ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| INVS |
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| 識別子 |
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| エイリアス | INVS、INV、NPH2、NPHP2、インバーシン |
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| 外部ID | オミム: 243305; MGI : 1335082;ホモロジーン: 7786;ジーンカード:INVS; OMA :INVS - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 4番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 4 B1|4 26.11 cM | 始める | 48,279,760 bp [2] |
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| 終わり | 48,431,954 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - アキレス腱
- 腓骨神経
- 生殖腺
- 膵管細胞
- 精子
- 左卵巣
- 肝臓の右葉
- 心室帯
- 睾丸
- 子宮内膜間質細胞
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| | 上位の表現 | - 球形嚢
- 腰椎神経節
- 窩
- 蝸牛管の前庭膜
- 下垂体
- 胚の尾
- 回腸上皮
- 顆状突起
- 大動脈弁
- 毛様体
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 細胞質
- スピンドル
- 細胞投影
- 繊毛
- 微小管
- 細胞骨格
- 膜
- 核
| | 生物学的プロセス |
- 多細胞生物の発達
- Wntシグナル伝達経路
- 標準的なWntシグナル伝達経路の負の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_014425 NM_183245 NM_001318381 NM_001318382 |
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NM_001281977 NM_001281978 NM_010569 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001305310 NP_001305311 NP_055240 NP_001305310.1 |
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| 場所(UCSC) | 9章: 100.1 – 100.3 Mb | 4章: 48.28 – 48.43 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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インバーシンはヒトではINVS遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子は、複数のアンキリンドメインと2つのIQカルモジュリン結合ドメインを含むタンパク質をコードしています。コードされているタンパク質は、腎尿細管の発達と機能、および左右軸の決定に機能すると考えられます。このタンパク質はネフロシスチンと相互作用し、一次繊毛機能と左右軸の決定との関連を示唆しています。マウスでは同様のタンパク質がカルモジュリンと相互作用します。この遺伝子の変異は、2型ネフロン癆と関連しています。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが同定されています。[6]
相互作用
INVSはNPHP1と相互作用することが示されている。[5]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000119509 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000028344 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Otto EA, Schermer B, Obara T, O'Toole JF, Hiller KS, Mueller AM, Ruf RG, Hoefele J, Beekmann F, Landau D, Foreman JW, Goodship JA, Strachan T, Kispert A, Wolf MT, Gagnadoux MF, Nivet H, Antignac C, Walz G, Drummond IA, Benzing T, Hildebrandt F (2003年8月). 「インバーシンをコードするINVSの変異はネフロン癆2型を引き起こし、腎嚢胞性疾患と一次繊毛の機能および左右軸決定との関連を明らかにする」Nat Genet . 34 (4): 413–20 . doi :10.1038/ng1217. PMC 3732175. PMID 12872123 .
- ^ ab "Entrez Gene: INVS インバーシン".
さらに読む
- 横山 剛志、コープランド NG、ジェンキンス NA、他 (1993). 「左右非対称性の反転:位置逆位変異」. Science . 260 (5108): 679–82 . Bibcode :1993Sci...260..679Y. doi :10.1126/science.8480178. PMID: 8480178.
- Haider NB, Carmi R, Shalev H, et al. (1998). 「乳児性ネフロン癆を呈するベドウィン家系において、ホモ接合マッピングにより9番染色体への連鎖が証明される」Am. J. Hum. Genet . 63 (5): 1404–10 . doi :10.1086/302108. PMC 1377550. PMID 9792867 .
- Schön P, Tsuchiya K, Lenoir D, et al. (2002). 「左右軸発達および胆道閉鎖症に関与するマウス遺伝子の相同遺伝子であるヒトINV遺伝子の同定、ゲノム構成、染色体マッピング、および変異解析」Hum. Genet . 110 (2): 157–65 . doi :10.1007/s00439-001-0655-5. PMID 11935322. S2CID 22047620.
- Morgan D, Goodship J, Essner JJ, et al. (2002). 「左右決定因子インバーシンは高度に保存されたアンキリンリピートとIQドメインを有し、カルモジュリンと相互作用する」. Hum. Genet . 110 (4): 377–84 . doi :10.1007/s00439-002-0696-4. PMID 11941489. S2CID 30851723.
- Nürnberger J, Bacallao RL, Phillips CL (2003). 「極性上皮細胞において、インバーシンはカテニンおよびN-カドヘリンと複合体を形成する」. Mol. Biol. Cell . 13 (9): 3096–106 . doi :10.1091/mbc.E02-04-0195. PMC 124145. PMID 12221118 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Humphray SJ, Oliver K, Hunt AR, et al. (2004). 「ヒト9番染色体のDNA配列と解析」. Nature . 429 (6990): 369–74 . Bibcode :2004Natur.429..369H. doi :10.1038/nature02465. PMC 2734081. PMID 15164053 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクト:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)の現状、品質、そして拡大」Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- Otto EA, Loeys B, Khanna H, et al. (2005). 「繊毛IQドメインタンパク質であるネフロシスチン-5は、シニア・ローケン症候群において変異し、RPGRおよびカルモジュリンと相互作用する」Nat. Genet . 37 (3): 282–8 . doi :10.1038/ng1520. PMID 15723066. S2CID 4972004.
- Simons M, Gloy J, Ganner A, et al. (2005). 「II型ネフロン癆で変異した遺伝子産物であるインバーシンは、Wntシグナル伝達経路間の分子スイッチとして機能する」Nat. Genet . 37 (5): 537–43 . doi :10.1038/ng1552. PMC 3733333. PMID 15852005 .
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- O'Toole JF, Otto EA, Frishberg Y, Hildebrandt F (2007). 「INVS遺伝子変異患者における網膜色素変性症および腎不全」Nephrol. Dial. Transplant . 21 (7): 1989–91 . doi :10.1093/ndt/gfl088. PMID 16522655.
- Gilling M, Dullinger JS, Gesk S, et al. (2006). 「ブレークポイントクローニングとハプロタイプ解析により、北欧人に共通するInv(10)(p11.2q21.2)変異の単一起源が示唆される」Am. J. Hum. Genet . 78 (5): 878– 83. doi :10.1086/503632. PMC 1474032. PMID 16642442 .
- Assadi F (2007). 「末期腎不全を呈したジュベール症候群関連疾患の新生児におけるNPHP2遺伝子変異の欠如」. Pediatr. Nephrol . 22 (5): 750–2 . doi :10.1007/s00467-006-0412-z. PMID 17216245. S2CID 10272235.