ジョナサン・マルキーニ
ジョナサン・マルキーニ
生まれる
ジョナサン・ローレンス・マルキーニ
チチェスター
母校
受賞歴
科学者としてのキャリア
機関
論文脳画像の統計解析 （2002年）
博士課程の指導教員ブライアン・リプリー[ 2 ]
Webサイトjmarchini.org​

ジョナサン・ローレンス・マルキーニ（1973年5月19日生まれ）[ 3 ]は、ベイズ統計学者であり、オックスフォード大学統計学部の統計ゲノム学教授[ 4 ] 、オックスフォード大学サマービル・カレッジの統計学チュートリアルフェロー[ 5 ]、Gensci Ltd.の共同設立者兼取締役[ 6 ]である。彼はハプロタイプリファレンスコンソーシアムの共同リーダーである。[ 7 ]

教育

エクセター大学で純粋数学および数理統計学の理学士号（1991～1994年）を取得。[ 8 ]その後、ウェスト・サセックス高等教育機関で数学教育のPGCE（大学院博士課程修了証）を取得（1994～1995年）。オックスフォード大学統計学科でブライアン・リプリー教授の指導の下、博士号（DPhil）を取得（1998～2002年）。[ 9 ]

キャリアと研究

マルキーニは1995年9月から1998年9月までの3年間、タンザニアのイリンガ近郊にあるトサマガンガ中学校でVSOボランティアとしてAレベル数学を教える仕事をした。 [ 10 ]

2002年から2005年まで、ロン・カードン教授とピーター・ドネリー教授の指導の下、ウェルカム・トラストの数理生物学研修フェローシップを務めました。

2006年、オックスフォード大学統計学部の統計ゲノム学の講師（准教授）に任命され、マンスフィールド・カレッジの上級研究員も務めた。2007年にはオックスフォード大学ウェルカム・トラスト人類遺伝学センター[ 11 ]の提携グループリーダーに就任した。2010年に再任され、退職まで務めた[ 12 ]。

2015年に統計ゲノム学の教授に昇進した[ 13 ] [ 14 ]

マルキーニの研究は統計遺伝学と集団遺伝学に焦点を当てており、特にゲノムワイド関連研究のための手法開発に重点を置いています。彼はハプロタイプ推定、[ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ]遺伝子型補完、[ 19 ]アレイとシーケンシングからの遺伝子型呼び出し、RNA-seqデータセットのスパーステンソル分解、[ 20 ]集団構造、[ 21 ]表現型予測と混合モデル、[ 22 ]遺伝子間相互作用[ 23 ]および脳画像遺伝学に取り組んできました。[ 24 ]

彼は、国際ハップマッププロジェクト、ウェルカム・トラスト・ケースコントロール・コンソーシアム、1000ゲノムプロジェクト、UK10Kプロジェクトの解析チームのメンバーでした。彼の研究グループは、UKバイオバンク・データセットのハプロタイプ推定と遺伝子型補完を担当しました。彼はハプロタイプ・リファレンス・コンソーシアムの共同リーダーを務めています。[ 25 ]

彼は2014年から2018年までISIの高引用研究者であった[ 26 ]

彼は特許裁判の専門家証人として活動した[ 27 ]

受賞歴

2012年に彼は「集団遺伝学と医学遺伝学のための強力で独創的な新しい統計手法と、それに関連する高速計算アルゴリズムとソフトウェアを構築することで道を先導した」としてフィリップ・レバーヒューム賞[28]を受賞した。

