LysMドメイン

利用可能なタンパク質構造:
ファム	構造 / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要

LysMドメイン
LysMドメイン
識別子
シンボル	リスM
ファム	PF01476
インタープロ	IPR000644
頭いい	リスM
プロサイト	PS51782
SCOP2	1e0g / スコープ / サフファム
CDD	cd00118
メンブラノーム	1306
ファム
利用可能なタンパク質構造:
ファム	構造 / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要

タンパク質ドメイン

分子生物学では、LysMドメインは、さまざまな細胞外タンパク質や受容体に見られるタンパク質ドメインです。LysMドメインは、細菌タンパク質で特定された配列モチーフに付けられた元の名前であるリジンモチーフにちなんで命名されました。この領域はもともと、Enterococcus hiraeムラミダーゼに見られるC末端反復配列として特定されました。^[1] LysMドメインはさまざまな微生物細胞外タンパク質に見られ、LysMドメインはペプチドグリカンやキチンなどの細胞外多糖類へのアンカーを提供していると考えられています。LysMドメインは、マメ科植物と共生細菌の根粒共生に必要なNod因子の受容体であるNFPなどの植物受容体にも見られます。^[2] LysMドメインは通常、44～65アミノ酸残基の長さです。^{[3] LysMドメインの構造は、一対の短い}αヘリックスによって分離された一対の反平行β鎖で構成されていることを示した。^[4]

参照

うなずき要素

参考文献

^ Joris B, Englebert S, Chu CP, Kariyama R, Daneo-Moore L, Shockman GD, Ghuysen JM (1992年3月). 「Enterococcus hirae ムラミダーゼ-2およびStreptococcus faecalis オートリシンのモジュール設計」. FEMS Microbiology Letters . 70 (3): 257–64 . doi : 10.1016/0378-1097(92)90707-u . PMID 1352512.
^ アリギ、ジャン＝フランソワ;アニック・バレ。ベン・アモール、ベズマ。ベルスー、アン。ソリアーノ、リディア・カンポス。ミラベラ、ロッサナ。デ・カルヴァーリョ＝ニーベル、フェルナンダ。ジュルネ、エティエンヌ・パスカル。ゲラルディ、ミシェル。ユゲ、ティエリー。グルツ、ルネ (2006)。「Medicago truncatula リジンモチーフ受容体様キナーゼ遺伝子ファミリーには、NFP および新規結節発現遺伝子が含まれます。」植物生理学。142 (1): 265–279。土井:10.1104/pp.106.084657。ISSN 0032-0889。PMC 1557615。PMID 16844829。
^ Buist G, Steen A, Kok J, Kuipers OP (2008年5月). 「LysMは（ペプチド）グリカンに結合するための広く分布するタンパク質モチーフである」. Molecular Microbiology . 68 (4): 838–47 . doi : 10.1111/j.1365-2958.2008.06211.x . PMID 18430080.
^ Bateman A, Bycroft M (2000年6月). 「大腸菌膜結合型溶菌性ムレイントランスグリコシラーゼD（MltD）のLysMドメインの構造」. Journal of Molecular Biology . 299 (4): 1113–9 . doi :10.1006/jmbi.2000.3778. PMID 10843862.

[1] Joris B, Englebert S, Chu CP, Kariyama R, Daneo-Moore L, Shockman GD, Ghuysen JM (1992年3月). 「Enterococcus hirae ムラミダーゼ-2およびStreptococcus faecalis オートリシンのモジュール設計」. FEMS Microbiology Letters . 70 (3): 257–64 . doi : 10.1016/0378-1097(92)90707-u . PMID 1352512.

[2] アリギ、ジャン＝フランソワ;アニック・バレ。ベン・アモール、ベズマ。ベルスー、アン。ソリアーノ、リディア・カンポス。ミラベラ、ロッサナ。デ・カルヴァーリョ＝ニーベル、フェルナンダ。ジュルネ、エティエンヌ・パスカル。ゲラルディ、ミシェル。ユゲ、ティエリー。グルツ、ルネ (2006)。「Medicago truncatula リジンモチーフ受容体様キナーゼ遺伝子ファミリーには、NFP および新規結節発現遺伝子が含まれます。」植物生理学。142 (1): 265–279。土井:10.1104/pp.106.084657。ISSN 0032-0889。PMC 1557615。PMID 16844829。

[Steen-3] Buist G, Steen A, Kok J, Kuipers OP (2008年5月). 「LysMは（ペプチド）グリカンに結合するための広く分布するタンパク質モチーフである」. Molecular Microbiology . 68 (4): 838–47 . doi : 10.1111/j.1365-2958.2008.06211.x . PMID 18430080.

[4] Bateman A, Bycroft M (2000年6月). 「大腸菌膜結合型溶菌性ムレイントランスグリコシラーゼD（MltD）のLysMドメインの構造」. Journal of Molecular Biology . 299 (4): 1113–9 . doi :10.1006/jmbi.2000.3778. PMID 10843862.