miR-338

miR-338
miR-338
	miR-338マイクロRNA前駆体の保存された二次構造
識別子
シンボル	miR-338
代替記号	MIR338
Rfam	RF00686
miRBase	MI0000814
miRBaseファミリー	MIPF0000097
NCBI遺伝子	442906
HGNC	31775
オミム	614059
参照シーケンス	NR_029897
その他のデータ
RNA型	miRNA
ドメイン	哺乳類
行く	0035195
それで	0001244
軌跡	第17章 25節第3節
PDB構造	PDBe

Family of brain-specific microRNA precursors

RNA family

miR-338は、ヒトを含む哺乳類に見られる脳特異的なマイクロRNA前駆体ファミリーです。^[1]約22 ヌクレオチドの成熟miRNA配列は、酵素ダイサーによって前駆体ヘアピンから切り出されます。^{[2]この配列は}RISCと結合し、 RNA干渉を引き起こします。^[3]

miR-338は、アポトーシス関連チロシンキナーゼ（AATK ）遺伝子内のイントロン領域に位置している。AATKの発現に下流で悪影響を及ぼす遺伝子の発現をダウンレギュレーションする可能性があると予測されている。^[4]

関数

miR-338は、シトクロムc酸化酵素IV（COX4）の発現を制御する脳特異的なmiRNAである。 ^[1]^[5]成熟したmiR-338 miRNA配列は、 COX4 mRNAの 3'非翻訳領域の短い部分と相補的である。このmRNA配列はステムループ構造上に存在し、miRNAプロセシングにアクセスできることを示唆している。^[5]

アプリケーション

miR-338は神経芽腫で調節不全を示しており、バイオマーカーや将来の治療薬として利用できる可能性がある。^{[6] miR-338は}肝細胞癌とも関連付けられており、組織サンプル中のmiR-338発現を測定する大規模な診断検査が提案されている。^{[7]さらに、miR-338は、発現プロファイルを組み合わせることで}胃癌患者の生存確率を予測できる7つのマイクロRNAの1つである。^[8]

参考文献

^ ab Aschrafi A, Schwechter AD, Mameza MG, Natera-Naranjo O, Gioio AE, Kaplan BB (2008年11月). 「MicroRNA-338は交感神経ニューロンの軸索における局所的なシトクロムc酸化酵素IV mRNAレベルと酸化的リン酸化を制御する」The Journal of Neuroscience . 28 (47): 12581–90 . doi :10.1523/JNEUROSCI.3338-08.2008. PMC 3496265. PMID 19020050 .
^ Ambros V (2001年12月). 「マイクロRNA：大きな可能性を秘めた小さな調節因子」. Cell . 107 (7): 823–6 . doi : 10.1016/S0092-8674(01)00616-X . PMID 11779458. S2CID 14574186.
^ Gregory RI, Chendrimada TP, Cooch N, Shiekhattar R (2005年11月). 「ヒトRISCはマイクロRNAの生合成と転写後遺伝子サイレンシングを結びつける」. Cell . 123 (4): 631–40 . doi : 10.1016/j.cell.2005.10.022 . PMID 16271387. S2CID 16973870.
^ Barik S (2008年9月). 「イントロンマイクロRNAは宿主遺伝子と機能的に拮抗する遺伝子をサイレンシングする」. Nucleic Acids Research . 36 (16): 5232–41 . doi :10.1093/nar/gkn513. PMC 2532712. PMID 18684991 .
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^ ラグーザ M、マジョラナ A、バネッリ B、バルバガッロ D、スタテッロ L、カシャーノ I、グリエルミーノ MR、ドゥーロ LR、スカリア M、マグロ G、ディピエトロ C、ロマーニ M、ピュレッロ M (2010 年 10 月)。「ヒトの位置的および機能的神経芽腫の候補である MIR152、MIR200B、および MIR338 は、神経芽細胞の分化とアポトーシスに関与しています。」分子医学ジャーナル。88 (10): 1041–53 .土井:10.1007/s00109-010-0643-0。PMID 20574809。S2CID 22215883 。
^ Huang XH, Wang Q, Chen JS, Fu XH, Chen XL, Chen LZ, Li W, Bi J, Zhang LJ, Fu Q, Zeng WT, Cao LQ, Tan HX, Su Q (2009年8月). 「肝細胞癌におけるマイクロRNA発現のビーズベースマイクロアレイ解析：miR-338のダウンレギュレーション」. Hepatology Research . 39 (8): 786–94 . doi : 10.1111/j.1872-034X.2009.00502.x . PMID 19473441. S2CID 11863697.
^ Li X, Zhang Y, Zhang Y, Ding J, Wu K, Fan D (2010年5月). 「7種類のマイクロRNAシグネチャーによる胃癌の生存予測」. Gut . 59 (5): 579–85 . doi :10.1136/gut.2008.175497. PMID 19951901. S2CID 25196666.

