ジュリアン・パークヒル

ジュリアン・パークヒル
FRS医学科学
2015年のパークヒル
生まれる（1964年9月23日）1964年9月23日[ 4 ]
リー・オン・シー[ 4 ]
教育ウェストクリフ男子高校
母校
知られているアルテミス[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
科学者としてのキャリア
フィールド
機関
論文Tn501の水銀耐性オペロンの転写制御 （1991）
Webサイトwww .vet .cam .ac .uk /スタッフ/professor-julian-parkhill-frs-fmedsci

ジュリアン・パークヒル（1964年生まれ）[ 4 ]は、ケンブリッジ大学のマークス＆スペンサー農場動物衛生、食品科学、食品安全教授[ 8 ]です。以前はウェルカム・サンガー研究所で病原体ゲノミクスの責任者を務めていました。[ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 1 ] [ 13 ] [ 14 ]

教育

パークヒルはウェストクリフ男子高校[ 4 ]、バーミンガム大学、ブリストル大学で教育を受け、 1991年に水銀耐性オペロンの転写制御に関する研究で博士号を取得した[ 15 ]。[ 2 ] [ 3 ] [ 16 ]

キャリアと研究

パークヒル研究所は、ハイスループットシーケンシングと表現型解析を用いて、病原体の多様性と変異、それらが毒性と伝染にどのように影響するか、そしてそれらが病原性の進化と宿主・病原体相互作用について何を教えてくれるかを研究している。[17] [18] [19] [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] [ 23 ] [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ] [ 27 ] [ 28 ] [ 29 ]パークヒル研究所の研究は、ウェルカムトラスト、バイオテクノロジー・生物科学研究会議（BBSRC ）[ 30 ]および医学研究会議（MRC）[ 31 ]から資金提供を受けている。

賞と栄誉

パークヒルは2009年に米国医学アカデミー（FMedSci）のフェロー に選出され、 [ 32 ] 2012年には米国微生物学会（FAAM）のフェローにも選出された。

ジュリアン・パークヒル博士は現在、ウェルカム・トラスト・サンガー研究所の病原体ゲノミクス部門の責任者を務めています。過去10年ほどにわたり、パークヒル博士の研究グループは、結核、ペスト、腸チフス、百日咳、ハンセン病、ボツリヌス中毒、ジフテリア、髄膜炎などの病原体、クロストリディオイデス・ディフィシルやMRSAなどの院内感染病原体、そしてカンピロバクター・ジェジュニ、サルモネラ・チフス菌、エルシニア・エンテロコリチカなどの食中毒病原体など、人類の健康にとって極めて重要な多くの細菌のゲノムを解析してきました。現在の研究は、ハイスループットシーケンシング技術の微生物学への応用に焦点を当てています。彼らは現在、広範囲に分布する細菌分離株の膨大なコレクションの配列解析を行っており、ゲノム変異と疫学、薬剤耐性の獲得、そして近年の進化との関連性を明らかにしています。さらに、地域および国の臨床微生物学グループと協力し、微生物配列解析を臨床および公衆衛生調査に応用するための基盤を構築しています。また、飽和トランスポゾン変異誘発、トランスクリプトミクス、ハイスループット表現型解析といった表現型調査にも配列解析技術を適用しています。彼らは特に、感染症が風土病となっている発展途上国のグループと幅広く協力しています。[ 33 ]

パークヒルは2014年に王立協会フェロー（FRS）に 選出され、[ 34 ]選出証明書には次のように記されている。

ジュリアン・パークヒルは、結核菌、ペスト菌、チフス菌など、多くの重要な細菌病原体のゲノム参照配列の決定に大きな役割を果たしてきました。各細菌が持つ遺伝子の完全なカタログを提供しただけでなく、パークヒルの研究は、細菌ゲノムがどのように進化するか、そして均質であると思われる細菌集団内での変異の影響について重要な洞察をもたらしました。同時に、ゲノムデータを理解および視覚化するためのツールが開発され、世界中に無料で配布されました。10年以上にわたり、パークヒルは細菌ゲノミクスの最前線に立ち、最近では新しいハイスループットシーケンシング技術を使用して細菌病原体の進化と伝播を調査し、これらのアプローチの臨床使用を可能にしました。[ 34 ]

