アイザック・ウィリアムズ・ジュニア(1777年4月5日、コネチカット州リッチフィールド郡ゴーシェン- 1860年11月9日、ニューヨーク州オツェゴ郡クーパーズタウン)は、ニューヨーク州出身のアメリカ人政治家である。
彼は限られた教育を受け、1793年に父親と共にニューヨーク州オチゴ郡に移住した。1810年にオチゴ郡の副保安官に任命され、1811年には保安官に任命され、1813年までその職に就いた。
ウィリアムズは民主共和党員として、下院議員に選出されたウィリアム・ダウズ (1770–1813) の死去によって生じた空席を埋めるため、連邦党員ジョン・M・バウアーズの米国第13議会選挙に出馬し、当選、1814年1月24日から1815年3月3日までその職を務めた。ウィリアムズは再び米国第15議会に選出され、1817年3月4日から1819年3月3日までその職を務めた。その後、再び米国第18議会に選出され、1823年3月4日から1825年3月3日までその職を務めた。
彼はニューヨーク州オツェゴのウォーレン墓地に埋葬された。