L1TD1

L1TD1
利用可能な構造
PDB	オーソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	2LR6、3SOO
識別子
エイリアス	L1TD1、ECAT11、LINE-1型トランスポザーゼドメイン1を含む、LINE1型トランスポザーゼドメイン1を含む
外部ID	MGI : 3578435; HomoloGene : 136289; GeneCards : L1TD1; OMA :L1TD1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	染色体1（ヒト）
終わり	62,212,328 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	4番染色体（マウス）
終わり	98,626,717 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	生殖腺; ; 睾丸; ; 胎盤; ; 付録; ; 横行結腸粘膜; ; 白血球; ; 単球; ; 右精巣; ; 左精巣; ; 結腸上皮;
	上位の表現
	卵黄嚢; ; 胚葉上層; ; 胚; ; 胚盤胞; ; 胚盤胞; ; 原始的な条線; ; 桑実胚; ; 胚; ; 胚の尾; ; 手;
	より多くの参照表現データ
	; ;
	より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	一本鎖RNA結合; タンパク質結合;
細胞成分	リボ核タンパク質複合体;
生物学的プロセス	転座、RNA媒介;
	出典：Amigo / QuickGO
オルソログ
	54596
	381591
	ENSG00000240563
	ENSMUSG00000087166
	Q5T7N2
	Q587J6
	NM_019079 ; NM_001164835
	NM_001081202
	NP_001158307 ; NP_061952
	NP_001074671
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子

LINE-1型トランスポザーゼドメイン1 （ L1TD1とも呼ばれる）は、未分化ヒト胚性幹細胞の自己複製および癌細胞の増殖に関与する RNA結合タンパク質である。L1TD1はいくつかの癌の発生に関連することが報告されている。 ^[5]^[6]^[7]^[8]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000240563 – Ensembl、2017年5月
^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000087166 – Ensembl、2017年5月
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^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
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^ 山本英之、豊田正之、鈴木秀、近藤雄一、佐野村剛、村山雄一、大江正之、丸山亮、野島正之、芦田正之、藤井健、佐々木雄一、林暢、森正之、今井健、時野剛、篠村雄一 (2008年10月). 「LINE-1の低メチル化は、ヘリコバクター・ピロリ菌関連胃皺拡大炎におけるCpGアイランドのメチル化増加と関連する」 . Cancer Epidemiol Biomarkers Prev . 17 (10): 2555–64 . doi :10.1158/1055-9965.EPI-08-0112. PMID 18842996. S2CID 24719399.

さらに読む

三井健、徳澤勇、伊藤秀、他 (2003). 「ホメオプロテインNanogはマウスエピブラスト細胞およびES細胞における多能性維持に必須である」. Cell . 113 (5): 631–42 . doi : 10.1016/S0092-8674(03)00393-3 . PMID 12787504. S2CID 18836242.
Cash HL, Tao L, Yuan JM, et al. (2012). 「LINE-1の低メチル化は非喫煙中国人における膀胱がんリスクと関連する」. Int J Cancer . 130 (5): 1151–9 . doi :10.1002/ijc.26098. PMC 3208798. PMID 21445976 .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000240563 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000087166 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[pmid21637830-5] 岩渕 KA, 山川剛, 佐藤雄, 一坂剛, 高橋健, 沖田健, 山中聡 (2011年5月). 「ECAT11/L1td1はES細胞に多く存在し、iPSC生成中に急速に活性化されるが、多能性の維持と誘導には必須ではない」. PLOS ONE . 6 (5) e20461. Bibcode :2011PLoSO...620461I. doi : 10.1371/journal.pone.0020461 . PMC 3102727 . PMID 21637830.

[pmid22162396-6] Närvä E, Rahkonen N, Emani MR, Lund R, Pursiheimo JP, Nästi J, Autio R, Rasool O, Denessiouk K, Lähdesmäki H, Rao A, Lahesmaa R (2012年3月). 「RNA結合タンパク質L1TD1はRNAを介してLIN28と相互作用し、ヒト胚性幹細胞の自己複製および癌細胞の増殖に必要である」. Stem Cells . 30 (3): 452– 60. doi :10.1002/stem.1013. PMC 3507993. PMID 22162396 .

[pmid21559406-7] Wong RC, Ibrahim A, Fong H, Thompson N, Lock LF, Donovan PJ (2011年4月). 「L1TD1は未分化ヒト胚性幹細胞のマーカーである」. PLOS ONE . 6 (4) e19355. Bibcode :2011PLoSO...619355W. doi : 10.1371/journal.pone.0019355 . PMC 3084827. PMID 21559406 .

[pmid18842996-8] 山本英之、豊田正之、鈴木秀、近藤雄一、佐野村剛、村山雄一、大江正之、丸山亮、野島正之、芦田正之、藤井健、佐々木雄一、林暢、森正之、今井健、時野剛、篠村雄一 (2008年10月). 「LINE-1の低メチル化は、ヘリコバクター・ピロリ菌関連胃皺拡大炎におけるCpGアイランドのメチル化増加と関連する」 . Cancer Epidemiol Biomarkers Prev . 17 (10): 2555–64 . doi :10.1158/1055-9965.EPI-08-0112. PMID 18842996. S2CID 24719399.