メタノコッカス
古細菌の属

メタノコッカス
科学的分類 この分類を編集する
ドメイン： 古細菌
王国： メタノバクテリア
門: メタノバクテリオタ
クラス： メタノコッカス
注文： メタノコッカス
家族： メタノコッカス科
属: メタノコッカス
・クライバーとファン・ニール 1936
タイプ種
メタノコッカス・ヴァニエリ
シュタットマン＆バーカー 1951
種

メタノコッカスは、メタノコッカス科に属する球状メタン生成菌の属です。 [1]好熱性のM. thermolithotrophicusと超好熱性のM. jannaschiiを除き、全て中温菌です東太平洋海膨の北緯21度に位置する「ホワイトスモーカー」煙突の基部で発見されました。 [2]これは、初めてゲノムが完全に解読された古細菌であり、多くの新規かつ真核生物に類似した要素が明らかになりました。 [3]

系統発生

現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）[4]と国立生物工学情報センター（NCBI） [5]に基づいています。

16S rRNAベースのLTP _06_2022 [6] [7] [8] 53のマーカータンパク質に基づくGTDB 08-RS214 [9] [10] [11]

メタノトリス

メタノコッカス科

メタノフェルビディコッカス

メサノサーモコッカス・サーモリトトロフィカス（基準種）

メタノコッカス

M. maripaludis Jones et al. 1984年

M. vannielii Stadtman and Barker 1951（タイプ種）

M. voltae Balch et al. 1981年末。ウォードら。 1989年

メタノコッカス科

参照

参考文献

  1. ^ NCBIのメタノコッカスに関するウェブページを参照。データは「NCBI分類リソース」から抽出。国立生物工学情報センター。2007年3月19日閲覧。
  2. ^ WJ Jones; et al. (1983年12月). 「海底熱水噴出孔から発見された極めて好熱性のメタン生成菌、新種Methanococcus jannaschii」. Arch. Microbiol . 136 (4): 254– 261. Bibcode :1983ArMic.136..254J. doi :10.1007/BF00425213. S2CID  33277659.
  3. ^ CJ Bult; et al. (1996年8月). 「メタン生成古細菌Methanococcus jannaschiiの完全ゲノム配列」. Science . 273 (5278): 1058–1073 . Bibcode :1996Sci...273.1058B. doi :10.1126/science.273.5278.1058. PMID  8688087. S2CID  41481616.
  4. ^ JP Euzéby. 「メタノコッカス目」.原核生物名一覧（LPSN）. 2013年1月27日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2011年11月17日閲覧。
  5. ^ Sayers; et al. 「Methanococcales」.国立生物工学情報センター（NCBI）分類データベース. 2011年6月5日閲覧。
  6. ^ 「The LTP」 . 2023年5月10日閲覧。
  7. ^ 「LTP_all tr​​ee in newick format」 . 2023年5月10日閲覧。
  8. ^ 「LTP_06_2022 リリースノート」(PDF) . 2023年5月10日閲覧。
  9. ^ 「GTDBリリース08-RS214」ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
  10. ^ "ar53_r214.sp_label".ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。
  11. ^ 「分類の歴史」ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。

さらに読む

  • 国際原核生物分類委員会司法委員会 (2005). 「アコレプラズマ目、ハラナエロビウム目、ハロバクテリア目、メタノバクテリア目、メタノコッカス目、メタノミクロビウム目、プランクトミセス目、プロクロラ目、スルホロバス目、サーモコッカス目、サーモプロテウス目、ヴェルルコミクロビウム目の命名上の型は、それぞれアコレプラズマ属、ハラナエロビウム属、ハロバクテリウム属、メタノバクテリウム属、メタノコッカス属、メタノミクロビウム属、プランクトミセス属、プロクロロン属、スルホロバス属、サーモコッカス属、サーモプロテウス属、ヴェルルコミクロビウム属である。意見書 79」。Int . J. Syst. Evol. Microbiol . 55 (Pt 1): 517–518 .土井: 10.1099/ijs.0.63548-0。PMID  15653928。
  • Jeanthon C; L'Haridon S; Pradel N; Prieur D (1999). 「深海熱水噴出孔から分離された超好熱性メタノコッカスの迅速同定」. Int. J. Syst. Bacteriol . 49 (2): 591– 594. doi : 10.1099/00207713-49-2-591 . PMID  10319480.
  • Keswani J; Orkand S; Premachandran U; Mandelco L; et al. (1996). 「中温性メタノコッカス属細菌の系統発生と分類、ならびにrRNA、DNAハイブリダイゼーション、および表現型解析法の比較」. Int. J. Syst. Bacteriol . 46 (3): 727– 735. doi : 10.1099/00207713-46-3-727 . PMID  8782682.
  • Wayne, LG (1986). 「1983年および1984年に公表された意見要請に対する国際細菌分類学委員会司法委員会の行動」. Int. J. Syst. Bacteriol . 36 (2): 357– 358. doi : 10.1099/00207713-36-2-357 .
  • 国際原核生物分類委員会司法委員会 (1986). 「Methanococcus属の基準種をMethanosarcina属（Methanosarcina mazei (Barker 1936) comb. nov. et emend. Mah and Kuhn 1984）に移管し、Methanococcus vannielii (Approved Lists, 1980) を基準種とするMethanococcus属（承認リスト, 1980）の保全」。Int . J. Syst. Bacteriol . 36 : 491. doi : 10.1099/00207713-36-3-491 .
  • Mah RA; Kuhn DA (1984). 「Methanococcus属の基準種をMethanosarcina属に移管し、Methanosarcina mazei (Barker 1936) comb. nov. et emend. と命名すること、およびMethanococcus vannielii (Approved Lists, 1980) を基準種としてMethanococcus属 (Approved Lists, 1980) を保存すること。意見を求める」。Int . J. Syst. Bacteriol . 34 (2): 263– 265. doi : 10.1099/00207713-34-2-263 .
  • Balch WE; Fox GE; Magrum LJ; Woses CR; et al. (1979). 「メタン生成菌：特異な生物群の再評価」Microbiol. Rev. 43 ( 2): 260– 296. doi :10.1128/MMBR.43.2.260-296.1979. PMC 281474.  PMID 390357  .
  • アレン、カイリー；ウェゲナー、グンター；ホワイト、ロバート（2014年8月8日）「メタン生成菌および嫌気性メタン資化性古細菌における複数の修飾F430補酵素の発見は、自然界におけるF430の新たな役割の可能性を示唆する」応用環境微生物学誌80 (20): 6403– 6412. Bibcode :2014ApEnM..80.6403A. doi :10.1128/AEM.02202-14. PMC 4178637.  PMID 25107965  .
  • Kluyver AJ; van Niel CB (1936). 「細菌の自然分類システムへの展望」Zentralbl. Bakterol. Parasitenkd. Infectinskr. Hyg., Abt. II . 94 : 369– 403.
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