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| コンテンツ | |
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| 説明 | 比較タンパク質構造モデルのデータベース |
| 接触 | |
| 研究センター | カリフォルニア大学サンフランシスコ校 |
| 研究室 | バイオエンジニアリング・治療科学科 |
| 著者 | ウルスラ・ピーパー、エスワル・ナラヤナン、ベン・ウェッブ、アンドレイ・サリ |
| 主な引用 | ピーパーら（2011）[1] |
| 発売日 | 1998 |
| アクセス | |
| Webサイト | http://salilab.org/modbase |
| ダウンロードURL | ftp://salilab.org/databases/modbase |
| ウェブサービスURL | http://salilab.org/modweb |
ModBaseは、380万以上のユニークなタンパク質配列モデルを含む、注釈付き比較タンパク質構造モデルのデータベースです。 [1]モデルは、 MODELLERプログラムをベースにした比較モデリングパイプラインModPipeによって作成されます。
ModBaseは、 UCSFのAndrej Sali研究室で開発されています。ModBaseモデルは、Protein Model Portalからもアクセスできます。
参照
参考文献
- ^ ab Pieper, Ursula; Webb Benjamin M; Barkan David T; Schneidman-Duhovny Dina; Schlessinger Avner; Braberg Hannes; Yang Zheng; Meng Elaine C; Pettersen Eric F; Huang Conrad C; Datta Ruchira S; Sampathkumar Parthasarathy; Madhusudhan Mallur S; Sjölander Kimmen; Ferrin Thomas E; Burley Stephen K; Sali Andrej (2011年1月). 「ModBase：注釈付き比較タンパク質構造モデルおよび関連リソースのデータベース」Nucleic Acids Res . 39 (データベース号). イギリス: D465-74. doi :10.1093/nar/gkq1091. PMC 3013688. PMID 21097780 .
外部リンク
- http://salilab.org/modbase
