LYPD1

LYPD1
識別子
別名	LYPD1、LYPDC1、PHTS、LY6/PLAURドメイン含有1
外部ID	OMIM : 610450; MGI : 1919835; HomoloGene : 16937; GeneCards : LYPD1; OMA :LYPD1 - オーソログ
遺伝子の位置（ヒト）
染色体	2番染色体（ヒト）
終了	132,671,579 bp
遺伝子の位置（マウス）
染色体	染色体1（マウス）
終了	125,840,838 bp
RNA発現パターン
	最もよく発現している
	右卵管; ; 側坐核; ; 尾状核; ; 被殻; ; 脳室帯; ; 視床下部; ; 扁桃体; ; 下垂体; ; 帯状回; ; 前帯状皮質;
	最もよく発現している
	舌咽神経節; ; 迷走神経節; ; 海馬歯状回顆粒細胞; ; 楔形骨; ; 脳神経; ; 迷走神経下神経節; ; 扁桃体; ; 嗅神経; ; 一次視覚野; ; 上前頭回;
	その他の参考発現データ
	その他の参考発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	アセチルコリン受容体結合; アセチルコリン受容体阻害活性;
細胞成分	膜; 膜のアンカー成分; 細胞外領域; 細胞膜;
生物学的プロセス	ニコチンへの反応; 行動的恐怖反応; シグナル伝達受容体活性の負の調節; シナプス伝達、コリン作動性; 細胞活性化; アセチルコリン受容体シグナル伝達経路; タンパク質の細胞膜への局在の負の制御;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	116372
	72585
	ENSG00000150551
	ENSMUSG00000026344
	Q8N2G4
	Q8BLC3
	NM_001077427 ; NM_144586 ; NM_001321234 ; NM_001321235
	NM_145100 ; NM_001311089 ; NM_001311090
	NP_001070895 ; NP_001308163 ; NP_001308164 ; NP_653187
	NP_001298018 ; NP_001298019 ; NP_659568
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

ホモ・サピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子

Ly6/PLAURドメイン含有タンパク質1は、ヒトではLYPD1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

このタンパク質はLynx2としても知られ、神経伝達物質受容体結合タンパク質のLynxファミリーの一員です。 ^{[7] Lynx2を発現しない} トランスジェニックマウスでは、不安関連行動が増加します。^[8]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000150551 – Ensembl、2017年5月
^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000026344 – Ensembl、2017年5月
^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ ストラウスバーグ RL、ファインゴールド EA、グラウス LH、デルゲ JG、クラウスナー RD、コリンズ FS、ワーグナー L、シェンメン CM、シューラー GD、アルトシュール SF、ゼーベルク B、ビュトウ KH、シェーファー CF、バート NK、ホプキンス RF、ジョーダン H、ムーア T、マックス SI、ワン J、シェイ F、ディアチェンコL、マルシナ K、ファーマー AA、ルービン GM、ホン L、ステープルトン M、ソアレス MB、ボナルド MF、カサバント TL、シェッツ TE、ブラウンスタイン MJ、ウスディン TB、俊之 S、カルニンチ P、プランゲ C、ラハ SS、ロケジャノ NA、ピーターズ GJ、アブラムソン RD、マラヒー SJ、ボサック SA、マキューアン PJ、マッカーナンKJ、マレック JA、 Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG, Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (2002年12月). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc Natl Acad Sci USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
^ 「Entrez Gene: LYPD1 LY6/PLAURドメイン含有1」。
^ Miwa , JM; Lester, HA; Walz, A. (2012). 「ニコチン受容体のLynxモジュレーターによるコリン作動性緊張の最適化：可塑性とニコチン依存症への影響」生理学27 (4): 187– 199. doi :10.1152/physiol.00002.2012. PMID 22875450.
^ Tekinay, AB; Nong, Y.; Miwa, JM; Lieberam, I.; Ibanez-Tallon, I.; Greengard, P.; Heintz, N. (2009). 「不安関連行動におけるLYNX2の役割」. Proceedings of the National Academy of Sciences . 106 (11): 4477– 4482. Bibcode :2009PNAS..106.4477T. doi : 10.1073/pnas.0813109106 . PMC 2657456. PMID 19246390 .

さらに読む

Yu DH, Fan W, Liu G, et al. (2006). 「新規推定腫瘍抑制因子PHTSは、p53経路とは独立してHeLaHF細胞の形質転換の反転に関与する」Exp. Cell Res . 312 (6): 865–76 . doi :10.1016/j.yexcr.2005.12.006. PMID 16413018.
Choy KW, Wang CC, Ogura A, et al. (2007). 「ヒト妊娠初期眼球から同定された15,809個のESTのゲノムアノテーション」. Physiol. Genomics . 25 (1): 9– 15. doi :10.1152/physiolgenomics.00121.2005. PMID 16368877.
木村功、若松明、鈴木雄一、他 (2006). 「転写調節の多様化：ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特性解析」Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
大月剛志、太田剛志、西川剛志、他 (2007). 「シグナル配列とキーワードトラップを用いたin silicoによる、オリゴキャップcDNAライブラリーからの分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする全長ヒトcDNAの選択」DNA Res . 12 (2): 117–26 . doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
太田剛志、鈴木雄志、西川剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al. (2003). 「分泌タンパク質発見イニシアチブ（SPDI）：新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質の同定に向けた大規模取り組み：バイオインフォマティクスによる評価」Genome Res . 13 (10): 2265–70 . doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309 .

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000150551 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000026344 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[pmid12477932-5] ストラウスバーグ RL、ファインゴールド EA、グラウス LH、デルゲ JG、クラウスナー RD、コリンズ FS、ワーグナー L、シェンメン CM、シューラー GD、アルトシュール SF、ゼーベルク B、ビュトウ KH、シェーファー CF、バート NK、ホプキンス RF、ジョーダン H、ムーア T、マックス SI、ワン J、シェイ F、ディアチェンコL、マルシナ K、ファーマー AA、ルービン GM、ホン L、ステープルトン M、ソアレス MB、ボナルド MF、カサバント TL、シェッツ TE、ブラウンスタイン MJ、ウスディン TB、俊之 S、カルニンチ P、プランゲ C、ラハ SS、ロケジャノ NA、ピーターズ GJ、アブラムソン RD、マラヒー SJ、ボサック SA、マキューアン PJ、マッカーナンKJ、マレック JA、 Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG, Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (2002年12月). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc Natl Acad Sci USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .

[entrez-6] 「Entrez Gene: LYPD1 LY6/PLAURドメイン含有1」。

[7] ^ Miwa , JM; Lester, HA; Walz, A. (2012). 「ニコチン受容体のLynxモジュレーターによるコリン作動性緊張の最適化：可塑性とニコチン依存症への影響」生理学27 (4): 187– 199. doi :10.1152/physiol.00002.2012. PMID 22875450.

[8] Tekinay, AB; Nong, Y.; Miwa, JM; Lieberam, I.; Ibanez-Tallon, I.; Greengard, P.; Heintz, N. (2009). 「不安関連行動におけるLYNX2の役割」. Proceedings of the National Academy of Sciences . 106 (11): 4477– 4482. Bibcode :2009PNAS..106.4477T. doi : 10.1073/pnas.0813109106 . PMC 2657456. PMID 19246390 .