分子相互作用マップ

分子相互作用マップ（MIM）は、細胞や分子の相互作用を表すグラフィック表記法です。1999年にKurt W. Kohnによって作成されました。^{[ 1 ]} MIM表記法は、多タンパク質複合体、タンパク質修飾、および他の酵素の基質となる酵素を含むネットワークを明確に表現できます。このグラフィック表現により、特定の分子が関与する可能性のある多くの相互作用のすべてを表示できるほか、生体調節ネットワークでよく見られる競合する相互作用を描写できます。データベースへのリンクを容易にするため、各分子種は1つの図に1つだけ表示されます。MIM表記法は、システム生物学で研究される生化学および細胞プロセスを表す図を標準化する国際的な取り組みであるシステム生物学グラフィカル表記法（SBGN）コンソーシアムの基礎となっており、MIM表記法のさらなる開発は同コンソーシアムと連携して行われています。表記法の更新版は2006年に公開されました。^{[ 2 ]}

解釈モード

• 明示的: 状態は明示的に示された相互作用からのみ存在する
• ヒューリスティック: エンティティは、明示的に示されていない状態も起こり得る状態のプールとして扱われます。
• 組み合わせ論的：ヒューリスティックに似ていますが、すべての状態が発生すると仮定します。MIM表記法の組み合わせ論的解釈は、2006年の出版物で説明されています。^{[ 3 ]}

関連メタデータ

MIM図には通常、図内の相互作用を説明した科学論文への引用とコメントが添付されています。さらに、図には、図上の要素と、HUGO遺伝子命名委員会によって定義された遺伝子名などの一般的に使用される識別子を関連付けたリストが添付されています。

外部リンク

• 分子相互作用マップのホームページ

参考文献

1. Kohn KW. 哺乳類の細胞周期制御とDNA修復システムの分子相互作用マップ. Mol Biol Cell (1999)
2. Kohn KW, Aladjem MI, Weinstein JN, Pommier Y. 生体調節ネットワークの分子相互作用マップ：システム生物学のための一般論. Mol Biol Cell (2006) doi : 10.1091/mbc.E05-09-0824
3. Kohn KW, Aladjem MI, Kim S, Weinstein JN, Pommier Y. 分子相互作用マップ表記法による組み合わせ複雑性の描写. Mol Syst Biol. 2006;2:51. (2006) doi : 10.1038/msb4100088