さらに読む

He QY, Peng GP, Liu WX, Luo BY (2010年11月). 「[microRNA-338とその潜在的標的タンパク質eiF4E3との相互作用]」.浙江大学学報. Yi Xue Ban = 浙江大学医学誌. 39 (6): 583–8 . doi :10.3785/j.issn.1008-9292.2010.06.006. PMID 21166051.（中国語）
Saba R, Goodman CD, Huzarewich RL, Robertson C, Booth SA (2008). Akbarian S (編). 「プリオン誘発性神経変性におけるmiRNAシグネチャー」. PLOS ONE . 3 (11) e3652. Bibcode :2008PLoSO...3.3652S. doi : 10.1371/journal.pone.0003652 . PMC 2575400. PMID 18987751 .

外部リンク

RfamのmicroRNA mir-338のページ

[Asc08-1] Aschrafi A, Schwechter AD, Mameza MG, Natera-Naranjo O, Gioio AE, Kaplan BB (2008年11月). 「MicroRNA-338は交感神経ニューロンの軸索における局所的なシトクロムc酸化酵素IV mRNAレベルと酸化的リン酸化を制御する」The Journal of Neuroscience . 28 (47): 12581–90 . doi :10.1523/JNEUROSCI.3338-08.2008. PMC 3496265. PMID 19020050 .

[2] Ambros V (2001年12月). 「マイクロRNA：大きな可能性を秘めた小さな調節因子」. Cell . 107 (7): 823–6 . doi : 10.1016/S0092-8674(01)00616-X . PMID 11779458. S2CID 14574186.

[3] Gregory RI, Chendrimada TP, Cooch N, Shiekhattar R (2005年11月). 「ヒトRISCはマイクロRNAの生合成と転写後遺伝子サイレンシングを結びつける」. Cell . 123 (4): 631–40 . doi : 10.1016/j.cell.2005.10.022 . PMID 16271387. S2CID 16973870.

[4] Barik S (2008年9月). 「イントロンマイクロRNAは宿主遺伝子と機能的に拮抗する遺伝子をサイレンシングする」. Nucleic Acids Research . 36 (16): 5232–41 . doi :10.1093/nar/gkn513. PMC 2532712. PMID 18684991 .

[Kap09-5] Kaplan BB, Gioio AE, Hillefors M, Aschrafi A (2009). 「軸索タンパク質合成とミトコンドリア局所機能の制御」.軸索の細胞生物学. 細胞分化における成果と課題. 第48巻. pp. 225–42 . doi :10.1007/400_2009_1. ISBN 978-3-642-03018-5. PMC 2786086 . PMID 19343315 .

[6] ラグーザ M、マジョラナ A、バネッリ B、バルバガッロ D、スタテッロ L、カシャーノ I、グリエルミーノ MR、ドゥーロ LR、スカリア M、マグロ G、ディピエトロ C、ロマーニ M、ピュレッロ M (2010 年 10 月)。「ヒトの位置的および機能的神経芽腫の候補である MIR152、MIR200B、および MIR338 は、神経芽細胞の分化とアポトーシスに関与しています。」分子医学ジャーナル。88 (10): 1041–53 .土井:10.1007/s00109-010-0643-0。PMID 20574809。S2CID 22215883 。

[7] Huang XH, Wang Q, Chen JS, Fu XH, Chen XL, Chen LZ, Li W, Bi J, Zhang LJ, Fu Q, Zeng WT, Cao LQ, Tan HX, Su Q (2009年8月). 「肝細胞癌におけるマイクロRNA発現のビーズベースマイクロアレイ解析：miR-338のダウンレギュレーション」. Hepatology Research . 39 (8): 786–94 . doi : 10.1111/j.1872-034X.2009.00502.x . PMID 19473441. S2CID 11863697.

[8] Li X, Zhang Y, Zhang Y, Ding J, Wu K, Fan D (2010年5月). 「7種類のマイクロRNAシグネチャーによる胃癌の生存予測」. Gut . 59 (5): 579–85 . doi :10.1136/gut.2008.175497. PMID 19951901. S2CID 25196666.