メタノサルシナール目
メタン生成古細菌の目

メタノサルシナール目
メタノサルシナ・バルケリ MS
科学的分類 この分類を編集する
ドメイン： 古細菌
王国： メタノバクテリア
門: メタノバクテリオタ
クラス： 「メタノミクロビア」
注文： メタノサルシナ
レス ブーンら 2002
家族
同義語
  • メタノトリカレス目Akinyemi et al. 2021年

メタノサルシナール目（Methanosarcinales）は、メタノバクテリオタ門メタノミクロビア綱に属する古細菌の一種である。 [ 1]メタノサルシナール目にはメタン生成菌とメタン資化菌の両系統が含まれるが、後者についてはこれまで純粋培養された菌株は存在しない。[2]メタノサルシナール目のメタン資化菌系統は、当初好気性メタン資化細菌と区別するためにANME（嫌気性メタン資化菌）と略されていた。現在では、これらの系統はCa. Methanoperedens、Ca. Methanocomedens（ANME-2a）、Ca.Methanomarinus（ANME-2b）、Ca. Methanogaster（ANME-2c）、Ca. Methanovorans（ANME-3）といった独自の名称で呼ばれている。[3]この目には、ゲノムサイズ5,75 Mbpの最大のゲノムを持つ古細菌の1つであるメタノサルシナ・アセティボランスC2Aが含まれています。 [4]

この目に属す生物は、淡水、海水、塩分を多く含む堆積物、嫌気性消化槽、動物の消化器系に生息する。この目は中温菌、あるいは中等度好熱性、好中球性、あるいは好アルカリ性の種から構成され、中には高塩分濃度でも生育可能な種（メタノハロビウム属、メタノハロフィラス属、メタノサルサム属）も含まれる。[5] [6]この目の種のほとんどは、海洋および淡水堆積物、土壌から分離または検出されたが、動物の消化管に適応したメタニミクロコッカス属、メタノラピルス属、Ca属などの特殊な系統は、それぞれシロアリ／ゴキブリ、ヤスデ、反芻動物に見られるメタノフラスツルム属のみである。[7] [8]

ほとんどの細胞はペプチドグリカンと擬似ムレインを欠く細胞壁を持ち、メタノサルシナ属にはメタノコンドロイチンが顕著に存在する。[9]他のすべてのメタン生成菌と同様に、メタノサルシナ目（ Methanosarcinales ）は厳密な嫌気性菌であり、メタン生成経路をATP生産の唯一の経路として利用する。しかし、他のメタン生成菌に共通するH 2 / CO 2基質に加え、メタノサルシナ目は酢酸（酢酸分解性メタン生成）、メタノールやメチルアミンなどのメチル化化合物（メチロトローフ性メタン生成）、さらにはメトキシル化芳香族化合物（メトキシドトローフ性メタン生成）を利用する能力を特徴とする。[10] [11]

系統発生

16S rRNAベースのLTP _06_2022 [12] [13] [14] GTDB 10-RS226に基づく53のマーカータンパク質。 [15] [16] [17]

メテルミコッカ科

メタノサルシナール目

Methanosaetaceae [Methanotricaceae を含む]

メタノサルシナ科

メタノトリハレス

Methanotricaceae [ Methanosaetaceaeを含む]

メタノサルシナレスA

メテルミコッカ科

メタノサルシナール目

「メサノガストラセ科」（ANME-2c）

「メタノコメデント科」（ANME-2a、ANME-2b）

「エタノペレデント科」（EX4572-44）

「メタンオペレデント科」（ANME-2d、AAA）

メタノサルシナ科

メタノサルシナール目には、以下の科が含まれます (各科を構成する属は、対応する科の下にリストされています)。

メタノサルシナ科 バルチとウルフ 1981

  • メタニミクロコッカス・コリグ。シュプレンガーら。 2000年
  • メタノコッコイデス・ソワーズとフェリー 1985
  • メタノハロビウム・ジリナとザヴァルジン 1988
  • メタノハロフィラス・パテレクとスミス 1988
  • メタロバスケーニッヒとシュテッター 1983
  • メタノメチロホランLomans et al. 2004年
  • メタノサルサムブーンとベイカー 2002
  • メタノサルシナ・クライバーとファン・ニール 1936

