イソペプチダーゼ

イソペプチダーゼは、ポリペプチド鎖の主鎖の外側に発生するイソペプチド結合またはアミド結合を加水分解するプロテアーゼ酵素です。

タンパク質分解において

イソペプチド結合は、タンパク質分解経路において、タンパク質のアミノ酸側鎖とユビキチンSUMOなどのタンパク質との結合において生じる。真核生物では、イソペプチダーゼ活性を持つ酵素がこの経路に関与することが多く、脱ユビキチン化酵素の5つのクラスすべてがイソペプチダーゼ活性を有する。[ 1 ]例としては、Ulp1ペプチダーゼ[ 2 ]USP5(旧称イソペプチダーゼT)が挙げられる。 [ 3 ] [ 4 ]

ラッソペプチド処理

イソペプチダーゼは、ラッソペプチドを発現する原核生物でも同定されています。ラッソペプチドとは、酸性アミノ酸とペプチドのN末端との間に主鎖以外の結合が存在し、結び目を形成することで形成された結び目構造を持つペプチドです。(一部のラッソペプチドは、ジスルフィド結合によってもたらされるトポロジカルな複雑さも持っています。)イソペプチダーゼ酵素は、イソペプチド結合を切断することでペプチドを線状化します。[ 5 ] [ 6 ]

参考文献

  1. ^サトー、ダニー D.;シクスマ、ティティア K. (2015 年 8 月)。 「DUB規制の層」。生化学科学の動向40 (8): 456–467土井: 10.1016/j.tibs.2015.05.002PMID  26073511
  2. ^ Li, Shyr-Jiann; Hochstrasser, Mark (2003年3月31日). 「Ulp1 SUMOイソペプチダーゼ」 . The Journal of Cell Biology . 160 (7): 1069–1082 . doi : 10.1083/jcb.200212052 . PMC 2172760. PMID 12654900 .  
  3. ^ Wilkinson, KD; Tashayev, VL; O'Connor, LB; Larsen, CN; Kasperek, E; Pickart, CM (1995年11月7日). 「ポリユビキチン分解シグナルの代謝:イソペプチダーゼTの構造、メカニズム、および役割」.生化学. 34 (44): 14535–46 . doi : 10.1021/bi00044a032 . PMID 7578059 . 
  4. ^ Clague, Michael J.; Heride, Claire; Urbé, Sylvie (2015年7月). 「ユビキチンシステムの人口統計」. Trends in Cell Biology . 25 (7): 417– 426. doi : 10.1016/j.tcb.2015.03.002 . PMID 25906909 . 
  5. ^ Maksimov, Mikhail O.; Link, A. James (2013年8月14日). 「Lassoペプチドを線状化するイソペプチダーゼの発見と特性評価」. Journal of the American Chemical Society . 135 (32): 12038– 12047. Bibcode : 2013JAChS.13512038M . doi : 10.1021/ja4054256 . PMID 23862624 . 
  6. ^ Hegemann, Julian D.; Zimmermann, Marcel; Xie, Xiulan; Marahiel, Mohamed A. (2015年7月21日). 「Lassoペプチド:細菌由来天然物の興味深い一群」. Accounts of Chemical Research . 48 (7): 1909– 1919. doi : 10.1021/acs.accounts.5b00156 . PMID 26079760 .