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| コンテンツ | |
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| 説明 | インターフェロン 制御遺伝子のデータベース |
| 生物 | ホモ・サピエンス、 ハツカネズミ 、パン・トログロダイテス |
| 接触 | |
| 研究室 | ケンブリッジ大学モナッシュ医学研究所 |
| 主な引用 | シャミス・A・サマラジワ＆al. (2009) [1] |
| 発売日 | 2008 |
| アクセス | |
| Webサイト | http://www.interferome.org |
Interferome は、インターフェロン調節遺伝子(IRG)のオンライン バイオインフォマティクス データベースです。[1]これらのインターフェロン調節遺伝子は、インターフェロン刺激遺伝子 (ISG) とも呼ばれます。データベースには、タイプ I (IFN アルファ、ベータ)、タイプ II (IFN ガンマ)、タイプ III (IFN ラムダ) 調節遺伝子に関する情報が含まれており、定期的に更新されています。インターフェロンと サイトカインの研究コミュニティでは、分析ツールとしても情報リソースとしても使用されています[2]。インターフェロンは、50 年以上前に抗ウイルスタンパク質として特定されました。しかし、免疫調節、細胞増殖、炎症、その他の恒常性維持プロセスへの関与がそれ以来特定されています。これらのサイトカインは、慢性ウイルス感染症、癌、多発性硬化症など、多くの疾患の治療薬として使用されています[3]このインターフェロン調節遺伝子のデータベースは、ハイスループット実験と分子生物学データベースからの情報を統合し、インターフェロン生物学の詳細な理解を得るための試みです。
コンテンツ
Interferome は次のデータセットで構成されています。
- 30 を超える公開および社内のマイクロアレイとプロテオームのデータセットから手動でキュレーションされた、Homo sapiens、Mus musculus、Pan troglodytesのインターフェロン調節遺伝子の遺伝子発現データ。
ツール
Interferome は、データベースからデータを検索および取得するためのさまざまな方法を提供します。
- マイクロアレイデータでインターフェロンによって調節される遺伝子シグネチャを識別します。
- 遺伝子オントロジー分析と注釈;
- インターフェロン調節遺伝子の正常組織発現;
- インターフェロン調節遺伝子の調節解析
- BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) 解析およびオーソログ配列のダウンロード。
インターフェローム管理
インターフェロームは、モナシュ大学（モナシュ医学研究所とケンブリッジ大学）のチームによって管理されています。
参考文献
外部リンク
- インターフェローム
