酸性微生物

酸性微生物
アシディミクロビウム・フェロオキシダンス
科学的分類
ドメイン：	細菌
王国：	バチラッティ
門:	放線菌 ノリス 2013 [3]
クラス：	アシディマイクロ ビイア・スタックブラントら 1997 [1] [2]
家族[4]
酸性微生物 アシディミクロビア科 「アクチノマリニコラ科」 「アルデヒレスピラト科」 「ホパノイディボラ科」 イアミ科 イルマトバクター科 「ミクロトリク科」 「Poriferisodalaceae」 「ラブドテルミンコラ科」 「サリニラクストリトリカ科」 「アクチノマリナレス目」 「アクチノマリナ科」 「海綿動物目」 「ベントバクター科」 「スポンジイソシア科」
同義語
アシドミクロビイデ科Rainey & Ward-Rainey 1997 「Actinomarinidae」Ghai et al. 2013

アキディミクロビウム目は放線菌綱の一種で、3科8属9種が記載されており、アキディミクロビウム・フェロオキシダンスはこの目の基準種である。^[1]

系統発生

現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）^[2]と国立生物工学情報センター（NCBI） ^[4]に基づいています。

MLSTに基づく30種類のタンパク質の系統発生。[5]	16S rRNAベースのLTP _10_2024 [6] [7] [8]
酸性微生物 アシディテリモナス アシディミクロビア科 アシディスリックス フェリトリックス フェリミクロビウム アシディミクロビウム イアミ科 アキハビタンス イアミア イルマトバクター科 イルマトバクター 「ミクロトリク科」 「リムノスフェラ紀」 「Ca. Neomicrothrix」	酸性微生物 イアミ科 アキハビタンス イアミア アクチノマリニコラ ラブドテルミンコラ イルマトバクター科 デセルティモナス イルマトバクター アシディミクロビア科 Acidiferrimicrobium González et al. 2020年 アシディテリモナス アシディスリックス フェリトリックス フェリミクロビウム アシディミクロビウム 酸性微生物

120マーカータンパク質ベースのGTDB 09-RS220 [9] [10] [11]

酸性微生物 「アクチノマリナレス目」 「アクチノマリナ科」 Ca. "Actinomarina" Ghai et al. 2013 「海綿動物目」 「スポンジイソシア科」 Ca.「スポンジソシウス」グエン 2022 「ベントバクター科」 Ca.「ベンソバクター」Silva-Solar et al. 2024 [ジャヒール01] Ca.「ハダリバクター」Silva-Solarら。 2024年[B3-G11] 酸性微生物 UBA8190 Aciditerrimonas Itoh et al. 2011年 アシディミクロビア科 アシディスリックス ジョーンズ＆ジョンソン 2022 フェリトリックス ・ジョンソン他 2009 フェリマイクロビウム ・ジョンソン他 2009 アシディミクロビ ウム クラーク＆ノリス 1996 イルマトバクター科 デセルティモナス・ アセム他 2018 イルマトバクター ・マツモトら 2009 「Poriferisodalaceae」 「Ca. Poriferisodalis」グエン 2022 「ホパノイディボラ科」 「Ca. Hopanoidivorans」グエン 2022 「アクチノマリニコラ科」 アクチノマリニコラ He et al. 2020 「ラブドテルミンコラ科」 Rhabdothermincola Liu et al. 2021年 イアミ科 アキハビタンス ジン他 2013 イアミア・ クラハシ他 2009 「ミクロトリク科」 " Ca. Neomicrothrix" corrig. Blackall et al. 1996 [" Ca. Microthrix " Blackall et al. 1996 non Ragonot 1888 ] 「アルデヒレスピラト科」 「Ca. Aldehyrespirator」グエン 2022 ビン134 「Ca. Poriferisocius」グエン 2022

Genera incertae sedis

• 酸性微生物
  • アシディチオミクロビ ウム デイビス・ベルマー＆ノリス 2009
  • 「Salinilacustritrichaceae」Gao et al. 2024
    • 「サリニラクストリスリックス」ガオら 2024
  • 「ミクロトリク科」
    • 「カンディダトゥス・リムノスファエラ」キム、カン＆チョー 2017

参照

• 細菌属の一覧
• 細菌目一覧

参考文献

1. Stackebrandt, E.; Rainey, FA; Ward-Rainey, NL (1997-04-01). 「新しい階層的分類システムの提案、Actinobacteria classis nov」 . International Journal of Systematic Bacteriology . 47 (2): 479– 491. doi :10.1099/00207713-47-2-479. ISSN  0020-7713.
2. AC Parte; et al. "Acidimicrobiia".原核生物名一覧（LPSN） . 2025年2月28日閲覧。
3. Norris PR (2012). 「クラスII. Acidimicrobiiaクラス. nov.」 Goodfellow M, Kämpfer P, Trujillo ME, Ludwig W, Whitman WB (編). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology . 第5巻（放線菌）、パートB（第2版）. ニューヨーク: Springer. p. 1968.
4. CL Schoch; et al. 「Acidimicrobiia」.国立生物工学情報センター（NCBI）分類データベース. 2025年2月28日閲覧。
5. Hu D, Cha G, Gao B. (2018). 「Acidimicrobiia綱の系統ゲノムおよび分子マーカーに基づく解析」. Frontiers in Microbiology . 9 : 987. doi : 10.3389/fmicb.2018.00987 . PMC 5962788. PMID  29867887 . 
6. 「The LTP」 . 2024年12月10日閲覧。
7. 「LTP_all tr​​ee in newick format」 . 2024年12月10日閲覧。
8. 「LTP_10_2024 リリースノート」(PDF) . 2024年12月10日閲覧。
9. 「GTDBリリース09-RS220」ゲノム分類データベース。 2024年5月10日閲覧。
10. "bac120_r220.sp_labels".ゲノム分類データベース. 2024年5月10日閲覧。
11. 「分類の歴史」ゲノム分類データベース. 2024年5月10日閲覧。