膜内プロテアーゼ (IMP )は 膜内切断プロテアーゼ (I-CLiP )とも呼ばれ、内在性膜タンパク質 の膜貫通ドメインを 切断する性質を持つ酵素 です。[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] 既知の膜内プロテアーゼはすべて、複数の膜貫通ドメインを持つ内在性膜タンパク質であり、その活性部位は細胞膜 の脂質二重層 内に埋め込まれています。[ 4 ] 膜内プロテアーゼは、制御された膜内タンパク質分解 (RIP)として知られる細胞シグナル伝達 プロセスにおけるタンパク質分解切断を担っています。[ 1 ] [ 5 ]
膜内プロテアーゼは古典的な可溶性プロテアーゼ とは進化的に関連がなく、収斂進化 によって触媒部位 を進化させた。[ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]
膜内プロテアーゼは最近になって発見されたが、その主要な生物学的機能とヒトの疾患との関連性から、研究上の関心が高い。[ 5 ]
分類 膜内プロテアーゼには、触媒機構 によって区別される4つのグループがある。[ 5 ]
構造 膜内プロテアーゼは、複数の膜貫通 ヘリックス を有するポリトピック膜タンパク質 である。[ 5 ] [ 17 ] 活性部位 は膜貫通ヘリックス内に位置し、疎水性 脂質二重層 内に水性 環境を形成する。ほとんどの膜内プロテアーゼはモノマーとして機能すると考えられているが、プレセニリンは γ-セクレターゼタンパク 質複合体 中でのみ活性を示す。[ 17 ]
膜内プロテアーゼの4つのグループすべての例は、X線結晶構造解析 やクライオ電子顕微鏡 によって構造的に特徴付けられている。[ 17 ]
酵素活性 膜内プロテアーゼの4つのグループのうち3つは、膜貫通ドメイン 内で基質を切断し、切断可能な結合は 膜の内側にあります。残りのグループであるRce1 グルタミルプロテアーゼは、CAAXタンパク質 のC末端 を切断します。[ 17 ] 膜内プロテアーゼの反応速度論は 、一般に可溶性プロテアーゼよりも遅いです。[ 18 ] [ 19 ] 基質 特異性は十分に理解されておらず、酵素間で大きく異なりますが、特にγ-セクレターゼ複合体は、その基質の多様性で知られています。 [ 18 ] [ 20 ] ロンボイドプロテアーゼとγ-セクレターゼはどちらも、タンパク質複合 体を形成した後でのみ基質と非基質を区別するという珍しい基質認識機構を持つことが報告されており、これが遅い酵素反応速度論をもたらしています。[ 19 ]
分布 膜内プロテアーゼは生命の あらゆる領域に存在し、4つのグループすべてが広く分布している。[ 5 ] 真核生物 では、ペルオキシソームを 除くすべての膜結合 細胞小 器官に少なくとも1つの膜内プロテアーゼが存在する。[ 5 ]
発見 可溶性プロテアーゼは最も古く、最もよく特徴付けられた酵素の一つであるが、膜内プロテアーゼは比較的最近発見された。[ 21 ] [ 18 ] 膜内タンパク質分解は、1990年代にデニス・セルコー などのアルツハイマー病 の研究者によって、アミロイド前駆体タンパク質 の処理の可能性のあるメカニズムとして提案された。[ 22 ] 疎水性膜内で 加水分解 が起こる可能性は、当初は議論の的であった。[ 21 ] [ 18 ] 実験的に同定された最初の膜内プロテアーゼは、1997年のサイト2プロテアーゼであった。 [ 9 ]
参考文献 ^ a b Brown, MS; Ye, J; Rawson, RB; Goldstein, JL (2000年2月18日). 「制御された膜内タンパク質分解:細菌からヒトまで保存された制御機構」 . Cell . 100 (4): 391–8 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)80675-3 . PMID 10693756 . ^ Urban, S; Freeman, M (2002年10月). 「膜内タンパク質分解は進化を通じて多様なシグナル伝達経路を制御する」 Current Opinion in Genetics & Development . 12 (5): 512–8 . doi : 10.1016/s0959-437x(02)00334-9 . PMID 12200155 . ^ Wolfe, MS; Kopan, R (2004年8月20日). 「膜内タンパク質分解:テーマとバリエーション」. Science . 305 (5687): 1119–23 . Bibcode : 2004Sci...305.1119W . doi : 10.1126/science.1096187 . PMID 15326347 . ^ Erez, E; Fass, D; Bibi, E (2009年5月21日). 「膜内プロテアーゼはいかにして加水分解反応を膜内に埋め込むのか」. Nature . 459 (7245): 371–8 . Bibcode : 2009Natur.459..371E . doi : 10.1038/nature08146 . PMID 19458713 . ^ a b c d e f Kühnle, Nathalie; Dederer, Verena; Lemberg, Marius K. (2019年8月15日). 「膜内タンパク質分解の概要:シグナル伝達からタンパク質分解まで」 . Journal of Cell Science . 132 (16): jcs217745. doi : 10.1242/jcs.217745 . PMID 31416853 . ^ Koonin, EV; Makarova, KS; Rogozin, IB; Davidovic, L; Letellier, MC; Pellegrini, L (2003). 「菱形タンパク質:おそらく複数の古代の水平遺伝子移動によって進化した、ほぼ普遍的な膜内セリンプロテアーゼファミリー」 . Genome Biology . 4 (3): R19. doi : 10.1186 / gb-2003-4-3-r19 . PMC 153459. PMID 12620104 . ^ Lemberg, MK; Freeman, M. (2007年11月1日). 「菱形膜内プロテアーゼのゲノム解析強化による機能的・進化的意義」 . Genome Research . 17 (11): 1634–1646 . doi : 10.1101/gr.6425307 . PMC 2045146. PMID 17938163 . ^ Wolfe, MS (2009年 2月3日). 