ジャズF1

ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
ジャズF1
識別子
エイリアスJAZF1、TIP27、ZNF802、JAZFジンクフィンガー1
外部IDオミム:606246; MGI : 2141450;ホモロジーン: 18291;ジーンカード:JAZF1; OMA :JAZF1 - オルソログ
オーソログ
人間ねずみ
エントレズ
アンサンブル
ユニプロット
RefSeq (mRNA)

NM_175061

NM_001168277
NM_173406

RefSeq(タンパク質)

NP_778231

NP_001161749
NP_775582

場所(UCSC)7章: 27.83 – 28.18 Mb6章: 52.75 – 53.05 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
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JAZF1(ジンクフィンガータンパク質1)は、 TAK1相互作用タンパク質27(TIP27)またはジンクフィンガータンパク質802(ZNF802)としても知られ、ヒトではJAZF1遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5] [6]変異体は、前立腺がんのリスク増加、 2型糖尿病のリスク増加、身長増加と関連しています。[7]

関数

この遺伝子は、3つのC 2 H 2ジンクフィンガーを持つ核タンパク質をコードし、転写抑制因子として機能する。この遺伝子に関連する染色体異常は、子宮内膜間質腫瘍と関連している。異なるタンパク質アイソフォームをコードする選択的スプライスバリアントが報告されているが、すべてのバリアントが完全に特徴付けられているわけではない[6] 。

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000153814 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000063568 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  5. ^ Adams MD, Soares MB, Kerlavage AR, Fields C, Venter JC (1993年11月). 「方向性クローン化されたヒト乳児脳cDNAライブラリーからの迅速cDNAシーケンシング(発現配列タグ)”. Nat Genet . 4 (4): 373–80 . doi :10.1038/ng0893-373. PMID  8401585. S2CID  12612300.
  6. ^ ab "Entrez Gene: JAZF1 JAZF ジンクフィンガー 1".
  7. ^ Manolio TA; Guttmacher, Alan E.; Manolio, Teri A. (2010年7月). 「ゲノムワイド関連研究と疾患リスク評価」. N Engl J Med . 363 (2): 166– 176. doi : 10.1056/NEJMra0905980 . PMID  20647212.

さらに読む

  • Koontz JI, Soreng AL, Nucci M, et al. (2001). 「子宮内膜間質腫瘍におけるJAZF1遺伝子とJJAZ1遺伝子の頻繁な融合」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (11): 6348–53 . Bibcode :2001PNAS...98.6348K. doi : 10.1073/pnas.101132598 . PMC  33471. PMID 11371647  .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR, et al. (2003). 「ヒト第7染色体:DNA配列と生物学」. Science . 300 (5620): 767–72 . Bibcode :2003Sci...300..767S. doi :10.1126/science.1083423. PMC 2882961.  PMID 12690205  .
  • 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Huang HY, Ladanyi M, Soslow RA (2004). 「古典的および変異型組織学的所見を有する子宮内膜間質腫瘍におけるJAZF1-JJAZ1遺伝子融合の分子生物学的検出:遺伝的異質性の証拠」Am. J. Surg. Pathol . 28 (2): 224– 32. doi :10.1097/00000478-200402000-00010. PMID  15043312. S2CID  21043514.
  • 中島 哲也、藤野 哲也、中西 剛 他(2004)。 「TIP27:核オーファン受容体TAK1/TR4の新規リプレッサー」。核酸研究32 (14): 4194–204土井:10.1093/nar/gkh741。PMC  514368PMID  15302918。
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクト:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)の現状、品質、そして拡大」Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928.  PMID 15489334  .
  • 木村 功、若松 明、鈴木 雄一、他 (2006). 「転写調節の多様化:ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特性解析」Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129.  PMID 16344560  .
  • Micci F, Panagopoulos I, Bjerkehagen B, Heim S (2006). 「子宮内膜間質肉腫における染色体バンド6p21の一貫した再配列と融合遺伝子JAZF1/PHF1およびEPC1/PHF1の生成」Cancer Res . 66 (1): 107–12 . doi : 10.1158/0008-5472.CAN-05-2485 . PMID  16397222.
  • Nucci MR, Harburger D, Koontz J, et al. (2007). 「子宮内膜間質腫瘍におけるRT-PCRおよび蛍光in situハイブリダイゼーションによるJAZF1-JJAZ1遺伝子融合の分子生物学的解析」Am. J. Surg. Pathol . 31 (1): 65– 70. doi :10.1097/01.pas.0000213327.86992.d1. PMID  17197920. S2CID  36622314.
  • Oliva E, de Leval L, Soslow RA, Herens C (2007). 「間期FISH法による平滑筋分化を伴う子宮内膜間質腫瘍におけるJAZF1-JJAZ1遺伝子融合の高頻度検出」Am. J. Surg. Pathol . 31 (8): 1277–84 . doi :10.1097/PAS.0b013e318031f012. PMID  17667554. S2CID  37204785.


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