ケンタッキー教区は、 18 世紀後半に設立された アメリカ合衆国長老派教会の教区でした。
ケンタッキー教区は全体として長老派教会全体よりもはるかに保守的であり、特に、1798年頃から1820年頃までケンタッキーで盛んだった信仰復興運動である第二次大覚醒の多くの側面に反対していた。教区は多くの信仰復興派長老派牧師を停職または解任したが、これらの牧師たちは元の会衆に対して説教を続けた。最終的に、 1803年にワシントン長老派を離脱したバートン・W・ストーンはスプリングフィールド長老派を結成し、これが後にクリスチャン教会(キリストの弟子)となった。1810年、5年前に教区によって解散されていた旧カンバーランド長老派の牧師たちが教会を離れ、独立した長老派を設立し、それがカンバーランド長老教会となった。
アメリカ南北戦争後、ケンタッキー教区は主に政治的な路線で分裂しました。ロバート・J・ブレッキンリッジ博士は「北部」、すなわち米国長老派教会派を率いましたが、会員と会衆の大多数は新たに設立された「南部」長老派教会に加わりました。
アメリカ南北戦争中、ケンタッキー州の長老派教会の大多数はアメリカ連合国を支持した。戦争によって生じた分裂は、終戦後まもなく恒久的なものとなった。スチュアート・ロビンソンとベネット・ヤングが新たに設立された「南部」教会会議を率いた。両宗派は財産と組織の支配権をめぐって法廷闘争を繰り広げた。