
リンネ分類法は、次の 2 つの関連する概念のいずれかを意味します。
リンネは、プラトンとアリストテレスに遡る概念を発明したわけでも、現在の形を与えたわけでもないにもかかわらず、順位付けされた分類法を考案したとされています。実際には、「リンネ分類法」という名称は存在しないため、順位付けされた分類法には明確な形式はありません。むしろ、類似したアプローチに用いられる複数の分野を抽象的にまとめた用語です。
リンネ名にも、文脈に応じて 2 つの意味があります。1 つは、Giraffa camelopardalis Linnaeus, 1758のようにリンネ自身によって与えられた正式名を指す場合、もう 1 つは、一般に認められた命名法による正式名を指す場合です。
リンネは著書『自然の帝国』の中で、動物界、植物界、鉱物界という3つの界を定めました。動物界、植物界、鉱物界というこの考え方は、今日でも人々の心に生き続けています。特に、社交ゲームの「それは動物か、植物か、それとも鉱物か?」という質問や、ギルバートとサリバンの『少将の歌』にその名が残っています。リンネの著作は科学に大きな影響を与え、現在では命名法典によって規制されている生物学上の命名法の基礎として不可欠なものとなりました。彼の著作のうち、植物に関する『植物種』第1版(1753年)と『自然の体系』第10版(1758年)の2つは、命名法の出発点とみなされており、彼の二名法(種の名前)と属名は、他のものよりも優先されます。[ 1 ]しかし、彼が科学に与えた影響は、彼の分類学の価値によるものではありませんでした。
リンネの界は綱に分けられ、綱はさらに目、属(単数形:属)、種(単数形:種)に分けられ、種よりさらに下の階級が設けられていたが、これらは現代の分類学における用語の使用法と厳密には一致していない。[ 2 ]
1735年の著書『自然の体系』において、彼が提唱した植物の綱と目は、彼の著書『性体系』に則り、自然群を表すものではなく(彼の著書『植物哲学』における「自然分類の順序」とは対照的に)、識別のみに用いられることを意図していた。しかし、1737年に出版された『植物属』の中で、彼は自身の属の分類は自然体系であると主張した。[ 3 ]彼の植物分類と性体系は19世紀に広く用いられた。[ 4 ]各綱には複数の目が存在した。この体系は、雄しべ(雄蕊)と雌しべ(雌蕊)の数と配置に基づいている。[ 5 ]


リンネの性体系における植物の分類は以下のとおりです (ページ番号はSpecies plantarumを参照)。
雄しべの数に基づいた綱は、その後雌しべの数によってさらに細分化され、例えばヘキサンドリア・モノギニアは雄しべが6本、雌しべが1本である。[ 29 ]属索引 p.1201 [ 30 ]
対照的に、彼の修道士の数はピペリタエからヴァガエまで 69 でした。

動物界においてのみ、リンネの高等分類学が多かれ少なかれ今でも認識されており、その名称の一部は現在でも使われていますが、通常は同じグループを指すものではありません。彼は動物界を6つの綱に分類しました。1758年の第10版では、以下の綱が定められました。
リンネの鉱物分類法は、すでに使われなくなって久しい。1758年に出版された『自然の体系』第10版では、リンネの分類は次のように定められていた。
生物を分類するこの階級に基づく方法は、もともとリンネによって普及させ(ずっと後にリンネにちなんで名付けられました)、彼の時代からかなり変化しました。リンネの最大の革新であり、今でもこのシステムの最も重要な側面は、属名と2番目の用語を組み合わせた二名法の一般的な使用です。この2つを組み合わせると、界内の生物の種を一意に識別します。たとえば、動物界では、ヒトという種はHomo sapiensという名前で一意に識別されます。他の動物種は、これと同じ二名法(動物の場合の二名法の専門用語)を持つことはできません。リンネの分類法以前は、動物は移動様式で分類されていました。
