国際微生物生態学会

国際微生物生態学会（ISME ）は、急成長を遂げている微生物生態学とその関連分野における主要な学術団体です。ISMEは非営利団体であり、「国際微生物生態学シンポジウム」を主催するとともに、シュプリンガー・ネイチャー（2016年のインパクトファクター9.6 - ロイター・トムソン）が発行するISMEジャーナルを所有しています。ISME事務局は、オランダのワーヘニンゲンにある オランダ生態学研究所（NIOO-KNAW ）にあります。

ISMEはSeqCodeを管理している。原核生物コードを管理する国際原核生物分類学委員会とは無関係である。[ 1 ]

目標

ISMEは、国際シンポジウムやワークショップの開催、出版物のスポンサーシップ、教育研究の推進を通じて、科学情報交換を促進しています。ISMEは、科学界だけでなく、より広範なコミュニティにもサービスを提供しています。ISMEは他の主要な科学団体と緊密に連携し、ISMEナショナル・アンバサダーを務める科学リーダーのネットワークを通じて、あらゆる地域で効果的な科学交流を確立しています。微生物生態学に関心のある方はどなたでもISMEの会員になることができます。

微生物生態学の歴史

自然環境における微生物の重要性は、19世紀後半の著名な微生物学者、とりわけM. ベイエリンクとS. ウィノグラツキーによって認識されていました。ウィノグラツキーは、洞察に満ちた講演「生命の一般循環における微生物の役割」（1897年）1）において、地球上の元素循環における微生物の中心的な役割を強調しました。環境中の微生物の多様性と微生物群集間の相互作用について論じながら、彼は物質循環の過程における様々な微生物の専門的な機能、そしてそれらが活動する群集における様々な機能グループの継承を指摘しました。しかし、ウィノグラツキーとベイエリンクの時代には、微生物をその場で識別・同定する唯一の手段は顕微鏡観察であり、群集における各微生物の役割の定量的な分析は、ほとんどの場合、達成されていませんでした。

20世紀、特に第二次世界大戦後、環境中の微生物の分離、計数、および分類の方法は大きく発展しました。数値分類法や化学分類法といった新しい分類法は、すぐに環境分離株の同定に応用されました。また、分画染色法や蛍光抗体法も、微生物のin situ観察に導入されました。環境中の微生物の増殖や活性の測定から、分離や特性評価に至るまで、さまざまな新しい技術が、トーマス・ロスウォール編集の「微生物生態学の研究における現代の方法」（1973年）にまとめられました。この本は、1972年にウプサラのスウェーデン農業科学大学で開催された会議に基づいており、正式なISMEに先立って開催されたこのシンポジウムは、 R .ゲレロがISME-63で発表したため、現在ではISME-0として知られています。

これらの新しい方法と技術は、土壌・水系微生物学、食品保存・発酵、医療微生物学など、様々な分野における微生物群集の解析に有効であることが実証されました。様々な分野で研究を行っていた微生物学者たちは、すぐに「微生物生態学」という統一概念に気づきました。T.ブロックの1964年の著書『微生物生態学の原理』は、様々な国における微生物生態学の発展に大きな影響を与えました。

歴史

微生物生態学の急速な拡大を背景に、1970年にメキシコシティで開催された第10回国際微生物学会議において、IAMS（国際微生物学会連合、1980年以降IUMSに名称変更）は、国際微生物生態学委員会（ICOME）を設立することを決定しました。ICOMEは翌年に発足しました。

ICOME設立に際して重視された役割の一つは、環境問題、水質・土壌汚染、そして人間活動による環境悪化への積極的な関与でした。しかし、メキシコ事件以降、委員会の関心は環境問題に限定されず、微生物生態学の中心テーマ、すなわち土壌・堆積物における元素循環、微生物と植物・動物、そして微生物同士の相互作用、環境要因が微生物の成長と活動に及ぼす影響へと広がっていきました。さらに、微生物の重要な役割は、土壌の形成と肥沃度、水供給、食品・飲料の発酵、食品保存、消化管と第一胃、さらには古代遺跡の腐敗に至るまで、多くの応用分野で研究を行う科学者によって認識されています。

第1回国際シンポジウム

微生物生態学の急速かつ広範な発展は、第1回国際微生物生態学シンポジウムの開催につながりました。参加者数は、ダニーデンでの第1回会議の30か国380人から、ウィーンで開催されたISME-11では65か国2,000人に増加しました。微生物生態学は、科学の世界で明確な地位を確立したと言えます。トピックの範囲も広がりました。中心的な理論的トピックに加えて、バイオレメディエーション、医療微生物学、食品、土壌、水微生物学などの応用分野のトピックがシンポジウムのトピックに入りました。消化管ミクロ生態学は、イーストランシングのISME-3のシンポジウムセッションで初めて登場し、発酵技術と腸内フローラに関するトピックはリュブリャナのISME-4、医療微生物学は京都のISME-5のシンポジウムで取り上げられました。これらのトピックは、その後のシンポジウムでも引き続き人気のトピックでした。

ICOMEは長らく非公式な活動を続け、主な活動は3年ごとの国際シンポジウムの開催でした。しかし、微生物生態学の進歩と発展はあまりにも急速かつ圧倒的であったため、IUMSとIUBSに所属する国際委員会であったICOMEの役割をさらに強化し、微生物生態学を基盤とした独立した国際機関を設立する必要に迫られました。

