生化学において、メタロームとは細胞内における金属 イオンの分布を指します。この用語はプロテオーム[ 1]との類似性から造られました。メタロミクスはメタロームの研究であり、「細胞または組織の種類内における金属および半金属種の全体を包括的に分析する」ことを指します。[2]したがって、金属は通常は代謝物とはみなされませんが、メタロミクスはメタボロミクス[要出典]の一分野と見なすことができます。
「メタロム」の別の定義としては、金属タンパク質またはその他の金属含有生体分子があり、「メタロミクス」はそのような生体分子の研究である。[3]
メタロインターラクトーム
メタロームの研究では、トランスクリプトーム、プロテオーム、メタボロームがメタローム全体を構成します。メタロームの研究は、メタロインターラクトームに到達するために行われます。
メタロトランスクリプトーム
メタロトランスクリプトーム[4]は、生物学的または環境的に関連する濃度の必須金属または毒性金属が存在する場合のトランスクリプトーム全体のマップとして定義できます。メタロメタボロームは、任意の時点で細胞内に存在する小さな代謝物の完全なプールを構成します。これによりメタロインターラクトーム全体が形成され、これに関する知識は毒性や創薬を扱う比較メタロミクスにおいて重要です。[4]
参照
参考文献
- ^ ウィリアムズ 2001
- ^ シュプナール 2005
- ^ 原口 2004
- ^ ab シャンケル、ジャナギラマン、ヴェンカテシュワルル 2009
出典
- Banci, Lucia; Bertini, Ivano (2013). 「第1章 メタロミクスと細胞：いくつかの定義と一般的考察」 Banci, Lucia (編).メタロミクスと細胞. Metal Ions in Life Sciences. 第12巻. Springer. pp. 1– 13. doi :10.1007/978-94-007-5561-1_1. ISBN 978-94-007-5560-4. PMID 23595668。電子書籍のISBN 978-94-007-5561-1 ISSN 1559-0836 電子版- ISSN 1868-0402
- 原口 秀 (2004). 「統合バイオメタル科学としてのメタロミクス」. Journal of Analytical Atomic Spectrometry . 19 : 5–14 . doi :10.1039/b308213j.
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- Shanker, AK; Djanaguiraman, M.; Venkateswarlu, B. (2009). 「植物におけるクロムの相互作用：現状と将来の戦略」. Metallomics . 1 (5): 375– 383. doi : 10.1039/b904571f . PMID 21305140.
- Szpunar, J. (2005). 「生体無機物質のスペシエーション分析における分析手法の進歩：メタロミクス、メタロプロテオミクス、ヘテロ原子タグ付きプロテオミクスおよびメタボロミクス」. The Analyst . 130 (4): 442– 465. Bibcode :2005Ana...130..442S. doi :10.1039/b418265k. PMID 15776152.
- Wackett, LP; Dodge, AG; Ellis, LBM (2004). 「微生物ゲノミクスと周期表」.応用環境微生物学. 70 (2): 647– 655. doi :10.1128/AEM.70.2.647-655.2004. PMC 348800. PMID 14766537 .
- ウィリアムズ, RJP (2001). 「細胞による元素の化学的選択」.配位化学レビュー. 216– 217: 583– 595. doi :10.1016/s0010-8545(00)00398-2.