参考文献

  1. ^ 「Leverhulmeウェブサイト」(PDF)。2018年4月2日時点のオリジナル(PDF)からアーカイブ。2018年4月1日閲覧。
  2. ^ Marchini, J.; Ripley, B. (2000) . 「機能的MRIにおける有意な活性化の検出に向けた新たな統計的アプローチ．分子進化」. NeuroImage . 12 (4): 366–80 . doi : 10.1006/nimg.2000.0628 . PMID 10988031. S2CID 54375337 .  
  3. ^ 「Companies House Record」。
  4. ^ 「Marchiniウェブサイト」。
  5. ^ 「サマービルのウェブサイト」。
  6. ^ 「Companies House Record」。
  7. ^ 「HRCウェブサイト」。
  8. ^ 「サマービル大学レポート」（PDF） .
  9. ^ Marchini, Jonathan L.; Ripley, Brian D. (2000年10月). 「機能的MRIにおける有意な活性化の検出に向けた新たな統計的アプローチ」NeuroImage . 12 (4): 366– 380. doi : 10.1006/nimg.2000.0628 . PMID 10988031 . S2CID 54375337 .  
  10. ^ 「フォトアルバム」 .
  11. ^ 「WTCHGウェブサイト」。
  12. ^ 「オックスフォード・ガゼットのリンク」。
  13. ^ 「Oxford Gazette link」 。 2015年9月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。2018年4月1日閲覧。
  14. ^ 「オックスフォード・ガゼットのリンク」。
  15. ^ O'Connell, Jared; Sharp, Kevin; Shrine, Nick; Wain, Louise ; Hall, Ian; Tobin, Martin; Zagury, Jean-Francois; Delaneau, Olivier; Marchini, Jonathan (2016年6月6日). 「バイオバンク規模のデータセットにおけるハプロタイプ推定」 . Nature Genetics . 48 (7): 817– 820. doi : 10.1038/ng.3583 . PMC 4926957. PMID 27270105 .  
  16. ^オコーネル、ジャレッド;グルダサニ、ディープティ。オリヴィエ・ドラノー;ピラストゥ、ニコラ。ウリヴィ、シーラ。コッカ、マッシミリアーノ。トラリア、ミケーラ;黄傑。ハフマン、ジェニファー E.ルダン、イゴール。ルース・マッキラン。フレイザー、ロス M.キャンベル、ハリー。ポラセク、オズレン。アシキ、ガーシム。エコル、ケネス。ヘイワード、キャロライン。ライト、アラン F.ヴィタルト、ヴェロニク。ナバロ、ポー;ザグリー、ジャン＝フランソワ。ウィルソン、ジェームス F.トニオーロ、ダニエラ。ガスパリーニ、パオロ。ソランゾ、ニコール。サンドゥ、マンジンダー S.マルキーニ、ジョナサン。グレッグ・ギブソン (2014 年 4 月 17 日) 「全血縁関係スペクトルにおけるハプロタイプフェージングのための一般的なアプローチ」 . PLOS Genetics . 10 (4) e1004234. doi : 10.1371/journal.pgen.1004234 . PMC 3990520. PMID 24743097 .  
  17. ^ Delaneau, Olivier; Howie, Bryan; Cox, Anthony J.; Zagury, Jean-François; Marchini, Jonathan (2013年10月). 「シーケンシングリードを用いたハプロタイプ推定」 . The American Journal of Human Genetics . 93 (4): 687– 696. Bibcode : 2013AmJHG..93..687D . doi : 10.1016/ j.ajhg.2013.09.002 . PMC 3791270. PMID 24094745 .  
  18. ^ Delaneau, Olivier; Zagury, Jean-Francois; Marchini, Jonathan (2013年1月1日). 「疾患および集団遺伝学研究のための改良型全染色体フェージング」. Nature Methods . 10 (1): 5–6 . Bibcode : 2013NatCB..10....5D . doi : 10.1038/nmeth.2307 . PMID 23269371. S2CID 205421216 .  
  19. ^ Howie, Bryan N.; Donnelly, Peter; Marchini, Jonathan; Schork, Nicholas J. (2009年6月19日). 「次世代ゲノムワイド関連研究のための柔軟かつ正確な遺伝子型補完法」 . PLOS Genetics . 5 (6) e1000529. doi : 10.1371/journal.pgen.1000529 . PMC 2689936. PMID 19543373 .  
  20. ^ Hore, Victoria; Viñuela, Ana; Buil, Alfonso; Knight, Julian; McCarthy, Mark I; Small, Kerrin; Marchini, Jonathan (2016年8月1日). 「複数組織遺伝子発現実験のためのテンソル分解」 . Nature Genetics . 48 (9): 1094–1100 . doi : 10.1038/ng.3624 . PMC 5010142. PMID 27479908 .  
  21. ^ Marchini, Jonathan; Cardon, Lon R; Phillips, Michael S; Donnelly, Peter (2004年3月28日). 「大規模遺伝的関連研究におけるヒト集団構造の影響」 . Nature Genetics . 36 (5): 512– 517. Bibcode : 2004NaGen..36..512M . doi : 10.1038/ng1337 . PMID 15052271 . 
  22. ^ Dahl, Andrew; Iotchkova, Valentina; Baud, Amelie; Johansson, Åsa; Gyllensten, Ulf; Soranzo, Nicole; Mott, Richard; Kranis, Andreas; Marchini, Jonathan (2016年2月22日). 「遺伝学研究のための多重表現型代入法」 . Nature Genetics . 48 (4): 466– 472. doi : 10.1038/ng.3513 . PMC 4817234. PMID 26901065 .  
  23. ^ Marchini, Jonathan; Donnelly, Peter; Cardon, Lon R (2005年3月27日). 「複雑な疾患に影響を与える複数の遺伝子座を検出するためのゲノムワイド戦略」Nature Genetics . 37 (4): 413– 417. doi : 10.1038/ng1537 . PMID 15793588 . S2CID 5922358 .  
  24. ^ロイド・T・エリオット;シャープ、ケビン。アルファロ アルマグロ、フィデル。シ、シナン。ミラー、カーラ。ドゥオー、グエナエル。マルキーニ、ジョナサン。スミス、スティーブン (2018)。 「英国バイオバンクにおける脳の構造と機能のゲノムワイド関連研究」。bioRxiv 10.1101/178806。 
  25. ^ 「HRCウェブサイト」。
  26. ^ 「ISI Highly Cited Researchers」 2025年10月7日。
  27. ^ 「イルミナ対プレマイサ」。
  28. ^ 「Leverhulmeウェブサイト」(PDF)。2018年4月2日時点のオリジナル(PDF)からアーカイブ。2018年4月1日閲覧。
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