- 2003年12月1日、旧員弁町は員弁郡の大安町、藤原町、北勢町を合併し、新たに員弁市が誕生しました。
- 2004年10月1日、旧志摩町は志摩郡の阿児町、大王町、浜島町、磯部町を合併し、志摩市が誕生しました。この合併により、志摩郡は解散しました
- 2004年11月1日、上野市は伊賀町（旧）、阿山町、阿山郡の大山田村、島ヶ原村、那賀郡の青山町と合併し、伊賀市が誕生しました。この合併により、阿山郡と那賀郡は解消されました。
- 月6日、旧桑名市は桑名郡の長島町と多度町を吸収し、新たに拡大した桑名市が誕生しました。
- 2005年1月1日、旧松阪市は市志郡の三雲町と嬉野町、飯南郡の飯南町と飯高町を吸収し、新たに拡大した松阪市が誕生しました。この合併により、飯南郡は解消されました
- 2005年1月11日、鈴鹿郡の関町は拡大した亀山市に合併しました。この合併により、鈴鹿郡は消滅しました。
- 2005年2月7日、三重郡の玖珠町は四日市市に合併しました。
- 2005年2月14日、度会郡の紀勢町、大宮町、大内山村が合併し、大樹町が誕生しました。
- 2005年10月1日、度会郡の南勢町と南東町が合併し、南伊勢町が誕生しました。
- 2005年10月1日、北牟婁郡の紀伊長島町と美山町が合併し、紀北町が誕生しました
- 2005年11月1日、南牟婁郡紀和町は拡大した熊野市に合併されました
- 2005年11月1日、旧伊勢市は度会郡の二見町、小幡町、美園村を吸収し、新たに拡大した伊勢市が誕生しました
- 2006年1月1日、旧津市は久居市、安濃町、芸濃町、河芸町、美里村（以上安芸郡）、白山町、一志町、烏町、美杉村（以上一志郡）を吸収合併し、新たに拡大した津市が誕生しました。この合併により、安芸郡と一志郡は解消されました。
- 2006年1月1日、多気郡清和村は拡大後の多気町に合併しました。
- 2006年1月10日、多気郡宮川村は拡大後の大台町に合併しました。
- 2006年1月10日、南牟婁郡鵜殿村は拡大後の紀宝町に合併しました。この合併により、三重県内のすべての村が解散しました。
計画中の合併／今後の合併
