ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| NFYB |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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1N1J、4AWL、4CSR |
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| 識別子 |
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| エイリアス | NFYB、CBF-A、CBF-B、HAP3、NF-YB、核転写因子Yサブユニットβ |
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| 外部ID | オミム:189904; MGI : 97317;ホモロジーン: 38149;ジーンカード:NFYB; OMA :NFYB - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 10番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 10 C1|10 40.25 cM | 始める | 82,584,535 bp [2] |
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| 終わり | 82,599,978 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 神経節隆起
- アキレス腱
- 心室帯
- 内皮細胞
- 右冠動脈
- 精嚢
- 左冠動脈
- 脛骨動脈
- 下行胸部大動脈
- S状結腸の筋層
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| | 上位の表現 | - 原始的な条線
- 胚葉上層
- 神経節隆起
- 球形嚢
- 耳小胞
- 胚
- 心室帯
- 上顎突出
- 吻側回遊流
- 海馬固有部I領域
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合転写因子活性
- 配列特異的DNA結合
- タンパク質結合
- タンパク質ヘテロ二量体形成活性
- DNA結合
- RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- タンパク質含有複合体結合
| | 細胞成分 |
- タンパク質-DNA複合体
- 核質
- CCAAT結合因子複合体
- 核
- RNAポリメラーゼII転写調節因子複合体
| | 生物学的プロセス |
- 転写の正の制御、DNAテンプレート
- 転写、DNAテンプレート
- 転写の制御、DNAテンプレート
- コレステロール生合成プロセスの調節
- 白血病阻害因子に対する細胞応答
- RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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核転写因子Yサブユニットβは、ヒトではNFYB遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、三量体複合体の1つのサブユニットであり、様々な遺伝子のプロモーター領域にあるCCAATモチーフに高い特異性で結合する、高度に保存された転写因子を形成します。この遺伝子産物であるサブユニットBは、サブユニットCと強固な二量体を形成します。これはサブユニットAとの結合の前提条件です。結果として生じる三量体は、高い特異性および親和性でDNAに結合します。サブユニットBとCはそれぞれヒストン様モチーフを含んでいます。これらのサブユニットのヒストンとしての性質は、タンパク質配列のアライメントと変異体を用いた実験という2つの証拠によって裏付けられています。[7]
相互作用
NFYB は以下と相互作用することが示されています。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000120837 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000020248 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Li XY, Mattei MG, Zaleska-Rutczynska Z, Hooft van Huijsduijnen R, Figueroa F, Nadeau J, Benoist C, Mathis D (1992年3月). 「転写因子NF-Yのサブユニットの一つは、マウスおよびヒト染色体において主要組織適合遺伝子複合体の近傍に位置する」. Genomics . 11 (3): 630–4 . doi :10.1016/0888-7543(91)90070-U. PMID 1774067.
- ^ Maity SN, de Crombrugghe B (1998年6月). 「転写におけるCCAAT結合タンパク質CBF/NF-Yの役割」. Trends Biochem Sci . 23 (5): 174–8 . doi :10.1016/S0968-0004(98)01201-8. PMID 9612081.
- ^ 「Entrez Gene: NFYB 核転写因子Y、ベータ」。
- ^ Imbriano C, Bolognese F, Gurtner A, Piaggio G, Mantovani R (2001年7月). 「HSP-CBFはNF-Y依存性の熱ショックプロモーターCCAATボックスのコアクチベーターである」. J. Biol. Chem . 276 (28): 26332–9 . doi : 10.1074/jbc.M101553200 . hdl : 11380/303761 . PMID 11306579.
- ^ Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (1997年3月). 「ヒトT細胞リンパ球向性ウイルス1型Tax1タンパク質とCCAAT結合タンパク質NF-Yの物理的および機能的相互作用」. Mol. Cell. Biol . 17 (3): 1236–43 . doi :10.1128/mcb.17.3.1236. PMC 231848. PMID 9032250 .
- ^ Izumi H, Molander C, Penn LZ, Ishisaki A, Kohno K, Funa K (2001年4月). 「PDGFβ受容体に対するc-Mycによる転写抑制のメカニズム」. J. Cell Sci . 114 (Pt 8): 1533–44 . doi :10.1242/jcs.114.8.1533. PMID 11282029.
- ^ Bellorini M, Lee DK, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (1997年6月). 「CCAAT結合NF-Y-TBP相互作用:NF-YBおよびNF-YCは、TBP塩基性残基との結合にヒストンフォールドモチーフに隣接する短いドメインを必要とする」. Nucleic Acids Res . 25 (11): 2174–81 . doi :10.1093/nar/25.11.2174. PMC 146709. PMID 9153318 .
さらに読む
- Lloberas J, Soler C, Celada A (1998). 「主要組織適合遺伝子複合体IAβ遺伝子の抑制機構」.免疫生物学. 198 ( 1–3 ): 249–63 . doi :10.1016/s0171-2985(97)80045-9. PMID 9442396.
- Mantovani R (1999). 「CCAAT結合因子NF-Yの分子生物学」. Gene . 239 (1): 15– 27. doi :10.1016/S0378-1119(99)00368-6. PMID 10571030.