メタノトリカ科アキニエミら2021

  • メタノスリックス・ヒューザー他1983

メテルミコッカ科チェンら2007

  • Methermicoccus Cheng et al. 2007年

参照

参考文献

  1. ^ “Order: Methanosarcinales”. lpsn.dsmz.de . 2024年9月7日閲覧。
  2. ^ Chadwick, Grayson L.; Skennerton, Connor T.; Laso-Pérez, Rafael; Leu, Andy O.; Speth, Daan R.; Yu, Hang; Morgan-Lang, Connor; Hatzenpichler, Roland; Goudeau, Danielle; Malmstrom, Rex; Brazelton, William J.; Woyke, Tanja; Hallam, Steven J.; Tyson, Gene W.; Wegener, Gunter (2022-01-05). 「比較ゲノミクスは、メタン資化性古細菌とメタン生成古細菌を区別する電子伝達と共生メカニズムを明らかにする」. PLOS Biology . 20 (1) e3001508. doi : 10.1371/journal.pbio.3001508 . ISSN  1545-7885. PMC 9012536 . PMID  34986141 . 
  3. ^ Wegener, Gunter; Laso-Pérez, Rafael; Orphan, Victoria J.; Boetius, Antje (2022-09-08). 「海洋古細菌によるアルカンの嫌気性分解」. Annual Review of Microbiology . 76 (1): 553– 577. doi :10.1146/annurev-micro-111021-045911. hdl : 10261/351814 . ISSN  0066-4227.
  4. ^ Saini, Jasleen; Deere, Thomas M.; Chanderban, Melissa; McIntosh, Gary J.; Lessner, Daniel J. (2023年3月). 「Methanosarcina acetivorans」. Trends in Microbiology . 31 (3): 320– 321. doi :10.1016/j.tim.2022.10.001. PMID  36280520.
  5. ^ Oren, Aharon (2014-08-08). 「好塩性古細菌の分類：現状と今後の課題」.極限環境細菌. 18 (5): 825– 834. doi :10.1007/s00792-014-0654-9. ISSN  1431-0651. PMID  25102811.
  6. ^ オレン、アハロン (2014)、「メタノサルシナセア科」、原核生物、ベルリン、ハイデルベルク：シュプリンガー・ベルリン・ハイデルベルク、pp.  259– 281、doi :10.1007/978-3-642-38954-2_408、ISBN 978-3-642-38953-5{{citation}}: CS1 maint: ISBNによる作業パラメータ（リンク）
  7. ^ Protasov, Evgenii; Reeh, Hanna; Liu, Pengfei; Poehlein, Anja; Platt, Katja; Heimerl, Thomas; Hervé, Vincent; Daniel, Rolf; Brune, Andreas (2024-08-06). 「節足動物の腸から単離された新規の絶対メチル還元性メタノサルシナール目（Methanolapillus gen. nov.およびMethanimicrococcus）におけるゲノム縮小」FEMS Microbiology Ecology . 100 (9). doi :10.1093/femsec/fiae111. ISSN  1574-6941. PMC 11362671. PMID 39108084  . 
  8. ^ Thomas, Courtney M.; Desmond-Le Quéméner, Elie; Gribaldo, Simonetta; Borrel, Guillaume (2022-06-10). 「動物界における腸内アーキオームの豊かさと多様性を形作る要因」. Nature Communications . 13 (1): 3358. Bibcode :2022NatCo..13.3358T. doi :10.1038/s41467-022-31038-4. ISSN  2041-1723. PMC 9187648. PMID 35688919  . 
  9. ^ Klingl, Andreas (2014年11月25日). 「S層と細胞質膜 ― 典型的な古細菌細胞壁からの例外、特に二重膜に注目」. Frontiers in Microbiology . 5 : 624. doi : 10.3389/fmicb.2014.00624 . ISSN  1664-302X. PMC 4243693. PMID 25505452  . 
  10. ^ Mand, Thomas D.; Metcalf, William W. (2019-11-20). 「メタン生成古細菌、特にMethanosarcina属におけるエネルギー保存とヒドロゲナーゼ機能」. Microbiology and Molecular Biology Reviews . 83 (4). doi :10.1128/mmbr.00020-19. ISSN  1092-2172. PMC 6759668. PMID 31533962  . 
  11. ^ Kurth, Julia M.; Op den Camp, Huub JM; Welte, Cornelia U. (2020-06-15). 「複数の方法で一つの目標達成 ― 非従来型基質からのメタン生成」.応用微生物学およびバイオテクノロジー. 104 (16): 6839– 6854. doi :10.1007/s00253-020-10724-7. ISSN  0175-7598. PMC 7374477. PMID 32542472  . 
  12. ^ 「The LTP」 . 2023年5月10日閲覧。
  13. ^ 「LTP_all tr​​ee in newick format」 . 2023年5月10日閲覧。
  14. ^ 「LTP_06_2022 リリースノート」(PDF) . 2023年5月10日閲覧。
  15. ^ 「GTDBリリース10-RS226」ゲノム分類データベース。 2025年5月1日閲覧。
  16. ^ "ar53_r226.sp_label".ゲノム分類データベース. 2025年5月1日閲覧。
  17. ^ 「分類の歴史」ゲノム分類データベース. 2025年5月1日閲覧。

さらに読む

科学雑誌

  • Cavalier-Smith, T (2002). 「古細菌のネオミュラン起源、普遍樹におけるネオミュラン的根源、そして細菌のメガ分類」. Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 52 (Pt 1): 7– 76. doi : 10.1099/00207713-52-1-7 . PMID  11837318.
  • Cavalier-Smith, T (1986). 「生物界」. Nature . 324 (6096): 416– 417. Bibcode :1986Natur.324..416C. doi :10.1038/324416a0. PMID  2431320. S2CID  5242667.

科学書

  • ブーンDR;ホイットマンWB。古賀裕（2001）。 「命令 III. メタノサルシナレス命令 11 月」。ブーン博士では。 RW カステンホルツ (編)。Bergey の系統的細菌学マニュアル 第 1 巻: 古細菌と深く分岐した光合成細菌(第 2 版)。ニューヨーク: Springer Verlag。169ページ。ISBN 978-0-387-98771-2。
  • Grant WD; Kamekura M; McGenity TJ; Ventosa A (2001). 「クラスIII. Halobacteria class. nov.」. DR Boone; RW Castenholz (編). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria (第2版). ニューヨーク: Springer Verlag. pp. 169. ISBN 978-0-387-98771-2。
  • Garrity GM; Bell JA; Lilburn TG (2004). 「原核生物の分類学的概要」. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, release 4.0 (第2版). ニューヨーク: Springer Verlag. doi :10.1007/bergeysoutline200310 (2025年7月12日現在非アクティブ).{{cite book}}: CS1 maint: DOIは2025年7月時点で非アクティブです（リンク）バージョン5.0。
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