- 左卵管
- 甲状腺の右葉
- 右副腎
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| | 上位の表現 | - 心室帯
- 胚の尾
- 性器結節
- 神経節隆起
- 神経管
- 腹壁
- 内側神経節隆起
- 網膜の神経層
- 胚葉上層
- 胚
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- トランスフェラーゼ活性
- DNA結合
- 二本鎖RNA結合
- タンパク質結合
- ATP結合
- RNA結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- 核小体
- 膜
- 核
- 特定の顆粒腔
- 三次顆粒腔
- フィコリン-1に富む顆粒腔
- 細胞外領域
- リボ核タンパク質複合体
| | 生物学的プロセス |
- 転写の正の制御、DNAテンプレート
- 転写の制御、DNAテンプレート
- 免疫反応
- 転写、DNAテンプレート
- 好中球脱顆粒
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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インターロイキンエンハンサー結合因子2は、ヒトではILF2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[4] [5]
関数
活性化T細胞核因子(NFAT)は、T細胞におけるインターロイキン2遺伝子の発現に必要な転写因子です。NFATは、インターロイキン2遺伝子エンハンサー内の抗原受容体応答配列2と呼ばれる配列に結合します。さらに、NFATはRNAに結合し、 B型肝炎ウイルスポリメラーゼのキャプシド形成およびタンパク質プライミングに不可欠な構成要素です。NFATは45 kDaと90 kDaのタンパク質からなるヘテロ二量体であり、そのうち小さい方のタンパク質がこの遺伝子の産物です。コードされているタンパク質は90 kDaのタンパク質に強く結合し、遺伝子発現を促進する能力を刺激します。[5]
相互作用
ILF2はCDC5L [6]およびDNA-PKcs [7]と相互作用することが示されている。
ILF2とILF3は、誘発性ループスを発症したマウスの自己抗原として同定されており[8] [9]、犬の全身性リウマチ性自己免疫疾患の自己抗原として同定されており[10] [11]、また自己免疫疾患を持つヒトのまれな所見としても同定されている[12] 。
参考文献
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000001016 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Kao PN, Chen L, Brock G, Ng J, Kenny J, Smith AJ, Corthésy B (1994年8月). 「活性化T細胞のシクロスポリンAおよびFK506感受性核因子:NF45およびNF90のクローニングと発現」. The Journal of Biological Chemistry . 269 (32): 20691–9 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)32048-3 . PMID 7519613.
- ^ ab 「Entrez Gene: ILF2 インターロイキンエンハンサー結合因子 2、45kDa」。
- ^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (2000年12月). 「ヒトCDC5L複合体の機能解析と質量分析によるその構成分子の同定」. The EMBO Journal . 19 (23): 6569–81 . doi :10.1093/emboj/19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529 .
- ^ Ting NS, Kao PN, Chan DW, Lintott LG, Lees-Miller SP (1998年1月). 「DNA依存性プロテインキナーゼは抗原受容体応答配列結合タンパク質NF90およびNF45と相互作用する」. The Journal of Biological Chemistry . 273 (4): 2136–45 . CiteSeerX 10.1.1.615.1747 . doi : 10.1074/jbc.273.4.2136 . PMID 9442054.
- ^ Satoh M, Shaheen VM, Kao PN, Okano T, Shaw M, Yoshida H, Richards HB, Reeves WH (1999年12月). 「自己抗体は、保存された二本鎖RNA結合ドメインとDNA結合活性を持つタンパク質ファミリーを定義する」. The Journal of Biological Chemistry . 274 (49): 34598–604 . doi : 10.1074/jbc.274.49.34598 . PMID 10574923.
- ^ 黒田雄一、小野尚志、赤尾木淳、ナシオナルズDC、山崎雄一、バーカーTT、リーブスWH、佐藤正治(2006年2月)「BALB/cマウスにおけるn-ヘキサデカンの腹腔内投与による非特異的炎症によるループス関連特異的自己抗体の誘導」毒性学誌218 ( 2–3 ) : 186–96 . Bibcode :2006Toxgy.218..186K. doi :10.1016/j.tox.2005.10.011. PMID 16309812.
