| モル* | |
|---|---|
| リポジトリ |
|
| 書かれた | タイプスクリプト |
| ミドルウェア | Reactフレームワーク |
| エンジン | ウェブGL |
| タイプ | 分子モデリング |
| ライセンス | MITライセンス |
| Webサイト | モルスター |
Mol*（/ ˈ m oʊ l ˌ s t ɑːr / 、 Molstarとも呼ばれる）は、高分子構造の解析と視覚化のためのウェブベースのオープンソースソフトウェアツールキットです。 [1]これは、 RCSB PDBとPDBeの共同イニシアチブとして、NGL（RCSB PDBが開発）とLiteMol（PDBeが開発）ビューアをベースに開発されました。高分子構造を3Dで対話的に表示するためのプログラムであるMol* Viewerは、2021年に公開されました。[2] Mol* Viewer（通常は単にMol*と呼ばれる）にはスタンドアロンバージョンがあり、多くの科学ツールやデータベースにも統合されています。[3]最も顕著な実装としては、PDBe、RCSB PDB、AlphaFoldデータベースのウェブページが挙げられます。これらのデータベースでは、各構造に対応するエントリページですべての構造の視覚化を提供するために使用されています。[4] 2019年にRCSB PDBとPDBeで以前使用されていた統合型NGLビューアとLiteMolビューアに取って代わりました。[5]
Mol*のコード（Mol* Viewerを含む）はGitHub（オープンソースMITライセンス）でホストされており、公開データベースから高分子構造データを取得し、それを圧縮、保存、視覚化するためのモジュールが含まれています。[6]大規模な構造の処理を支援するために組み込みのBinaryCIFと解凍サポート、 Webアプリケーション開発用のTypeScript、ハードウェアアクセラレーションによる3Dレンダリング用のWebGLを使用しています。 [2]オープンウェブプラットフォームの標準に準拠しており、Reactフレームワークを使用しています。[2]
参考文献
- ^ "Mol*". molstar.org . 2025年5月28日閲覧。
- ^ abc セーナル、デヴィッド;ビットリッチ、セバスチャン。デシュパンデ、マンダール。スヴォボドヴァ、ラドカ。ベルカ、カレル。バズギエ、ヴァーツラフ。サミール州ヴェランカー。バーリー、スティーブン K.コチャ、ヤロスラフ。ローズ、アレクサンダー S. (2021-07-02)。 「Mol* Viewer: 大きな生体分子構造の 3D 視覚化と分析のための最新の Web アプリ」。核酸研究。49 (W1)：W431～W437。土井：10.1093/nar/gkab314。ISSN 1362-4962。PMC 8262734。PMID 33956157。
- ^ 「統合 - Mol*ビューアドキュメント」. molstar.org . 2025年5月28日閲覧。
- ^ 「Mol* Viewer：大規模生体分子構造の3D可視化と解析のための最新ウェブアプリ」www.rcsb.org . 2025年5月28日閲覧。
- ^ 「Mol*の紹介：RCSB PDBおよびPDBeにおけるブラウザでの高速でインタラクティブな3D視覚化 | 欧州タンパク質データバンク」www.ebi.ac.uk . 2025年5月28日閲覧。
- ^ デヴィッド・セーナル;ビットリッチ、セバスチャン。デシュパンデ、マンダール。スヴォボドヴァ、ラドカ。ベルカ、カレル。バズギエ、ヴァーツラフ。サミール州ヴェランカー。バーリー、スティーブン・K; Koča、Jaroslav (2021 年 7 月)、「Mol* Viewer: 3D 視覚化および大規模な生体分子構造の分析のための最新の Web アプリ」、Nucleic Acids Research、49 (W1): W431 – W437、doi :10.1093/nar/gkab314、PMC 8262734、PMID 33956157 、2025-05-28 に取得
