KDM6B
| KDM6B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | KDM6B、JMJD3、リジンデメチラーゼ6B、NEDCFSA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム: 611577 ; MGI : 2448492 ;ホモロジーン: 18945 ;ジーンカード: KDM6B ; OMA : KDM6B - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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リジン脱メチル化酵素6Bは、ヒトではKDM6B（JMJD3）遺伝子によってコードされるタンパク質である。[ 5 ]
分化中の制御
KDM6Bはマウス胚性幹細胞の心臓および内皮分化中に発現が増加することが判明した。[ 6 ]
小分子阻害
マクロファージにおける炎症誘発反応を調節するために、 KDM6ヒストン脱メチル化酵素ファミリーの十文字ドメインを阻害する低分子阻害剤（GSK-J1）が開発されている。[ 7 ]
病理学における役割
KDM6B遺伝子の変異は、粗い顔貌と軽度の遠位骨格異常を伴う神経発達障害を引き起こす可能性があり、これは2019年にストーラーマンらによって初めて報告された[ 8 ] 。
標準的な実験室でのエクソーム配列解析を使用して、KDM6B 遺伝子変異を識別できます。
臨床像
2019年に行われたKDM6B変異による症状に関する 研究[ 8 ]では、以下のことが報告されています。
- 言語および運動発達の遅れ
- 顔貌異常には、粗い顔立ち、突出した額、広い口、大きく突き出た耳、丸顔、突顎、内眼角質などが含まれる。
- 手や指がやや広く厚くなり、関節可動性亢進、第5指の斜指症、および足指の合指症などの筋骨格の特徴
- 神経筋低緊張症
- 知的障害
- 自閉症スペクトラム障害
さらに2023年に行われた国際研究[ 9 ] では、病原性KDM6B変異を持つ個人における以下の臨床的特徴が報告された。
| 機能名 | p値 | 合計 ％ |
|---|---|---|
| 男性 | 0.50 | 73% |
| 出生体重の増加 [>2 SD] | 0.33 | 17% |
| 体重増加 [>2 SD] | 0.59 | 14% |
| 身長が高い [>2 SD] | 1.0 | 8% |
| 大頭症[>2 SD] | 1.0 | 26% |
| 過成長症候群の少なくとも1つの特徴 | 1.0 | 30% |
| 言語発達の遅れ | 0.15 | 94% |
| モーターの遅延 | 1.0 | 89% |
| 知的障害 | 0.14 | 63% |
| 自閉症スペクトラム（ASD） | 0.51 | 61% |
| 行動障害、非ASD | 0.70 | 60% |
| 精神病性障害 [12歳以上] | 1.0 | 20% |
| 発作 | 0.58 | 13% |
| 睡眠障害 | 0.09 | 32% |
| 運動障害／歩行障害／筋緊張亢進／運動失調 | 0.67 | 24% |
| 低血圧 | 1.0 | 57% |
| 新生児の摂食困難または胃食道逆流症 | 1.0 | 51% |
| 便秘 | 1.0 | 18% |
| 先天性心疾患 | 0.58 | 13% |
| 口唇裂／口蓋裂／口蓋垂裂 | 0.03b | 4% |
| 泌尿生殖器系の異常 | 1.0 | 10% |
| 関節過可動性 | 1.0 | 42% |
| 側弯症／後弯症／前弯症 | 0.58 | 13% |
| 合指症 | 0.15 | 9% |
| 短い指または足指 | 1.0 | 9% |
| 広い指/指先/手/つま先/足 | 1.0 | 20% |
| 近視/弱視 | 0.08 | 33% |
| 斜視 | 0.58 | 13% |
| 難聴 | 1.0 | 2% |
| 再発性耳感染症 | 1.0 | 12% |
疫学
知的障害および/または発達遅延を報告する患者のうち、約 0.12% に KDM6B 遺伝子の新たな変異が見られます。
関連する症状
歌舞伎症候群に関連するKDM6Aと KDM6B 変異体の患者に見られる重複する表現型の特徴としては、突出した耳、異常な歯列、先天性心疾患、摂食障害、停留精巣、関節過剰可動性、発達遅延、筋緊張低下、行動障害などがあります。
進行中の研究
2022年に発表された研究によると、脳葉酸欠乏症の患者5名でKDM6Bの病的変異が発見された。[ 10 ]
参考文献
- ^ a b c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000132510 – Ensembl、2017年5月
- ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000018476 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「Entrez Gene: Lysine demethylase 6B」。2016年4月9日閲覧。
- ^ Boeckel JN, Derlet A, Glaser SF, Luczak A, Lucas T, Heumüller AW, et al. (2016年7月). 「JMJD8は内皮細胞においてピルビン酸キナーゼM2と相互作用することで血管新生の芽生えと細胞代謝を制御する」 .動脈硬化・血栓症・血管生物学. 36 (7): 1425– 1433. doi : 10.1161/ATVBAHA.116.307695 . PMID 27199445 .
- ^ Kruidenier L, Chung CW, Cheng Z, Liddle J, Che K, Joberty G, et al. (2012年8月). 「選択的jumonji H3K27脱メチル化酵素阻害剤は炎症誘発性マクロファージ反応を調節する」 . Nature . 488 ( 7411): 404– 408. Bibcode : 2012Natur.488..404K . doi : 10.1038/nature11262 . PMC 4691848. PMID 22842901 .
- ^ a b Stolerman ES, Francisco E, Stallworth JL, Jones JR, Monaghan KG, Keller-Ramey J, et al. (2019年7月). 「KDM6B遺伝子の遺伝子変異は神経発達遅延および異形性特徴と関連している」. American Journal of Medical Genetics. Part A. 179 ( 7): 1276– 1286. doi : 10.1002 / ajmg.a.61173 . PMID 31124279. S2CID 163167304 .
- ^ Rots D, Jakub TE, Keung C, Jackson A, Banka S, Pfundt R, 他 (2023年6月). 「KDM6B関連神経発達障害の臨床的および分子的スペクトル」 . American Journal of Human Genetics . 110 (6): 963– 978. doi : 10.1016 / j.ajhg.2023.04.008 . PMC 10257005. PMID 37196654 .
- ^ハン・X、カオ・X、カブレラRM、ピミエンタ・ラミレスPA、チャン・C、ラマカースVT、他。 （2022年12月）。「KDM6B変異体はヒト脳葉酸欠乏症の病態生理学に寄与する可能性がある」。生物学。12 (1): 74.土井: 10.3390/biology12010074。PMC 9855468。PMID 36671766。
さらに読む
- アッガー K、クロース PA、クリステンセン J、パシーニ D、ローズ S、ラップシルバー J他(2007 年 10 月)。 「UTX と JMJD3 は、HOX 遺伝子の制御と発生に関与するヒストン H3K27 デメチラーゼです。」自然。449 (7163): 731–734。ビブコード: 2007Natur.449..731A。土井：10.1038/nature06145。PMID 17713478。S2CID 4413812。
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