ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| MYCBP2 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | MYCBP2、PAM、Myc-bp2、Phr、MYC結合タンパク質2、E3ユビキチンタンパク質リガーゼ、PHR1、MYC結合タンパク質2 |
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| 外部ID | オミム:610392; MGI : 2179432;ホモロジーン:9005;ジーンカード:MYCBP2; OMA :MYCBP2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 14番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 14 E2.3|14 51.79 cM | 始める | 103,350,847 bp [2] |
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| 終わり | 103,584,250 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - ブロードマン野23
- 中側頭回
- 毛包
- 視床の外側核群
- ブロードマン領域10
- 前頭極
- 小脳虫部
- 乳首
- 橋
- 緻密部
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| | 上位の表現 | - 腹内側核
- 前扁桃体領域
- 内側膝状体
- 外側視床下部
- 外側中隔核
- 視床下部室傍核
- 乳頭体
- 外側膝状体
- 腹側被蓋野
- 内側背側核
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | 
 | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- 金属イオン結合
- トランスフェラーゼ活性
- グアニルヌクレオチド交換因子活性
- 亜鉛イオン結合
- タンパク質ホモ二量体化活性
- ユビキチンタンパク質リガーゼ活性
| | 細胞成分 |
- 膜
- 核
- 細胞質
- 細胞骨格
- 微小管細胞骨格
- 軸索
- 細胞投影
- 細胞内膜小器官
| | 生物学的プロセス |
- 転写の制御、DNAテンプレート
- タンパク質のユビキチン化
- 転写、DNAテンプレート
- 運動ニューロンの軸索誘導
- 鰓運動ニューロンの軸索誘導
- 中枢神経系投射ニューロン軸索形成
- タンパク質の局在の制御
- タンパク質分解プロセスの負の調節
- ニューロン分化に関与する細胞形態形成
- 神経筋プロセス
- 細胞骨格組織の調節
- 軸索誘導の調節
- タンパク質ユビキチン化の正の制御
- 遺伝子発現の概日リズム制御
- リズミカルなプロセス
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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MYCBP2はおそらくE3ユビキチンタンパク質リガーゼであり、 myc結合タンパク質2またはmycと関連するタンパク質(PAM)としても知られ、ヒトではMYCBP2遺伝子によってコードされている酵素です。[5] [6]
構造
PAMにはN末端 ロイシンジッパー、中央MYC結合、C末端 ヒストン結合タンパク質相同ドメインが含まれている。[5]
相互作用
MYCBP2はMycと相互作用することが示されている。[5]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000005810 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000033004 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ abc Guo Q, Xie J, Dang CV, Liu ET, Bishop JM (1998年9月). 「RCC1様リピートを含む大型Myc結合タンパク質の同定」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (16): 9172–7 . Bibcode :1998PNAS...95.9172G. doi : 10.1073/pnas.95.16.9172 . PMC 21311. PMID 9689053 .
- ^ 「Entrez Gene: MYCBP2 MYC結合タンパク質2」。
さらに読む
- 中島大輔、岡崎直人、山川英、菊野理、大原央、永瀬哲也 (2002) 「KIAA 遺伝子の発現準備が整った cDNA クローンの構築: 330 個の KIAA cDNA クローンの手動キュレーション」。DNA研究所9 (3): 99–106 .土井: 10.1093/dnares/9.3.99。PMID 12168954。
- 長瀬 剛志、石川 功、須山 正之、菊野 亮、広澤 正治、宮島 暢、田中 明、小谷 秀、野村 暢、小原 修 (1998). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測. XII. 脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列(in vitroで巨大タンパク質をコードするもの). DNA Res . 5 (6): 355–64 . doi : 10.1093/dnares/5.6.355 . PMID 10048485.
- Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J, Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (2000). 「CD34陽性造血幹/前駆細胞で発現する、これまで未同定であった300遺伝子のオープンリーディングフレームを持つcDNAのクローニングと機能解析」Genome Res . 10 (10): 1546–60 . doi :10.1101/gr.140200. PMC 310934 . PMID 11042152.
- Murthy V, Han S, Beauchamp RL, Smith N, Haddad LA, Ito N, Ramesh V (2004). 「Pamとその相同遺伝子highwireはTSC1.TSC2複合体と相互作用し、負に制御する可能性がある」. J. Biol. Chem . 279 (2): 1351–8 . doi : 10.1074/jbc.M310208200 . PMID 14559897.
- Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (2004). 「トランスクリプトーム解析によりヒトES細胞の増殖と分化を制御するシグナル伝達ネットワークが解明される」Nat. Biotechnol . 22 (6): 707–16 . doi :10.1038/nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
- Pierre SC, Häusler J, Birod K, Geisslinger G, Scholich K (2004). 「PAMはスフィンゴシン-1-リン酸によるcAMPシグナル伝達の持続的阻害を媒介する」. EMBO J. 23 ( 15): 3031–40 . doi :10.1038/sj.emboj.7600321. PMC 514936. PMID 15257286 .
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). 「HeLa細胞核リン酸化タンパク質の大規模解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5 . Bibcode :2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .
- Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (2004). 「細胞骨格制御と細胞組織化に関与するin vivo 14-3-3結合タンパク質のプロテオーム、機能、およびドメインベース解析」. Curr. Biol . 14 (16): 1436– 50. Bibcode :2004CBio...14.1436J. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660.
- Gao X, Patel TB (2005). 「Myc関連タンパク質中のヒスチジン残基912および913は、アデニル酸シクラーゼ活性の阻害に必須である」. Mol. Pharmacol . 67 (1): 42–9 . doi :10.1124/mol.104.005355. PMID 15470080. S2CID 6049319.
- Benzinger A, Muster N, Koch HB, Yates JR, Hermeking H (2005). 「癌において一般的にサイレンシングされているp53エフェクター、14-3-3シグマの標的プロテオーム解析」Mol. Cell. Proteomics . 4 (6): 785–95 . doi : 10.1074/mcp.M500021-MCP200 . PMID 15778465.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、in vivo、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」. Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983.
- Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). 「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 .