アポトーシス阻害ドメイン

アポトーシス阻害ドメイン
ヒトBIRC2タンパク質のBIRドメインのNMR溶液構造。[ 1 ]タンパク質は虹色の漫画図(N末端=青、C末端=赤)で示され、配位亜鉛は灰色の球で表されている。
識別子
シンボルBIR
ファムPF00653
インタープロIPR001370
プロサイトPS50143
SCOP21qbh /スコープ/ SUPFAM
利用可能なタンパク質構造:
PDB  1c9q ​, 1e31 ​, 1f3h ​, 1f9x ​, 1g3f ​, 1g73 ​, 1i3o ​, 1jd4 ​, 1jd5 ​, 1jd6 ​, 1m4m ​, 1nw9 ​, 1oxn ​, 1oxq ​, 1oy7 ​, 1q4q ​, 1qbh ​, 1sdz ​, 1se0 ​, 1tfq ​, 1tft ​, 1tw6 ​, 1xb0 ​, 1xb1 ​, 1xox ​, 2i3h ​, 2i3i ​IPR001370 PF00653 ( ECOD ; PDBsum )  
アルファフォールド

アポトーシス阻害ドメインIAPリピートB. aculovirus I nhibitor of apoptosis protein RepeatBIRとも呼ばれる)は、アポトーシスサイトカイン産生、染色体分離に関わるタンパク質に見られる構造モチーフである。[ 2 ] BIRを含むタンパク質は、アポトーシス阻害タンパク質(IAP)またはBIR含有タンパク質(BIRPまたはBIRC)として知られ、BIRC1(NAIP)、 BIRC2( cIAP1)、BIRC3 (cIAP2)、 BIRC4xIAP ) 、BIRC5(survivin)、BIRC6などがある。[ 2 ] [ 3 ]

BIRドメインはジンクフィンガードメインファミリーに属し、亜鉛イオンを配位する3つの保存されたシステインと1つの保存されたヒスチジンを含む、多数の不変アミノ酸残基を持つことが特徴である。[ 4 ]これらは通常、4~5個のαヘリックスと3本鎖のβシートから構成される。

参考文献

  1. ^ PDB : 1QBH ​; Hinds MG, Norton RS, Vaux DL, Day CL (1999年7月). 「バキュロウイルスアポトーシス阻害剤(IAP)リピートの溶液構造」Nat. Struct. Biol . 6 (7): 648–51 . doi : 10.1038 / 10701 . PMID  10404221. S2CID  3194182 .
  2. ^ a b Silke J, Vaux DL (2001年5月). 「2種類のBIR含有タンパク質 - アポトーシス阻害因子、あるいは有糸分裂に必須」. J. Cell Sci . 114 (Pt 10): 1821–7 . doi : 10.1242/jcs.114.10.1821 . PMID 11329368 . 
  3. ^ Verhagen AM, Coulson EJ, Vaux DL (2001). 「アポトーシス阻害タンパク質とその関連因子:IAPとその他のBIRP」 . Genome Biol . 2 (7) REVIEWS3009. doi : 10.1186 / gb-2001-2-7-reviews3009 . PMC 139420. PMID 11516343 .  
  4. ^ Birnbaum MJ, Clem RJ, Miller LK (1994年4月). 「Cys/His配列モチーフを持つポリペプチドコードする核多角体病ウイルス由来のアポトーシス阻害遺伝子」 . J. Virol . 68 (4): 2521–8 . doi : 10.1128/JVI.68.4.2521-2528.1994 . PMC 236730. PMID 8139034 .  
この記事には、パブリックドメインのPfamおよびInterPro : IPR001370からのテキストが含まれています。