参考文献

  1. ^ a b Google Scholarに索引付けされたジュリアン・パークヒルの出版物
  2. ^ a b Parkhill, J; Brown, NL (1990). 「Tn501のmerプロモーターオペレーター領域における部位特異的挿入および欠失変異体；19塩基対スペーサーはMerRによるプロモーターの正常な誘導に必須である」 . Nucleic Acids Research . 18 (17): 5157–62 . doi : 10.1093 / nar/18.17.5157 . PMC  332137. PMID  2169606 .
  3. ^ a b Brown, NL; Camakaris, J; Lee, BT; Williams, T; Morby, AP; Parkhill, J; Rouch, DA (1991). 「細菌の水銀および銅に対する耐性」. Journal of Cellular Biochemistry . 46 (2): 106–14 . doi : 10.1002 / jcb.240460204 . PMID 1717500. S2CID 40277026 .  
  4. ^ a b c d Anon (2015). 「パークヒル教授 ジュリアン」 . Who's Who (オックスフォード大学出版 局オンライン版). A & C Black. doi : 10.1093/ww/9780199540884.013.U281946 .(定期購読または英国の公共図書館の会員登録が必要です。)
  5. ^ Rutherford, K.; Parkhill, J.; Crook, J.; Horsnell, T.; Rice, P.; Rajandream, M.-A.; Barrell, B. (2000). 「Artemis：配列の可視化とアノテーション」 .バイオインフォマティクス. 16 (10): 944–5 . doi : 10.1093/bioinformatics/16.10.944 . PMID 11120685 . 
  6. ^ Carver, T; Berriman, M; Tivey, A; Patel, C; Böhme, U; Barrell, BG; Parkhill, J; Rajandream, MA (2008). 「ArtemisとACT：リレーショナルデータベースに格納された配列の表示、注釈付け、比較」 .バイオインフォマティクス. 24 (23): 2672–6 . doi : 10.1093/bioinformatics/btn529 . PMC 2606163. PMID 18845581 .  
  7. ^ Carver, T.; Harris, SR; Berriman, M.; Parkhill, J.; McQuillan, JA (2011). 「Artemis: ハイスループットなシーケンスベース実験データの可視化と解析のための統合プラットフォーム」 .バイオインフォマティクス. 28 (4): 464– 469. doi : 10.1093/bioinformatics/btr703 . PMC 3278759. PMID 22199388 .  
  8. ^ 「ジュリアン・パークヒル教授」 www.vet.cam.ac.uk 2021年6月4日. 2025年12月1日閲覧。
  9. ^ 「Professor Julian Parkhill, FRS, FMedSci, Senior Group Leader」 。2016年3月15日時点のオリジナルよりアーカイブ。
  10. ^ Parkhill, J. (2013). 「ハイスループットシーケンシングはこれまで何をもたらしたのか？」Nature Reviews Microbiology . 11 (10): 664–5 . doi : 10.1038/nrmicro3112 . PMID 23979431. S2CID 28613490 .  
  11. ^ Microsoft Academicに索引付けされたJulian Parkhill の出版物
  12. ^ DBLP書誌サーバーのJulian Parkhill
  13. ^ 57212237926 ジュリアン・パークヒルの出版物はScopus書誌データベースに索引付けされています。 （購読が必要です）
  14. ^ジュリアン・パークヒル教授がロンドンのウェルカム・コレクションを訪れ、 YouTubeでゲノムの背後にある科学を解明する
  15. ^ Parkhill, Julian (1991). Tn501の水銀耐性オペロンの転写制御（博士論文）. ブリストル大学. OCLC 931563576. ProQuest 301408708 .  （サブスクリプションが必要です）
