Protein-coding gene in the species Homo sapiens
| MMP8 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコード一覧 |
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1A86、1JAP、1I76、1ZVX、3TT4、2OY2、1ZS0、1JAN、1MMB、1I73、1A85、1KBC、1ZP5、1JH1、3DPF、1JAQ、3DPE、1BZS、4QKZ、1JAO、3DNG、2OY4、1MNC |
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| 識別子 |
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| 別名 | MMP8、CLG1、HNC、MMP-8、PMNL-CL、マトリックスメタロペプチダーゼ8 |
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| 外部ID | OMIM : 120355; MGI : 1202395; HomoloGene : 22482; GeneCards : MMP8; OMA :MMP8 - オーソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | 染色体 | 9番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 9|9 A1 | 開始 | 7,558,457 bp [2] |
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| 終了 | 7,568,486 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| Bgee | | ヒト | マウス(相同遺伝子) |
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| 最もよく発現している | - 海綿骨
- 骨髄
- 骨髄細胞
- 精巣
- 単球
- 血液
- 羊水
- 脾臓
- 顆粒球
- 左肺の上葉
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| | 最もよく発現している | - 顆粒球
- 脛大腿関節
- 胸筋
- 第三趾
- 骨髄
- 血液
- 第二趾
- 軟骨組織
- 母趾
- 下肢の自由部分の骨
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| | その他の参考表現データ |
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| バイオGPS |  | | その他の参考表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 亜鉛イオン結合
- ペプチダーゼ活性
- 加水分解酵素活性
- メタロペプチダーゼ活性
- 金属イオン結合
- セリン型エンドペプチダーゼ活性
- メタロエンドペプチダーゼ活性
- エンドペプチダーゼ活性
| | 細胞成分 |
- 細胞外マトリックス
- 細胞外領域
- 特定の顆粒腔
- 三次顆粒腔
- 細胞外空間
- コラーゲン含有細胞外マトリックス
| | 生物学的プロセス |
- コラーゲン分解プロセス
- 細胞外マトリックスの分解
- 内胚葉細胞の分化
- タンパク質分解
- 好中球の脱顆粒
- 遺伝子発現の正の調節
- 遺伝子発現の負の調節
- インターロイキン-10産生の負の調節
- インターロイキン-6産生の正の調節
- DNA結合の正の調節
- MAPKカスケードの正の制御
- 一酸化窒素生合成プロセスの正の調節
- JNKカスケードの正の制御
- 神経炎症反応の調節
- 神経炎症反応の正の調節
- NIK/NF-κBシグナル伝達の正の制御
- 活性酸素種の生合成プロセスの正の調節
- ミクログリア細胞の活性化の調節
- ミクログリア細胞の活性化の正の制御
- 細胞外マトリックスの組織化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| 相同遺伝子 |
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| 種 | ヒト | マウス |
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| Entrez | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001304441 NM_001304442 NM_002424 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001291370 NP_001291371 NP_002415 |
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| 場所 (UCSC) | 11番染色体: 102.71~102.73 Mb | 9番染色体: 7.56~7.57 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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好中球コラゲナーゼは、マトリックスメタロプロテアーゼ-8(MMP-8)またはPMNLコラゲナーゼ(MNL-CL) としても知られ、ほとんどの哺乳類の結合組織に存在するコラーゲン 切断 酵素です。 [5] ヒトでは、MMP-8タンパク質はMMP8 遺伝子によってコードされています。[6] [7]
この遺伝子は、染色体11q22.3に局在するMMP遺伝子クラスターの一部です。[5]ほとんどのMMPは不活性なプロタンパク質として分泌され、細胞外プロテアーゼによって切断されると活性化されます。しかし、この遺伝子によってコードされる酵素は好中球内の二次顆粒に蓄えられ、自己分解によって活性化されます。
機能
マトリックスメタロプロテアーゼ(MMP)ファミリーのタンパク質は、胚発生、生殖、組織リモデリングなどの正常な生理学的プロセス、ならびに関節炎や転移などの疾患プロセスにおける細胞外マトリックスの分解に関与しています。MMP-8の主な機能は、I型、II型、III型コラーゲンの分解です。癌においては、マウスMMTV-PyMT乳癌モデルにおけるMMP-8の喪失が、腫瘍の増殖および転移負荷の増加、腫瘍血管の増強、免疫細胞浸潤の変化と関連付けられています。[8]さらに、乳癌細胞株におけるMMP-8の解析により、MMP-8活性とIL6およびIL8産生との因果関係が明らかになり、MMP-8が自然免疫系の調節において役割を果たしていることが示唆されています。[9]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000118113 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000005800 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
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- ^ Thirkettle S, Decock J, Arnold H, Pennington CJ, Jaworski DM, Edwards DR (2013). 「マトリックスメタロプロテアーゼ8(コラーゲナーゼ2)は乳がん細胞においてインターロイキン6および8の発現を誘導する」. Journal of Biological Chemistry . 288 (23): 16282– 16294. doi : 10.1074/jbc.M113.464230 . PMC 3675567. PMID 23632023 .
参考文献
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外部リンク
- ペプチダーゼとその阻害剤に関するMEROPSオンラインデータベース:M10.002