ISME設立

委員会から学会への移行には多くの障害がありました。しかし、1995年からICOMEの会長を務めたJ. Tiedje教授は、新しい学会の設立に積極的に取り組み、様々な国際機関やジャーナルの編集者・出版社と協議を行いました。彼は、ICOMEを国際微生物生態学会（ISME）に改称し、独自のジャーナルを発行することを提案しました。彼はICOMEの執行委員会にこの提案を検討・議論するよう依頼し、学会設立に必要な更なる手順を提示しました。彼の計画に基づき、執行委員会は学会とジャーナルの枠組み、すなわち活動範囲、編集委員会、ジャーナルの方針などを策定しました。

学会設立の提案は、1998年にカナダのハリファックスで開催されたISME-8で発表され、承認されました。ISMEの設立は、微生物生態学の将来の発展にとって明らかに重要な一歩であり、学会設立の長い過程において、ティエジェ教授のたゆまぬ努力と忍耐に深く感謝いたします。本学会は米国ミシガン州イーストランシングに設立・登記され、その後、ジュネーブに移転・登記事務所を開設しました。

一方、ティエジェ教授はジャーナル「Microbial Ecology」の出版社であるシュプリンガー社と協議を行いました。交渉の結果、「Microbial Ecology」は新たに設立された国際微生物生態学協会（ISME）に加盟することになり、出版社はISMEと協議の上、ジャーナルの編集者と編集委員会を任命しました。

ISMEシンポジウムの参加者数は増加の一途を辿り、2004年にカンクンで開催されたISME-10には2,000名が参加しました。様々な分野の微生物学者が生態学的概念に気づき、新たな手法が急速に発展しました。参加者数の増加、微生物生態学の急速な発展、そして次々と出現する現代的課題を考慮し、学会はISME-10以降、2年ごとにシンポジウムを開催することを決定しました。

ISMEシンポジウム

現在、2年ごとに開催されるISMEシンポジウムは、微生物生態学の幅広いトピックを扱う最大規模の国際会議です。

過去の会議
年 会議 位置 タイトル
2026 ISME-20 オークランド、ニュージーランド -
2024 ISME-19 ケープタウン、南アフリカ -
2022 ISME-18 ローザンヌ、スイス -
2018ISME-17ライプツィヒ、ドイツ微生物生態学における革新
2016ISME-16南カナダ、モントリオール微生物生態学
2014ISME-15ソウル、韓国微生物
2012ISME-14コペンハーゲン、デンマーク小さなものの力
2010ISME-13シアトル、米国微生物 - 変化する地球の守り手
2008ISME-12ケアンズ、オーストラリア青い惑星を維持する
2006ISME-11オーストリア、ウィーン隠れた力 ― 微生物群集の活動
2004ISME-10カンクン、メキシコ微生物惑星：地表から宇宙まで
2001ISME-09アムステルダム、オランダ微生物界における相互作用
1998ISME-08ハリファックス、カナダ微生物バイオシステム：新たなフロンティア
1995ISME-07サンパウロ、ブラジル微生物生態学の進歩
1992ISME-06バルセロナ、スペイン微生物生態学の動向
1989ISME-05京都、日本微生物生態学における最近の進歩
1986ISME-04リュブリャナ、スロベニア微生物生態学の展望
1983ISME-03イーストランシング、米国微生物生態学の最新展望
1980ISME-02ウォーリック、イギリス現代微生物生態学
1977ISME-01ダニーデン、ニュージーランド微生物生態学

ISMEジャーナル

2007年5月、国際微生物生態学会（ISME）とネイチャー・パブリッシング・グループ（NPG）は、新たな出版物「ISMEジャーナル」を創刊しました。2000年からISME会長を務めたコーエン教授は、後任のS. シェルバーグ教授とヒラリー・ラピン＝スコット教授と共に、このジャーナルの創刊に多大な尽力を行いました。このジャーナルはMedlineに完全索引付けされており、現在、すべてのコンテンツはPubMedでホストされています。

このジャーナルの現在（2015年）のインパクトファクターは9.3であり、ジャーナルの完全なタイトルである「The ISME Journal: Multidisciplinary Journal of Microbial Ecology」は、現代の微生物生態学の統合的な性質を反映しており、ジャーナルの目標と範囲はこれを明示しています。

このジャーナルの範囲内で特に興味深いトピックには、以下のものが含まれます。

  • I: 微生物集団と群集生態学
  • II: 微生物間および微生物と宿主間の相互作用
  • III: 進化遺伝学
  • IV: 微生物生態学における統合ゲノミクスとポストゲノミクスアプローチ
  • V: 微生物工学
  • VI: 地球微生物学と地球化学循環への微生物の貢献
  • VII: 自然生息地の微生物生態と機能的多様性
  • VIII: 微生物生態系への影響

参考文献

  1. ^ Hedlund BP, Chuvochina M, Hugenholtz P, Konstantinidis KT, Murray AE, Palmer M, Parks DH, Probst AJ, Reysenbach AL, Rodriguez-R LM, Rossello-Mora R, Sutcliffe IC, Venter SN, Whitman WB (2022年10月). 「SeqCode：配列データから記述された原核生物の命名コード」 . Nat Microbiol . 7 (10): 1702– 1708. doi : 10.1038/ s41564-022-01214-9 . PMC  9519449. PMID  36123442 .
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