LHX6

LHX6
識別子
エイリアス	LHX6、LHX6.1、LIM ホメオボックス 6、hLHX6
外部ID	オミム：608215; MGI : 1306803;ホモロジーン：7401;ジーンカード：LHX6; OMA :LHX6 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 9番染色体（ヒト）[1] バンド 9q33.2 始める 122,202,577 bp [1] 終わり 122,229,626 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 染色体2（マウス）[2] バンド 2|2 B 始める 35,971,965 bp [2] 終わり 35,995,420 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 生殖腺 皮下脂肪組織 前頭前皮質 前帯状皮質 内皮細胞 眼窩前頭皮質 ブロードマン領域46 神経節隆起 臓側胸膜 壁側胸膜 上位の表現 内側神経節隆起 上顎突出 大臼歯 嗅内皮質 バレル皮質 CA3領域 嗅周皮質 下顎突出 淡蒼球 女性の尿道 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合転写因子活性 配列特異的DNA結合 DNA結合 タンパク質結合 金属イオン結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 RNAポリメラーゼII転写調節領域配列特異的DNA結合 細胞成分 核 生物学的プロセス 多細胞生物の発達 大脳皮質GABA作動性介在ニューロンの移動 細胞分化 転写の制御、DNAテンプレート 大脳皮質の放射状細胞移動 大脳皮質の接線方向の移動 細胞の成熟 転写、DNAテンプレート 神経系の発達 RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 前脳ニューロンの発達 ニューロンの分化 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 26468 16874 アンサンブル ENSG00000106852 ENSMUSG00000026890 ユニプロット Q9UPM6 Q9R1R0 RefSeq (mRNA) NM_001242333 NM_001242334 NM_001242335 NM_014368 NM_199160 NM_001348190 NM_001083125 NM_001083126 NM_001083127 NM_008500 NM_001355125 RefSeq（タンパク質） NP_001229262 NP_001229263 NP_001229264 NP_055183 NP_954629 NP_001335119 NP_001229263.1 NP_001076594 NP_001076595 NP_001076596 NP_032526 NP_001342054 場所（UCSC） 9章: 122.2 – 122.23 MB 2章: 35.97 – 36 MB PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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LIM/ホメオボックスタンパク質Lhx6は、ヒトではLHX6遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6]}

この遺伝子は、システインに富む特異な亜鉛結合ドメインであるLIMドメインを含む大規模なタンパク質ファミリーのメンバーをコードしています。コードされているタンパク質は転写調節因子として機能し、神経細胞およびリンパ系細胞の分化と発達の制御に関与している可能性があります。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの選択的スプライシング転写バリアントが報告されています。選択的スプライシング転写バリアントは同定されていますが、その生物学的妥当性は未だ確立されていません。^[6]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000106852 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000026890 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Kimura N, Ueno M, Nakashima K, Taga T (1999年10月). 「脳領域特異的遺伝子産物Lhx6.1はタンデムLIMドメインを介してLdb1と相互作用する」. J Biochem . 126 (1): 180–7 . doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022420 . PMID  10393337.
6. "Entrez Gene: LHX6 LIM ホメオボックス 6".

さらに読む

• Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). 「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」Genome Res . 10 (11): 1788–95 . doi :10.1101/gr.143000. PMC  310948. PMID  11076863 .
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). 「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログ作成に向けて：新規完全タンパク質コードヒトcDNA500個の配列決定と解析」Genome Res . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072.  PMID 11230166  .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• Humphray SJ, Oliver K, Hunt AR, et al. (2004). 「ヒト9番染色体のDNA配列と解析」. Nature . 429 (6990): 369–74 . Bibcode :2004Natur.429..369H. doi :10.1038/nature02465. PMC  2734081. PMID 15164053  .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID 15489334  .
• Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeomeから生物学へ：機能ゲノミクスパイプライン」Genome Res . 14 (10B): 2136–44 . doi :10.1101/gr.2576704. PMC  528930. PMID  15489336 .
• 木村 功、若松 明、鈴木 雄一、他 (2006). 「転写調節の多様化：ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特性解析」Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129.  PMID 16344560  .
• Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). 「LIFEdbデータベース 2006」Nucleic Acids Res 34 (データベース号): D415–8. doi :10.1093/nar/gkj139. PMC  1347501. PMID  16381901 .
• Estécio MR, Youssef EM, Rahal P, et al. (2006). 「LHX6は頭頸部癌における高感度メチル化マーカーである」. Oncogene . 25 (36): 5018–26 . doi :10.1038/sj.onc.1209509. PMID  16732332. S2CID  10501427.