「膜内切断プロテアーゼ」 . Journal of Biological Chemistry . 284 (21): 13969– 13973. doi : 10.1074/jbc.R800039200 . PMC 2682844. PMID 19189971 . ^ a b ローソン、RB;ゼレンスキー、NG;ニジャワン、D;そう、J。酒井、J;モンタナ州ハサン。タイ州チャン;ミシシッピ州ブラウン。ゴールドスタイン、JL(1997年12月)。 「SREBPの膜内切断に必要とされる推定上のメタロプロテアーゼをコードする遺伝子であるS2Pの相補クローニング」 。 分子細胞 。 1 (1): 47–57 . 土井 : 10.1016/s1097-2765(00)80006-4 。 PMID 9659902 。 ^ Wolfe, MS; Xia, W; Ostaszewski, BL; Diehl, TS; Kimberly, WT; Selkoe, DJ (1999年4月8日). 「プレセニリン-1の2つの膜貫通アスパラギン酸はプレセニリンのエンドプロテオリシスとガンマセクレターゼ活性に必要」. Nature . 398 (6727): 513–7 . Bibcode : 1999Natur.398..513W . doi : 10.1038/19077 . PMID 10206644 . ^ ^ Weihofen, A; Binns, K; Lemberg, MK; Ashman, K; Martoglio, B (2002年6月21日). 「プレセニリン型アスパラギン酸プロテアーゼであるシグナルペプチドペプチダーゼの同定」. Science . 296 (5576): 2215–8 . Bibcode : 2002Sci...296.2215W . doi : 10.1126/science.1070925 . PMID 12077416 . ^ フリードマン、E;ハウベン、E;メイランド、K;シュリーガー、S;ヴルーデ、S;リヒテンターラー、SF; PH、クーン。シュタウファー、D;ロヴェッリ、G;マルトーリオ、B (2006 年 8 月)。 「SPPL2aおよびSPPL2bは、活性化樹状細胞におけるTNFαの膜内タンパク質分解を促進し、IL-12産生を誘発します。」 自然の細胞生物学 。 8 (8): 843– 8. 土井 : 10.1038/ncb1440 。 PMID 16829952 。 ^ Urban, S; Lee, JR; Freeman, M (2001年10月19日). 「Drosophila rhomboid-1は推定膜内セリンプロテアーゼファミリーを定義する」 . Cell . 107 (2): 173–82 . doi : 10.1016/s0092-8674(01)00525-6 . PMID 11672525 . ^ Hampton, Shahienaz E.; Dore, Timothy M.; Schmidt, Walter K. (2018年3月4日). 「Rce1:メカニズムと阻害」 . Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology . 53 (2): 157– 174. doi : 10.1080/10409238.2018.1431606 . PMC 5874806. PMID 29424242 . ^ マノラリディス、イオアニス;キラン、クルカルニ。ドッド、ロジャー B.小笠原 聡;張子国。ビネバ、ガンカ。オライリー、ニコラ。ハンラハン、サラ・J。トンプソン、アンドリュー・J.クローニン、ノラ。岩田宗;デビッド・バーフォード(2013年12月)。 「膜内プロテアーゼRce1によるファルネシル化CAAXタンパク質プロセシングのメカニズム」 。 自然 。 504 (7479): 301–305 。 ビブコード : 2013Natur.504..301M 。 土井 : 10.1038/nature12754 。 PMC 3864837 。 PMID 24291792 。 ^ a b c d Sun, Linfeng; Li, Xiaochun; Shi, Yigong (2016年4月). 「膜内プロテアーゼの構造生物学:ロンボイドプロテアーゼとS2Pからγセクレターゼまでのメカニズムの洞察」 Current Opinion in Structural Biology . 37 : 97– 107. doi : 10.1016/j.sbi.2015.12.008 . PMID 26811996 . ^ a b c d ビアード、ヘスター A.;マルタ、バルニオール・シコタ。ヤン、ジアン。フェルヘルスト、スティーブンHL(2019年11月15日)。 「膜内プロテアーゼの細胞における役割の発見」。 ACSケミカルバイオロジー 。 14 (11): 2372–2388 。 土井 : 10.1021/acschembio.9b00404 。 PMID 31287658 。 ^ a b サンダース、チャールズ・R; ハッチソン、ジェームズ・M (2018年8月). 「膜酵素の進化 を 形作る膜特性」 . Current Opinion in Structural Biology . 51 : 80–91 . doi : 10.1016/j.sbi.2018.03.013 . PMC 6158105. PMID 29597094 . ^ Güner G, Lichtenthaler SF (2020年9月). 「γ-セクレターゼ/プレセニリンの基質レパートリー」 . Seminars in Cell & Developmental Biology . 105 : 27–42 . doi : 10.1016/j.semcdb.2020.05.019 . PMID 32616437 . ^ a b Paschkowsky, Sandra; Hsiao, Jacqueline Melissa; Young, Jason C.; Munter, Lisa Marie (2019年6月). 「プロテアーゼの発見と膜内タンパク質分解」. 生化学と細胞生物学 . 97 (3): 265– 269. Bibcode : 2019BCB....97.0186P . doi : 10.1139/bcb-2018-0186 . PMID 30102867 . ^ Selkoe, Dennis J. (1996年8月). 「アミロイドβタンパク質とアルツハイマー病の遺伝学」 . Journal of Biological Chemistry . 271 (31): 18295– 18298. doi : 10.1074/jbc.271.31.18295 . PMID 8756120 .