ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| キレル1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | KIRREL1、NEPH1、KIRREL、IRRE様タンパク質の親族(ショウジョウバエ)、IRRE様タンパク質1の親族、kirre様ネフリンファミリー接着分子1、NPHS23 |
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| 外部ID | オミム:607428; MGI : 1891396;ホモロジーン: 10089;ジーンカード:KIRREL1; OMA :KIRREL1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 3番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 3|3 F1 | 始める | 86,985,900 bp [2] |
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| 終わり | 87,082,054 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 子宮内膜間質細胞
- 右冠動脈
- 下行胸部大動脈
- 膝窩動脈
- 脛骨動脈
- 上行大動脈
- 胆嚢
- 左冠動脈
- 左卵管
- 右卵巣
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| | 上位の表現 | - 頭蓋冠
- 大臼歯
- 臍帯
- 骨髄間質
- 水晶体上皮
- 手
- 大腿骨体
- リンパ管の内皮細胞
- 精管
- 足
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 樹状突起の軸
- 膜の不可欠な構成要素
- 細胞質の核周囲領域
- 膜ラフト
- 細胞膜
- 膜
- 細胞突起膜
- 細胞間接合
| | 生物学的プロセス |
- タンパク質リン酸化の負の制御
- 排泄
- アクチンフィラメント重合の正の制御
- 細胞間接着
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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NM_001170985 NM_130867 NM_001377046 |
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| RefSeq(タンパク質) | | |
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NP_001164456 NP_570937 NP_001363975 |
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| 場所(UCSC) | 1 章: 157.99 – 158.1 Mb | 3章: 86.99 – 87.08 MB |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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IRRE様タンパク質1の親和体( NEPH1としても知られる)は、ヒトではKIRREL遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
NEPH1はNEPHタンパク質ファミリーのメンバーであり、NEPH2(KIRREL3、MIM 607761)およびNEPH3(KIRREL2、MIM 607762)が含まれます。これらのタンパク質の細胞質ドメインは、ポドシン(NPHS2、MIM 604766)のC末端と相互作用します。NEPH1は、腎臓のポドサイト(血液のサイズおよび電荷選択的限外濾過を担う細胞)の濾過スリットに発現しています(Sellin et al., 2003)。[OMIM提供] [6]
相互作用
KIRRELはネフリン[7] [8]およびタイトジャンクションタンパク質1 [7] [9]と相互作用することが示されている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000183853 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000041734 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Sellin L, Huber TB, Gerke P, Quack I, Pavenstädt H, Walz G (2003年1月). 「NEPH1はポドシンと相互作用するタンパク質の新規ファミリーを定義する」. FASEB J. 17 ( 1): 115–7 . doi : 10.1096/fj.02-0242fje . PMID 12424224. S2CID 17732086.
- ^ ab "Entrez Gene: KIRREL kin of IRRE like (Drosophila)".
- ^ ab Liu G, Kaw B, Kurfis J, Rahmanuddin S, Kanwar YS, Chugh SS (2003年7月). 「スリット膜におけるNeph1とネフリンの相互作用は糸球体透過性の重要な決定因子である」. J. Clin. Invest . 112 (2): 209–21 . doi :10.1172/JCI18242. PMC 164293. PMID 12865409 .
- ^ Gerke P, Huber TB, Sellin L, Benzing T, Walz G (2003年4月). 「糸球体ポドサイトタンパク質ネフリンおよびNEPH1のホモ二量体化およびヘテロ二量体化」. J. Am. Soc. Nephrol . 14 (4): 918–26 . doi : 10.1097/01.ASN.0000057853.05686.89 . PMID 12660326.
- ^ Huber TB, Schmidts M, Gerke P, Schermer B, Zahn A, Hartleben B, Sellin L, Walz G, Benzing T (2003年4月). 「Nephファミリーメンバーのカルボキシル末端はPDZドメインタンパク質ゾヌラオクルデンス-1に結合する」. J. Biol. Chem . 278 (15): 13417–21 . doi : 10.1074/jbc.C200678200 . PMID 12578837.
さらに読む
- Donoviel DB, Freed DD, Vogel H, Potter DG, Hawkins E, Barrish JP, Mathur BN, Turner CA, Geske R, Montgomery CA, Starbuck M, Brandt M, Gupta A, Ramirez-Solis R, Zambrowicz BP, Powell DR (2001). 「NEPHRINと相同性を持つ新規タンパク質NEPH1を欠損するマウスにおけるタンパク尿と周産期致死率」. Mol. Cell. Biol . 21 (14): 4829–36 . doi :10.1128/MCB.21.14.4829-4836.2001. PMC 87176. PMID 11416156 .
- Huber TB, Schmidts M, Gerke P, Schermer B, Zahn A, Hartleben B, Sellin L, Walz G, Benzing T (2003). 「Nephファミリーメンバーのカルボキシル末端はPDZドメインタンパク質であるゾヌラオクルーデンス-1に結合する」J. Biol. Chem . 278 (15): 13417–21 . doi : 10.1074/jbc.C200678200 . PMID 12578837.
- Barletta GM, Kovari IA, Verma RK, Kerjaschki D, Holzman LB (2003). 「ネフリンとNeph1はポドサイト足突起細胞間接合部に共局在し、シスヘテロオリゴマーを形成する」J. Biol. Chem . 278 (21): 19266–71 . doi : 10.1074/jbc.M301279200 . PMID 12646566.
- Gerke P, Huber TB, Sellin L, Benzing T, Walz G (2003). 「糸球体ポドサイトタンパク質ネフリンおよびNEPH1のホモ二量体化およびヘテロ二量体化」. J. Am. Soc. Nephrol . 14 (4): 918–26 . doi : 10.1097/01.ASN.0000057853.05686.89 . PMID 12660326.
- Liu G, Kaw B, Kurfis J, Rahmanuddin S, Kanwar YS, Chugh SS (2003). 「スリット膜におけるNeph1とネフリンの相互作用は糸球体透過性の重要な決定因子である」. J. Clin. Invest . 112 (2): 209–21 . doi :10.1172/JCI18242. PMC 164293. PMID 12865409 .
- Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004). 「固定化金属アフィニティークロマトグラフィーとタンデム質量分析を用いたヒトT細胞チロシンリン酸化部位の堅牢なリン酸化プロテオームプロファイリング」Anal. Chem . 76 (10): 2763–72 . doi :10.1021/ac035352d. PMID 15144186.
- 北村 明、塚口 秀、飯島 健、荒木 純、服部 正治、池田 正治、本田 正治、野津 健、中里 秀、吉川 暢、加賀美 聡、村松 正治、崔 勇、Cheong HI、土井 孝 (2007). 「ステロイド抵抗性ネフローゼ症候群を有するアジア人15家系の遺伝学的および臨床的特徴」. Nephrol. Dial. Transplant . 21 (11): 3133–8 . doi : 10.1093/ndt/gfl347 . PMID 16968734.