MDGRAPE-3は、日本の理化学研究所が開発した超高性能ペタスケール スーパーコンピュータシステムです。分子動力学シミュレーション、特にタンパク質構造予測のために構築された専用システムです。[1]
MDGRAPE-3 は、24 個のカスタム MDGRAPE-3 チップ (合計 4,824 個) の 201 ユニットと、ホスト マシンとして機能する 追加のデュアル コア Intel Xeonプロセッサ (コード名「Dempsey」 ) で構成されています。
2006年6月、理化学研究所は浮動小数点演算性能ペタFLOPSを達成したと発表しました[2]。[ 2 ]これは、当時TOP500スーパーコンピュータリストでトップに立っていた0.28ペタFLOPSのIBM Blue Gene/Lシステムの2006年版の3倍以上の速度でした。MDGRAPE-3はLINPACKベンチマークを実行できる汎用マシンではないため、TOP500リストには含まれていません。
参照
参考文献
- ^ Carey, Bjorn (2006)、「Overachievers We Love - Faster」、Popular Science、269 (6): 24
- ^ ab 理化学研究所プレスリリース、分子動力学シミュレーション用1ペタフロップスコンピュータシステムの完成
- 泰地誠、「MDGRAPE-3チップ：分子動力学シミュレーション用165Gflopsアプリケーション特化型LSI」、第16回IEEEホットチップシンポジウム、2004年8月。[1]
外部リンク
- IBM MD-GRAPEプロジェクト
- 理化学研究所 高性能分子シミュレーションチーム
- ペタコンピューティング研究所
- 鳴海哲のMDGRAPEページ 2008年2月13日アーカイブウェイバックマシン
- MDGRAPE-2を用いた分子動力学計算装置
