インテグリンα10

ITGA10
利用可能な構造 PDB ヒトUniProt検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1PT6、1QC5、1QCY、2L8S、2M32、4A0Q
識別子
エイリアス	ITGA10、PRO827、インテグリンサブユニットα10
外部ID	オミム：604042; MGI : 2153482;ホモロジーン: 2697;ジーンカード：ITGA10; OMA :ITGA10 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 染色体1（ヒト）[1] バンド 1q21.1 始める 145,891,208 bp [1] 終わり 145,910,111 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 3番染色体（マウス）[2] バンド 3|3 F2.1 始める 96,552,900 bp [2] 終わり 96,571,835 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 脛骨 下行胸部大動脈 軟骨組織 上行大動脈 右冠動脈 アキレス腱 胃粘膜 歯周繊維 左冠動脈 右肺 上位の表現 顔面骨格 頭蓋冠 皮膚頭蓋 膜状骨 下顎 蝶形骨 窩 上顎 基底蝶形骨 大腿骨体 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 金属イオン結合 細胞-マトリックス接着に関与するコラーゲン結合 コラーゲン結合 細胞成分 インテグリン複合体 細胞膜 膜 インテグリンα10-β1複合体 膜の不可欠な構成要素 生物学的プロセス 細胞-マトリックス接着 細胞外マトリックスの組織化 細胞接着 インテグリンを介したシグナル伝達経路 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 8515 213119 アンサンブル ENSG00000143127 ENSMUSG00000090210 ユニプロット O75578 該当なし RefSeq (mRNA) NM_001303040 NM_001303041 NM_003637 NM_001081053 NM_001302471 RefSeq（タンパク質） NP_001289969 NP_001289970 NP_003628 該当なし 場所（UCSC） 1 章: 145.89 – 145.91 Mb 3 章: 96.55 – 96.57 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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インテグリンα10はITGA10としても知られ、ヒトではITGA10遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6] [7]}

関数

インテグリンは、 α鎖とβ鎖からなる膜貫通タンパク質であり、細胞接着や細胞表面を介したシグナル伝達に関与することが知られています。α10を含むIドメインは、インテグリンβ1鎖（ITGB1 ）と結合して、軟骨組織で発現する新規なII型コラーゲン結合インテグリンを形成します。^[5]

関連する遺伝子の問題

• TAR症候群^[8]
• 1q21.1欠失症候群
• 1q21.1重複症候群

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000143127 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000090210 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. "Entrez Gene: ITGA10 インテグリン、アルファ 10".
6. Camper L, Hellman U, Lundgren-Akerlund E (1998年8月). 「軟骨細胞に発現するβ1関連コラーゲン結合インテグリン、インテグリンサブユニットα10の単離、クローニング、および配列解析」J. Biol. Chem . 273 (32): 20383–9 . doi : 10.1074/jbc.273.32.20383 . PMID  9685391.
7. Lehnert K, Ni J, Leung E, Gough S, Morris CM, Liu D, Wang SX, Langley R, Krissansen GW (1999). 「インテグリンα10サブユニット：発現パターン、部分的な遺伝子構造、および染色体局在」 . Cytogenet. Cell Genet . 87 ( 3–4 ): 238–44 . doi :10.1159/000015434. PMID  10702680. S2CID  85257405.
8. Klopocki E, Schulze H, Strauss G, et al. (2007年2月). 「血小板減少症・橈骨欠損症候群における微小欠失を伴う常染色体劣性遺伝に類似した複雑な遺伝パターン」Am. J. Hum. Genet . 80 (2): 232–40 . doi :10.1086/510919. PMC 1785342. PMID 17236129  . 

さらに読む

• Camper L, Hellman U, Lundgren-Akerlund E (1998). 「軟骨細胞に発現するβ1関連コラーゲン結合インテグリン、インテグリンサブユニットα10の単離、クローニング、および配列解析」J. Biol. Chem . 273 (32): 20383–9 . doi : 10.1074/jbc.273.32.20383 . PMID  9685391.
• Bengtsson T, Camper L, Schneller M, Lundgren-Akerlund E (2001). 「マウスインテグリンサブユニットα10遺伝子の特性解析とヒトホモログとの比較。ゲノム構造、染色体局在、およびスプライスバリアントの同定」Matrix Biol . 20 (8): 565–76 . doi :10.1016/S0945-053X(01)00164-0. PMID  11731273.
• Brakebusch C, Hirsch E, Potocnik A, Fässler R (1997). 「β1インテグリン機能の遺伝学的解析：重要な細胞接着分子ファミリーの確定、新規、そして改訂された役割」J. Cell Sci . 110 (23): 2895–904 . doi :10.1242/jcs.110.23.2895. PMID  9359872.
• Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al. (2003). 「分泌タンパク質発見イニシアチブ（SPDI）：新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質同定のための大規模取り組み：バイオインフォマティクスによる評価」Genome Res . 13 (10): 2265–70 . doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697.  PMID 12975309  .
• Lehnert K, Ni J, Leung E, et al. (1999). 「インテグリンα10サブユニット：発現パターン、部分的な遺伝子構造、および染色体局在」. Cytogenet. Cell Genet . 87 ( 3–4 ): 238–44 . doi :10.1159/000015434. PMID  10702680. S2CID  85257405.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Svoboda KK (1998). 「軟骨細胞-マトリックス接着複合体は生存と分化を媒介する」. Microsc. Res. Tech . 43 (2): 111– 22. doi : 10.1002/(SICI)1097-0029(19981015)43:2<111::AID-JEMT4>3.0.CO;2-O . PMID  9822998. S2CID  15611353.
• Bengtsson T, Aszodi A, Nicolae C, et al. (2005). 「α10β1インテグリン発現の喪失は成長板軟骨細胞の中等度機能不全を引き起こす」J. Cell Sci . 118 (Pt 5): 929–36 . doi : 10.1242/jcs.01678 . PMID  15713743.
• Wenke AK, Rothhammer T, Moser M, Bosserhoff AK (2006). 「転写因子AP-2εおよびEts-1による軟骨細胞におけるインテグリンα10の発現制御」Biochem. Biophys. Res. Commun . 345 (1): 495– 501. doi :10.1016/j.bbrc.2006.04.123. PMID  16684505.

外部リンク

• ITGA10 情報（Cell Migration Gateway へのリンク付き）2014年12月11日アーカイブ、Wayback Machine

この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。