  16. ^ Holden, MTG; Feil, E.; Lindsay, J.; Peacock, S.; Day, N.; Enright, M.; Foster, T.; Moore, C.; Hurst, L .; Atkin, R.; Barron, A.; Bason, N.; Bentley, SD; Chillingworth, C.; Chillingworth, T.; Churcher, C.; Clark, L.; Corton, C.; Cronin, A.; Doggett, J.; Dowd, L.; Feltwell, T.; Hance, Z.; Harris, B.; Hauser, H.; Holroyd, S.; Jagels, K.; James, KD; Lennard, N.; Line, A. (2004). 「臨床的に検出される2種類の黄色ブドウ球菌株の完全ゲノム：毒性と薬剤耐性の急速な進化の証拠」 .米国科学アカデミー紀要. 101 (26): 9786– 9791. Bibcode : 2004PNAS..101.9786H . doi : 10.1073 / pnas.0402521101 . PMC 470752. PMID 15213324 .  オープンアクセスアイコン
  17. ^ Parkhill, J ; Birney, E ; Kersey, P (2010). 「ゲノム情報インフラの洪水後」 . Genome Biology . 11 (7): 402. doi : 10.1186/gb-2010-11-7-402 . PMC 2926780. PMID 20670392 .  
  18. ^ Cole, ST; Brosch, R.; Parkhill, J.; Garnier, T.; Churcher, C.; Harris, D.; Gordon, SV; Eiglmeier, K.; Gas, S.; Barry, CE; Tekaia, F.; Badcock, K.; Basham, D.; Brown, D.; Chillingworth, T.; Connor, R.; Davies, R.; Devlin, K.; Feltwell, T.; Gentles, S.; Hamlin, N.; Holroyd, S.; Hornsby, T.; Jagels, K.; Krogh, A.; McLean, J.; Moule, S.; Murphy, L.; Oliver, K.; et al. (1998). 「完全ゲノム配列からMycobacterium tuberculosisの生物学を解読する」Nature . 393 (6685): 537– 44. Bibcode : 1998Natur.393..537C . doi : 10.1038/31159 . PMID 9634230 . 
  19. ^ Bentley, SD; Chater, KF; Cerdeño-Tárraga, A. -M.; Challis, GL; Thomson, NR; James, KD; Harris, DE; Quail, MA; Kieser, H.; Harper, D.; Bateman, A.; Brown, S.; Chandra, G.; Chen, CW; Collins, M.; Cronin, A.; Fraser, A.; Goble, A.; Hidalgo, J.; Hornsby, T.; Howarth, S.; Huang, C. -H.; Kieser, T.; Larke, L.; Murphy, L.; Oliver, K.; O'Neil, S.; Rabbinowitsch, E.; Rajandream, M. -A.; et al. (2002). 「モデル放線菌ストレプトマイセス・コエリカラーA3(2)の完全ゲノム配列」 . Nature . 417 ( 6885): 141–7 . Bibcode : 2002Natur.417..141B . doi : 10.1038/417141a . PMID 12000953. S2CID 4430218 .  
  20. ^秦、J.;リー、Ｒ．レイズ、J.アルムガム、M.カンザス州ブルクドルフ。マニチャン、C.ニールセン、T.ポンズ、N.レベネズ、F.山田 哲也;メンデ、DR;リー、J。徐、J。リー、S。リー、D。カオ、J.ワン、B.リャン、Ｈ．鄭、H.謝、Y。タップ、J。ルパージュ、P.ベルタラン、M.バトー、JM。ハンセン、T.ル・パスリエ、D.リンネバーグ、A.ニールセン、HBR;ペルティエ、E.ルノー、P. (2010)。「メタゲノム配列決定によって確立されたヒト腸内微生物遺伝子カタログ」。自然。464 (7285): 59– 65. Bibcode : 2010Natur.464...59. . doi : 10.1038/nature08821 . PMC 3779803 . PMID 20203603 .  
  21. ^ Parkhill, J.; Wren, BW; Mungall, K.; Ketley, JM; Churcher, C.; Basham, D.; Chillingworth, T.; Davies, RM; Feltwell, T.; Holroyd, S.; Jagels, K.; Karlyshev, AV; Moule, S.; Pallen, MJ; Penn, CW; Quail, MA; Rajandream, MA; Rutherford, KM; Van Vliet, AHM; Whitehead, S.; Barrell, BG (2000). 「食品媒介病原菌Campylobacter jejuniのゲノム配列は、非常に可変性の高い配列を明らかにする」 Nature . 403 ( 6770): 665–8 . Bibcode : 2000Natur.403..665P . doi : 10.1038/35001088 . PMID 10688204 . 