- Li XY, Mantovani R, Hooft van Huijsduijnen R, Andre I, Benoist C, Mathis D (1992). 「CCAAT結合転写因子NF-Yの進化的変異」. Nucleic Acids Res . 20 (5): 1087–91 . doi :10.1093/nar/20.5.1087. PMC 312095. PMID 1549471 .
- Li XY, Hooft van Huijsduijnen R, Mantovani R, Benoist C, Mathis D (1992). 「NF-Y遺伝子のイントロン-エクソン構造.組織特異的スプライシングによる活性化ドメインの修飾」. J. Biol. Chem . 267 (13): 8984–90 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)50377-5 . PMID 1577736.
- Lloberas J, Maki RA, Celada A (1995). 「dbpAおよびdbpB(mYB-1)タンパク質による主要組織適合性複合体IAβ遺伝子発現の抑制」. Mol. Cell. Biol . 15 (9): 5092–9 . doi :10.1128/mcb.15.9.5092. PMC 230756. PMID 7651426 .
- Chang ZF, Liu CJ (1994). 「ヒトチミジンキナーゼCCAAT結合タンパク質はNF-Yであり、そのAサブユニットの発現はヒトIMR-90二倍体線維芽細胞における血清依存的である」. J. Biol. Chem . 269 (27): 17893–8 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)32393-1 . PMID 8027044.
- Mantovani R、Li XY、Pessara U、Hooft van Huisjduijnen R、Benoist C、Mathis D (1994)。 「NF-YAのドミナントネガティブ類似体」。J.Biol.化学。269 (32): 20340– 6.土井: 10.1016/S0021-9258(17)31997-X。PMID 8051128。
- Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (1997). 「ヒトT細胞リンパ球向性ウイルス1型Tax1タンパク質とCCAAT結合タンパク質NF-Yの物理的および機能的相互作用」. Mol. Cell. Biol . 17 (3): 1236–43 . doi :10.1128/mcb.17.3.1236. PMC 231848. PMID 9032250 .
- Bellorini M, Lee DK, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (1997). 「CCAAT結合によるNF-Y-TBP相互作用:NF-YBおよびNF-YCは、TBP塩基性残基との結合にヒストンフォールドモチーフに隣接する短いドメインを必要とする」Nucleic Acids Res . 25 (11): 2174–81 . doi :10.1093/nar/25.11.2174. PMC 146709. PMID 9153318 .
- Currie RA (1998). 「NF-YのDNA結合サブユニット三量体化ドメインと高移動度群タンパク質HMG-I(Y)との機能的相互作用」. J. Biol. Chem . 272 (49): 30880–8 . doi : 10.1074/jbc.272.49.30880 . PMID 9388234.
- Currie RA (1998). 「NF-YはヒストンアセチルトランスフェラーゼGCN5およびP/CAFと関連する」J. Biol. Chem . 273 (3): 1430–4 . doi : 10.1074/jbc.273.3.1430 . PMID 9430679.
- Currie RA (1998). 「Bリンパ球発達におけるNF-Y転写因子複合体の生化学的特徴」J. Biol. Chem . 273 (29): 18220–9 . doi : 10.1074/jbc.273.29.18220 . PMID 9660784.
- Bemark M, Olsson H, Heinegård D, Leanderson T (1998). 「SP6カッパプロモーターに結合するタンパク質の精製と特性解析。カッパ転写におけるCArGボックス結合因子Aの潜在的役割」J. Biol. Chem . 273 (30): 18881–90 . doi : 10.1074/jbc.273.30.18881 . PMID 9668064.
- Faniello MC, Bevilacqua MA, Condorelli G, de Crombrugghe B, Maity SN, Avvedimento VE, Cimino F, Costanzo F (1999). 「CAAT結合因子NFYのBサブユニットはコアクチベーターp300の中央セグメントに結合する」. J. Biol. Chem . 274 (12): 7623–6 . doi : 10.1074/jbc.274.12.7623 . PMID 10075648.
- Hake SB, Masternak K, Kammerbauer C, Janzen C, Reith W, Steimle V (2000). 「CIITAロイシンリッチリピートは核局在、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)クラスIIエンハンセオソームへのin vivoリクルート、およびMHCクラスII遺伝子のトランス活性化を制御する」Mol. Cell. Biol . 20 (20): 7716–25 . doi :10.1128/MCB.20.20.7716-7725.2000. PMC 86349. PMID 11003667 .
- Liang F, Schaufele F, Gardner DG (2001). 「NF-YとSp1の機能的相互作用はA型ナトリウム利尿ペプチド受容体遺伝子の転写に必須である」. J. Biol. Chem . 276 (2): 1516–22 . doi : 10.1074/jbc.M006350200 . PMID 11022037.
- 泉 浩, Molander C, Penn LZ, Ishisaki A, Kohno K, Funa K (2001). 「c-MycによるPDGFβ受容体の転写抑制機構」J. Cell Sci . 114 (Pt 8): 1533–44 . doi :10.1242/jcs.114.8.1533. PMID 11282029.
外部リンク
この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。