リンネによる二名法の使用は、スコラ哲学の定義理論によって予見されていました。スコラ哲学の論理学者と自然哲学者は、例えばヒトという種を「動物合理主義(Animal rationalis)」と定義しました。動物は属であり、合理主義(ラテン語で「理性的な」)はヒトを他のすべての動物と区別する特徴とみなされていました。しかしながら、ヒトやウマなどの種の直接の属として動物を扱うことは、生物学分類学者にとって実用的ではありません。したがって、リンネの分類では、動物を多くの属(目などの中間クラスを介して動物界に従属する)を含むクラスとして扱い、ヒトをホモ・サピエンス種の属として扱い、サピエンス(ラテン語で「知る」または「理解する」)は、スコラ学体系におけるラティオリス(ラテン語で「人間」を意味するhomoという単語は、スコラ学では属ではなく種を表すために使用された)が果たす役割と同様の差別化の役割を果たしている。
リンネ分類法の強みは、様々な種類の生物を簡潔かつ実用的に体系化できることです。あらゆる種に、固有(かつ理想的には安定した)名称を与えることができます。一方、一般名は、場所や言語によって固有性も一貫性も欠けていることが多いのが現状です。この固有性と安定性は、もちろん、実務体系学者(分類学と進化学を専門とする生物学者)が、二名法そのものだけでなく、正式な命名規則に定められたこれらの名称の使用規則も受け入れた結果です。
種は、ドメインまたは界から始まる、ランク付けされた階層構造に配置できます。ドメインは界に分けられます。界は、動物の門(単数形:門)に分けられます。植物や菌類に使用される区分という用語は、門の階級に相当します(国際植物命名規約では、どちらの用語も使用できます)。門(または区分)は綱に分けられ、綱はさらに目、科、属(単数形:属)、および種(単数形:種)に分けられます。種の下には階級があり、動物学では亜種(ただし、形態または形態を参照)、植物学では亜種、変種(ラテン語:varietas)、および形態(ラテン語:forma)です。
これらのいずれかの階級にある生物のグループは、分類群(単数形:分類群)または分類群と呼ばれます。
リンネの体系は堅牢であることが証明されています。しかし、階級の数には制限がないものの、実際には階級を増やすほど分類は複雑になります。後になってから生まれた細分化には、門、科、族といった実体に加え、接頭辞(上科、亜科など)を持つ階級がいくつもあります。分岐論や系統命名法といった新しい分類ツールの使用により、進化に対する見方が変わり(多くの入れ子になったクレードで表現される)、より多くの階級を求める声が上がることがあります。こうした複雑さの一例として、マッケナとベルが提唱した 哺乳類の体系が挙げられます。
時が経つにつれ、生物同士の関係についての理解は変化してきた。リンネは、異なる生物の構造的類似性にのみ基づいてその体系を組み立てることができた。最も大きな変化は、チャールズ・ダーウィンの『種の起源』が 1859 年に出版され、生物の多様性と種形成のメカニズムとして進化が広く受け入れられたことだ。すると、分類は生物の系統発生、つまり進化による系統発生を反映すべきであることが一般に理解されるようになった。これが進化分類学につながり、現存するさまざまな種と絶滅した種が結び付けられて系統発生が構築される。現代の文脈で使用されるリンネ分類学という用語が意味するのは主にこれである。分岐論 (cladistics)は、1950 年以降のウィリ・ヘニングの研究に端を発し、各分類群はそのグループのメンバーの共通祖先を含むようにグループ化される。このような分類群は、ヒト属のように単系統(すべての子孫を含む)である場合もあれば、アウストラロピテクス属のように側系統(一部の子孫を除く)である場合もあります。
もともと、リンネは自身の体系において、植物界、動物界、そして鉱物界という3つの界を設定しましたが、これはかなり以前に放棄されました。それ以来、様々な生命体が3つの新しい界に分類されてきました。モネラ界は原核生物(細菌)を、原生生物界は原生動物とほとんどの藻類を、そして菌類は真菌を分類するものです。この5界体系は系統発生の理想からは程遠く、現代の分類学では主に3つのドメイン、すなわち細菌と古細菌(原核生物を含む)、そして真核生物(残りの形態を含む)への区分に取って代わられています。これらの分類は決定的なものと見なすべきではありません。これらは生物のゲノムに基づいており、ゲノムに関する知識が増えるにつれて分類も変わっていくでしょう。 [ 31 ]
リンネ分類学の枠組みの中で推定上の進化関係を表現することは、特に分岐論的方法論が広く受け入れられ、長年受け入れられてきた分類法に疑問を投げかける分子系統樹が数多く存在する状況を考えると、時に問題視されることがある。そのため、一部の系統分類学者は、これに代わる PhyloCodeを提案している。