  22. ^ Cole, ST; Eiglmeier, K.; Parkhill, J.; James, KD; Thomson, NR; Wheeler, PR; Honoré, N.; Garnier, T.; Churcher, C.; Harris, D.; Mungall, K.; Basham, D.; Brown, D.; Chillingworth, T.; Connor, R.; Davies, RM; Devlin, K.; Duthoy, S.; Feltwell, T.; Fraser, A.; Hamlin, N.; Holroyd, S.; Hornsby, T.; Jagels, K.; Lacroix, C.; MacLean, J.; Moule, S.; Murphy, L.; Oliver, K.; Quail, MA (2001). 「ハンセン病菌における大規模な遺伝子崩壊」. Nature . 409 (6823): 1007– 1011. Bibcode : 2001Natur.409.1007C . doi : 10.1038/35059006 . PMID 11234002 . S2CID 4307207 .  
  23. ^ Parkhill, J. ; Wren, BW; Thomson, NR; Titball, RW; Holden, MTG; Prentice, MB; Sebaihia, M.; James, KD; Churcher, C.; Mungall, KL; Baker, S.; Basham, D.; Bentley, SD; Brooks, K.; Cerdeño-Tárraga, AM; Chillingworth, T.; Cronin, A.; Davies, RM; Davis, P.; Dougan, G.; Feltwell, T.; Hamlin, N.; Holroyd, S.; Jagels, K.; Karlyshev, AV; Leather, S.; Moule, S.; Oyston, PCF; Quail, M.; et al. (2001). 「ペストの原因菌であるペスト菌のゲノム配列」Nature . 413 (6855): 523– 7. Bibcode : 2001Natur.413..523P . doi : 10.1038/35097083 . PMID 11586360 . 
  24. ^ Parkhill, J. ; Dougan, G. ; James, KD; Thomson, NR; Pickard, D.; Wain, J.; Churcher, C.; Mungall, KL; Bentley, SD; Holden, MTG; Sebaihia, M.; Baker, S.; Basham, D.; Brooks, K.; Chillingworth, T.; Connerton, P.; Cronin, A.; Davis, P.; Davies, RM; Dowd, L.; White, N.; Farrar, J.; Feltwell, T.; Hamlin, N.; Haque, A.; Hien, TT; Holroyd, S.; Jagels, K.; Krogh, A.; et al. (2001). 「多剤耐性サルモネラ・エンテリカ血清型チフス菌CT18の完全ゲノム配列」Nature . 413 (6858): 848– 52. Bibcode : 2001Natur.413..848P . doi : 10.1038/35101607 . PMID 11677608 . 
  25. ^ Parkhill, J. ; Achtman, M. ; James, KD; Bentley, SD; Churcher, C.; Klee, SR; Morelli, G.; Basham, D.; Brown, D.; Chillingworth, T.; Davies, RM; Davis, P.; Devlin, K.; Feltwell, T.; Hamlin, N.; Holroyd, S.; Jagels, K.; Leather, S.; Moule, S.; Mungall, K.; Quail, MA; Rajandream, M. -A.; Rutherford, KM; Simmonds, M.; Skelton, J.; Whitehead, S.; Spratt, BG; Barrell, BG (2000). 「髄膜炎菌Z2491の血清群a株の完全DNA配列」Nature . 404 (6777): 502– 6. Bibcode : 2000Natur.404..502P . doi : 10.1038/35006655 . PMID 10761919 . S2CID 4430718 .  
  26. ^ Parkhill, J.; Wren, BW (2011). 「細菌疫学と生物学 - ゲノムシーケンシングからの教訓」 .ゲノム生物学. 12 (10): 230. doi : 10.1186/gb-2011-12-10-230 . PMC 3333767. PMID 22027015 .  
