ITK-SNAP

医療画像ソフトウェア
ITK-SNAP
開発者Paul A. Yushkevich、Guido Gerig、および UPenn、UNC、ユタ州、Kitware の研究者
初回リリース2004
書かれたC++
プラットフォームクロスプラットフォーム
入手可能な英語
タイプ健康ソフトウェア
ライセンスGNU一般公衆利用許諾契約書
Webサイトhttp://www.itksnap.org

ITK-SNAPは、ユーザーが3次元医用画像を操作し、関心のある解剖学的領域を手動で描画し、画像を自動的にセグメンテーションできるインタラクティブなソフトウェアアプリケーションです。このソフトウェアは、臨床および基礎科学研究者を念頭に置いて設計されており、ユーザーフレンドリーなインターフェースと、機能の過剰使用を防ぐための限定的な機能セットの維持に重点が置かれています。ITK-SNAPは、磁気共鳴画像(MRI)、コーンビームコンピュータ断層撮影(CBCT)、コンピュータ断層撮影(CT)のデータセットを扱う際に最もよく使用されます。

特徴

このツールの目的は、研究者が画像データ内の解剖学的構造や関心領域を容易に描写できるようにすることです。機能は最小限に抑えられています。プログラムの主な機能は以下のとおりです。

画像ナビゲーション
画像ボリュームを貫く3つの直交断面が常に表示されます。これらの断面は共通のカーソルでリンクされており、1つの断面でカーソルを動かすと、他の断面も更新されます。カーソルは、マウスを切断面上でドラッグすることで移動し、スムーズなナビゲーションを実現します。リンクされたカーソルはITK-SNAPセッション間でも機能するため、マルチモダリティ画像データ(例えば、1回のセッションで同じ被験者の2つのMRIスキャン画像)をナビゲートできます。
手動セグメンテーション
ITK-SNAPは、画像内の解剖学的構造を手動で描画するためのツールを提供します。3つの直交断面すべてにラベル付けが可能で、結果は3次元レンダリングとして視覚化できます。これにより、セグメンテーションが3D上で適切な形状を維持していることを容易に確認できます。
自動セグメンテーション
ITK-SNAPは、レベルセット法を用いた自動機能セグメンテーションを提供します。これにより、医療画像においてある程度均質に見える構造を、人間の介入をほとんど必要とせずにセグメンテーションすることが可能になります。例えば、MRIにおける側脳室や、CTおよびMRIにおける一部の腫瘍を確実にセグメンテーションできます。

ITK-SNAPは、GNU General Public Licenseに基づいて配布されているオープンソースソフトウェアです。C ++で記述されており、 Insight Segmentation and Registration Toolkit (ITK) ライブラリを活用しています。ITK-SNAPは、DICOM、NIfTI、Mayo Analyzeなど、様々な医用画像フォーマットの読み書きが可能です。また、多成分画像(例:拡散テンソル画像)や多変量画像データも 限定的にサポートしています。

アプリケーション

ITK-SNAPは以下の分野に適用されています

参考文献

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  • ITK-SNAP のメイン Web サイト (ダウンロード、バグ、メーリング リスト)
  • SourceForgeの ITK-SNAP
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