- ^ Bremer HD、Landegren N、Sjöberg R、Hallgren Å、Renneker S、Lattwein E、Leonard D、Eloranta ML、Rönnblom L、Nordmark G、Nilsson P、Andersson G、Lilliehöök I、Lindblad-Toh K、Kämpe O、Hansson-Hamlin H (2018 年 3 月)。 「ILF2 と ILF3 はイヌの全身性自己免疫疾患における自己抗原です。」科学的報告書。8 (1) 4852。ビブコード:2018NatSR...8.4852B。土井:10.1038/s41598-018-23034-w。PMC 5859008。PMID 29556082。
- ^ ハンナB (2018).犬の免疫介在性疾患。 Acta Universitatis agriculturae Sueciae。ISBN 978-91-7760-166-1。
- ^ Satoh M, Shaheen VM, Kao PN, Okano T, Shaw M, Yoshida H, Richards HB, Reeves WH (1999年12月). 「自己抗体は、保存された二本鎖RNA結合ドメインとDNA結合活性を持つタンパク質ファミリーを定義する」. The Journal of Biological Chemistry . 274 (49): 34598–604 . doi : 10.1074/jbc.274.49.34598 . PMID 10574923.
さらに読む
- 丸山 憲治、菅野 誠(1994年1月). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Marcoulatos P, Koussidis G, Mamuris Z, Velissariou V, Vamvakopoulos NC (1996年12月). 「ヒト-げっ歯類体細胞ハイブリッドDNAテンプレートのポリメラーゼ連鎖反応増幅によるヒト1番染色体(1q11-qterおよび1p11-p12)へのインターロイキンエンハンサー結合因子2遺伝子(ILF2)のマッピング」Journal of Interferon & Cytokine Research . 16 (12): 1035–8 . doi :10.1089/jir.1996.16.1035. PMID 8974006.
- 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、須山明生、菅野誠一(1997年10月)「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Ting NS, Kao PN, Chan DW, Lintott LG, Lees-Miller SP (1998年1月). 「DNA依存性プロテインキナーゼは抗原受容体応答配列結合タンパク質NF90およびNF45と相互作用する」. The Journal of Biological Chemistry . 273 (4): 2136–45 . CiteSeerX 10.1.1.615.1747 . doi : 10.1074/jbc.273.4.2136 . PMID 9442054.
- Langland JO, Kao PN, Jacobs BL (1999年5月). 「活性化T細胞の核因子90:二本鎖RNA結合タンパク質であり、二本鎖RNA依存性タンパク質キナーゼPKRの基質である」.生化学. 38 (19): 6361–8 . doi :10.1021/bi982410u. PMID 10320367.
- Satoh M, Shaheen VM, Kao PN, Okano T, Shaw M, Yoshida H, Richards HB, Reeves WH (1999年12月). 「自己抗体は、DNA結合活性に加え、保存された二本鎖RNA結合ドメインを有するタンパク質ファミリーを定義する」The Journal of Biological Chemistry . 274 (49): 34598–604 . doi : 10.1074/jbc.274.49.34598 . PMID 10574923.
- Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (2000年12月). 「ヒトCDC5L複合体の機能解析と質量分析による構成タンパク質の同定」. The EMBO Journal . 19 (23): 6569–81 . doi :10.1093/emboj/19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529 .
- Parker LM, Fierro-Monti I, Mathews MB (2001年8月). 「核因子90は真核生物の活性化開始因子2キナーゼである二本鎖RNA活性化プロテインキナーゼの基質および調節因子である」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (35): 32522–30 . doi : 10.1074/jbc.M104408200 . PMID 11438540.
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- Li J, Hawkins IC, Harvey CD, Jennings JL, Link AJ, Patton JG (2003年11月). 「SRrp86とその相互作用タンパク質による選択的スプライシングの制御」. Molecular and Cellular Biology . 23 (21): 7437–47 . doi :10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC 207616. PMID 14559993 .
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- Nie Y, Ding L, Kao PN, Braun R, Yang JH (2005年8月). 「ADAR1は二本鎖RNAを介してNF90と相互作用し、RNA編集とは独立してNF90を介した遺伝子発現を制御する」. Molecular and Cellular Biology . 25 (16): 6956–63 . doi :10.1128/MCB.25.16.6956-6963.2005. PMC 1190226. PMID 16055709 .
- ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサク S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
外部リンク
- ILF2+タンパク質、+ヒト 米国国立医学図書館医学件名表題集(MeSH)
- PDBe-KBは、マウスインターロイキンエンハンサー結合因子2(ILF2)のPDBに登録されているすべての構造情報の概要を提供します。
この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。