ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
KCNIP4 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス KCNIP4 、CALP、KCHIP4、カリウム電位依存性チャネル相互作用タンパク質4 外部ID オミム ：608182; MGI : 1933131; ホモロジーン : 23528; ジーンカード ：KCNIP4; OMA :KCNIP4 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） キリスト 5番染色体（マウス） [2] バンド 5|5 B3 始める 48,389,502 bp [2] 終わり 49,524,907 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） 上位の表現 視床の外側核群 中側頭回 橋 小脳虫部 ブロードマン野23 上前頭回 頭頂葉 上前庭神経核 中心後回 腹側被蓋野
上位の表現 内側背側核 小脳葉 内側膝状体 小脳虫部 内側前庭核 外側膝状体 腹側被蓋野 視索上核 乳頭体 上丘
より多くの参照表現データ
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
カルシウムイオン結合 カリウムチャネル調節活性 カリウムチャネル活性 電位依存性イオンチャネル活性 金属イオン結合 タンパク質結合 細胞成分
細胞質 細胞質 電位依存性カリウムチャネル複合体 細胞膜 小胞体 膜 生物学的プロセス
カリウムイオン輸送 イオン膜輸送の調節 タンパク質の細胞膜への局在 イオン輸送 カリウムイオン膜輸送の調節 カリウムイオン膜輸送 心臓伝導 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ENSG00000185774 ENSG00000281758
ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001035003 NM_001035004 NM_025221 NM_147181 NM_147182 NM_147183 NM_001363504
NM_001199242 NM_001199243 NM_001199244 NM_001199245 NM_030265
RefSeq（タンパク質） NP_001030175 NP_001030176 NP_079497 NP_671710 NP_671711 NP_671712 NP_001350433
NP_001186171 NP_001186172 NP_001186173 NP_001186174 NP_084541
場所（UCSC） 4章: 20.73 – 21.95 Mb 5章: 48.39 – 49.52 MB PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
Kvチャネル相互作用タンパク質4 は、 ヒトでは KCNIP4 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6] [7]
この遺伝子は、EFハンドスーパーファミリーのリカバリンブランチに属する電位依存性カリウム（Kv）チャネル相互作用タンパク質（KCNIP）ファミリーのメンバーをコードしています。 [8] KCNIPファミリーのメンバーは、小さなカルシウム結合タンパク質です。いずれもEFハンド様ドメインを持ち、 N末端 が互いに異なります 。これらは、ネイティブKv4チャネル複合体の不可欠なサブユニット構成要素です。細胞内カルシウムの変化に応じて、A型電流、ひいては神経細胞の興奮性を制御すると考えられます。このタンパク質メンバーはプレセニリンとも相互作用します。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする複数の選択的スプライシング転写バリアントが同定されています。 [7]
相互作用 KCNIP4はPSEN2 と 相互作用する ことが示されている 。 [6]
参照
参考文献
^ abc ENSG00000281758 GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000185774, ENSG00000281758 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000029088 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ Holmqvist MH, Cao J, Hernandez-Pineda R, Jacobson MD, Carroll KI, Sung MA, Betty M, Ge P, Gilbride KJ, Brown ME, Jurman ME, Lawson D, Silos-Santiago I, Xie Y, Covarrubias M, Rhodes KJ, Distefano PS, An WF (2002年1月). 「補助サブユニットドメインによるKv4 A型カリウムチャネルの急速不活性化の除去」. Proc Natl Acad Sci USA . 99 (2): 1035–40 . Bibcode :2002PNAS...99.1035H. doi : 10.1073/pnas.022509299 . PMC 117799. PMID 11805342 . ^ ab 諸橋雄三、波多野暢、大谷聡、滝川亮、綿引剛、高杉尚志、今泉雄三、富田孝之、岩坪毅 (2002年4月). 「プレセニリン2および電位依存性カリウムチャネルサブユニットKv4と相互作用する新規EFハンドタンパク質CALP/KChIP4の分子クローニングと特性解析」 J Biol Chem . 277 (17): 14965– 75. doi : 10.1074/jbc.M200897200 . PMID 11847232. ^ ab "Entrez Gene: KCNIP4 Kvチャネル相互作用タンパク質4". ^ Burgoyne RD (2007). 「神経カルシウムセンサータンパク質：神経Ca2+シグナル伝達における多様性の創出」 Nat. Rev. Neurosci . 8 (3): 182– 193. doi :10.1038/nrn2093. PMC 1887812. PMID 17311005 .
さらに読む
Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 . Lin YL, Lin SR, Wu TT, Chang LS (2004). 「KChIPタンパク質とタイワンコブラ心臓毒との分子間相互作用を示す証拠」 Biochem. Biophys. Res. Commun . 319 (3): 720–4 . doi :10.1016/j.bbrc.2004.05.064. PMID 15184042. Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 . Hillier LW; Graves TA; Fulton RS; et al. (2005). 「ヒト第2染色体および第4染色体のDNA配列の生成とアノテーション」. Nature . 434 (7034): 724–31 . Bibcode :2005Natur.434..724H. doi : 10.1038/nature03466 . PMID 15815621. Pruunsild P, Timmusk T (2005). 「ヒトおよびマウスKCNIP遺伝子ファミリーの構造、選択的スプライシング、および発現」. Genomics . 86 (5): 581–93 . doi :10.1016/j.ygeno.2005.07.001. PMID 16112838. Chen CP, Lee L, Chang LS (2007). 「ヒトKvチャネル相互作用タンパク質の金属結合特性が分子構造およびKv4.2チャネルとの結合に及ぼす影響」. Protein J. 25 ( 5): 345–51 . doi :10.1007/s10930-006-9020-9. PMID 16951992. S2CID 43400673. Ewing RM; Chu P; Elisma F; et al. (2007). 「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」 Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 . Bonne A; Vreede L; Kuiper RP; et al. (2008). 「腎細胞癌患者における構成的転座切断点のマッピング：候補遺伝子としてのKCNIP4の同定」. Cancer Genet. Cytogenet . 179 (1): 11– 8. doi :10.1016/j.cancergencyto.2007.07.005. PMID 17981209.
外部リンク 米国国立医学図書館の 医学主題標目表 （MeSH）におけるKCNIP4+タンパク質、+ヒト この記事には、 パブリック ドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
