LRRFIP1

LRRFIP1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2022年4月
識別子
エイリアス	LRRFIP1、FLAP-1、FLAP1、FLIIAP1、GCF-2、GCF2、HUFI-1、TRIP、ロイシンリッチリピート（FLII内）相互作用タンパク質1、LRR結合FLII相互作用タンパク質1
外部ID	オミム: 603256 ; MGI : 1342770 ;ホモロジーン: 48301 ;ジーンカード: LRRFIP1 ; OMA : LRRFIP1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 染色体2（ヒト）[ 1 ] バンド 2q37.3 始める 2億3762万7587塩基対[ 1 ] 終わり 237,813,682 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 染色体1（マウス）[ 2 ] バンド 1|1 D 始める 90,998,737 bp [ 2 ] 終わり 91,128,944 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 腎髄質 内皮細胞 噴門 乳首 幽門 臓側胸膜 舌の上側 口腔粘膜細胞 咽頭粘膜 心膜 上位の表現 二次卵母細胞 接合子 リンパ管の内皮細胞 結膜円蓋 顆粒球 一次卵母細胞 尿路上皮 毛包 膀胱の移行上皮 涙腺 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 二本鎖RNA結合 タンパク質結合 タンパク質ホモ二量体化活性 カドヘリン結合 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 細胞膜 細胞骨格 核 細胞質 細胞質 生物学的プロセス RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 転写の負の制御、DNAテンプレート 転写の制御、DNAテンプレート I型インターフェロン産生の正の調節 転写、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 NF-κB転写因子活性の正の制御 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 9208 16978 アンサンブル ENSG00000124831 ENSMUSG00000026305 ユニプロット Q32MZ4 Q3UZ39 RefSeq (mRNA) NM_001137550 NM_001137551 NM_001137552 NM_001137553 NM_004735 NM_001111311 NM_001111312 NM_008515 NM_001310732 RefSeq（タンパク質） NP_001131022 NP_001131023 NP_001131024 NP_001131025 NP_004726 NP_001104781 NP_001104782 NP_001297661 NP_032541 場所（UCSC） 2番目の文字: 237.63 – 237.81 Mb 1章: 91 – 91.13 MB PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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ロイシンリッチリピート飛翔体相互作用タンパク質1は、ヒトではLRRFIP1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]}

相互作用

LRRFIP1はFLIIと相互作用することが示されている。^{[ 6 ] [ 9 ]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000124831 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000026305 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Reed AL, Yamazaki H, Kaufman JD, Rubinstein Y, Murphy B, Johnson AC (1998年9月). 「GC結合因子と相同性を持つ転写調節因子の分子クローニングと特性解析」 . J Biol Chem . 273 (34): 21594–602 . doi : 10.1074/jbc.273.34.21594 . PMID 9705290 . 
6. Liu YT, Yin HL (1998年5月). 「flightless Iの結合パートナーの同定、ロイシンリッチリピートとゲルゾリンスーパーファミリーを繋ぐ新規タンパク質」 . J Biol Chem . 273 (14): 7920–7 . doi : 10.1074/jbc.273.14.7920 . PMID 9525888 . 
7. Suriano AR, Sanford AN, Kim N, Oh M, Kennedy S, Henderson MJ, Dietzmann K, Sullivan KE (2005年10月). 「GCF2/LRRFIP1は腫瘍壊死因子αの発現を抑制する」 . Mol Cell Biol . 25 (20): 9073–81 . doi : 10.1128/MCB.25.20.9073-9081.2005 . PMC 1265793. PMID 16199883 .  
8. 「Entrez Gene: LRRFIP1 ロイシンリッチリピート（FLII内）相互作用タンパク質1」。
9. Fong KS, de Couet HG (1999年6月). 「酵母ツーハイブリッドシステムにより同定されたヒトFlightless-Iのロイシンリッチリピートドメインと相互作用する新規タンパク質」. Genomics . 58 (2): 146–57 . doi : 10.1006/geno.1999.5817 . PMID 10366446 . 

さらに読む

• Wilson SA, Brown EC, Kingsman AJ, Kingsman SM (1998). 「TRIP：flightless Iのロイシンリッチリピートと相互作用する新規二本鎖RNA結合タンパク質」 . Nucleic Acids Res . 26 (15): 3460–7 . doi : 10.1093 / nar/26.15.3460 . PMC  147727. PMID  9671805 .
• Khachigian LM, Santiago FS, Rafty LA, Chan OL, Delbridge GJ, Bobik A, Collins T, Johnson AC (1999). 「GC因子2は血小板由来成長因子A鎖遺伝子の転写を抑制し、動脈損傷によって誘導される」 . Circ. Res . 84 (11): 1258–67 . doi : 10.1161/01.res.84.11.1258 . PMID  10364563 .
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• Rikiyama T, Curtis J, Oikawa M, Zimonjic DB, Popescu N, Murphy BA, Wilson MA, Johnson AC (2003). 「GCF2：発現と抑制の分子解析」 . Biochim. Biophys. Acta . 1629 ( 1–3 ): 15–25 . doi : 10.1016/s0167-4781(03)00156-8 . PMID  14522076 .
• Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). 「HeLa細胞核リン酸化タンパク質の大規模解析」 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5 . Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/ pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
• Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (2006). 「確率に基づくアプローチによるハイスループットタンパク質リン酸化解析と部位局在化」Nat . Biotechnol . 24 (10): 1285–92 . doi : 10.1038/nbt1240 . PMID  16964243. S2CID  14294292 .
• Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」 . Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573 .