  27. ^ Garnier, T.; Eiglmeier, K.; Camus, J. -C.; Medina, N.; Mansoor, H.; Pryor, M.; Duthoy, S.; Grondin, S.; Lacroix, C.; Monsempe, C.; Simon, S.; Harris, B.; Atkin, R.; Doggett, J.; Mayes, R.; Keating, L.; Wheeler, PR; Parkhill, J.; Barrell, BG; Cole, ST; Gordon, SV; Hewinson, RG (2003). 「Mycobacterium bovisの完全ゲノム配列」．米国科学アカデミー紀要．100 ( 13): 7877–82．Bibcode : 2003PNAS..100.7877G．doi : 10.1073/pnas.1130426100 . PMC 164681 . PMID 12788972 .  
  28. ^ Parkhill, J. ; Sebaihia, M.; Preston, A.; Murphy, LD; Thomson, N.; Harris, DE; Holden, MTG; Churcher, CM; Bentley, SD; Mungall, KL; Cerdeño-Tárraga, AM; Temple, L.; James, K.; Harris, B.; Quail, MA; Achtman, M. ; Atkin, R.; Baker, S.; Basham, D.; Bason, N.; Cherevach, I.; Chillingworth, T.; Collins, M.; Cronin, A.; Davis, P.; Doggett, J.; Feltwell, T.; Goble, A.; Hamlin, N.; et al. (2003). 「百日咳菌、パラ百日咳菌、および気管支敗血症菌のゲノム配列の比較解析」ネイチャージェネティクス. 35 (1): 32– 40. doi : 10.1038/ng1227 . PMID 12910271 . 
  29. ^ Field, D.; Garrity, G.; Gray, T.; Morrison, N.; Selengut, J.; Sterk, P.; Tatusova, T.; Thomson, N.; Allen, MJ; Angiuoli, SV; Ashburner, M.; Axelrod, N.; Baldauf, S.; Ballard, S.; Boore, J.; Cochrane, G.; Cole, J.; Dawyndt, P.; De Vos, P.; Depamphilis, C.; Edwards, R.; Faruque, N.; Feldman, R.; Gilbert, J.; Gilna, P.; Glöckner, FO; Goldstein, P.; Guralnick, R.; Haft, D.; et al. (2008). 「ゲノム配列に関する最小情報（MIGS）仕様」Nature Biotechnology . 26 (5 ) : 541–7 . doi : 10.1038/nbt1360 . PMC 2409278. PMID 18464787 .  
  30. ^ Anon (2014). 「BBSRCによるジュリアン・パークヒルへの助成金」 BBSRC. 2016年3月4日時点のオリジナルよりアーカイブ。
  31. ^ Anon (2014). 「英国政府助成金がジュリアン・パーヒルに授与」スウィンドン：英国研究評議会。 2015年4月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。
  32. ^ “Fellow | Academy of Medical Sciences” . Acmedsci.ac.uk . 2016年11月18日時点のオリジナルよりアーカイブ。2016年11月18日閲覧。
  33. ^ "Julian Parkhill" . Academy.asm.org . 2016年2月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。2016年11月18日閲覧。
  34. ^ a b Anon (2014). 「Professor Julian Parkhill FMedSci FRS」ロンドン: Royal Society . 2015年11月17日時点のオリジナルよりアーカイブ。前述の文の 1 つ以上には、royalsociety.org Web サイトのテキストが組み込まれています。

    「フェロープロフィールページの『経歴』という見出しの下に公開されているすべてのテキストは、クリエイティブ・コモンズ表示4.0国際ライセンスの下で利用可能です。」―― 「王立協会規約、条件、および方針」。2015年9月25日時点のオリジナルからアーカイブ。 2016年3月9日閲覧。{{cite web}}: CS1 maint: bot: 元のURLステータス不明（リンク）

ロゴ
Scholia にはJulian Parkhillの著者プロフィールがあります。
「 https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Julian_Parkhill&oldid=1327781910」より取得