ナトリアルバ
Genus of archaea

ナトリアルバ
科学的分類 この分類を編集する
ドメイン： 古細菌
王国： メタノバクテリア
門: メタノバクテリオタ
クラス： ハロバクテリア
注文： ナトリアルバレス
家族： ナトリアルバ科
属: ナトリアルバ
亀倉とダイオール・スミス 1996 [1]
タイプ種
ナトリアルバ・アジアティカ
亀倉＆ダイアル・スミス 1996
種

ナトリアルバは、ナトリアルバ科に属する古細菌の一種です。 [4]この属には、極端な環境ニッチでも生存できる多様な種が含まれており、特に塩分が飽和またはほぼ飽和した水域（好塩菌）でも生存することができます。 [5] [6]ナトリアルバは、塩分を多く含む環境に適応しています。例えば、細胞機構は表面に荷電アミノ酸を配することで高塩濃度に適応しており、細胞はこれらの成分の周囲に水分子を保持することができます。浸透圧とこれらのアミノ酸は、細胞内の塩分量を制御するのに役立ちます。 [7]

例えば、N. magadiiは好気性化学有機栄養性の二重極限環境細菌であり、最適な成長にはアルカリ性条件と高塩分条件を必要とする。これらの厳しい条件は、タンパク質中の荷電アミノ酸の組成の変化（平均等電点はわずか 4.64 であるのに対し、他の生物の平均は 6.5）をもたらし、ほぼすべてのタンパク質が高度に酸性である。[8] N. magadiiのゲノムは、総配列 4,443,643 bp の 4 つのレプリコンで構成され、4,212 個の推定タンパク質をコードしている。ゲノム解析により、高塩分への適応、ストレス応答、グリコシル化、および多糖類生合成に関与する推定タンパク質をコードする複数の遺伝子が特定された。さらに、プロトン駆動型ATP 合成酵素や、好気呼吸や電子伝達に必要なさまざまな推定シトクロムやその他のタンパク質が見つかっている。ゲノムは、多数の推定プロテアーゼ/ ペプチダーゼをコードしている。[9]

塩に対する耐性により、この属の一部の菌はバイオテクノロジーのプロセスに利用することができる。[10]

系統発生

現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）[11]と国立生物工学情報センター（NCBI） [4]に基づいています。

16S rRNAベースのLTP _10_2024 [12] [13] [14] GTDB 10-RS226に基づく53のマーカータンパク質[15] [16] [17]
ナトリアルバ

N. swarupiae Kajale et al. 2020年

ナトラルケオビウス・キチニボランス ・コルリグ。ソローキンら。 2020年

N. アジアティカ 亀倉 & ダイオール・スミス 1996

N. aegyptia corrig。ヘザイエンら。 2001年

N. taiwanensis Hezayen et al. 2001年

N. チャハンナオエンシス Xu et al. 2001年

N. hulunbeirensis Xu et al. 2001年

N. magadii (Tindall et al. 1984) 亀倉ら。 1997年

ナトリアルバ

N. マガディ

N. チャハンナオエンシス[「ナトロノバクテリウム チャハンナオエンシス」 Wang & Tang 1989 ]

N. hulunbeirensis [" Natronobacterium chagannuoerensis " Wang & Tang 1989 ]

参照

参考文献

  1. ^ 亀倉正史;妹尾裕子；ダイオール・スミス、M. (1996-05-23)。 「ハロリシン R4、好塩性古細菌 Haloferax mediterranei 由来のセリン プロテイナーゼ、遺伝子クローニング、発現および構造研究」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - タンパク質構造と分子酵素学。1294 (2): 159–167。土井:10.1016/0167-4838(96)00016-7。ISSN  0006-3002。PMID  8645734。
  2. ^ Hezayen, FF; Rehm, BH; Tindall, BJ; Steinbüchel, A (2001). 「Natrialba asiatica B1TのNatrialba taiwanensis sp. nov.への移行と、細胞外ポリグルタミン酸を生成するエジプト産の新規な極度好塩性、好気性、無色素古細菌Natrialba aegyptiaca sp. nov.の記載」International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 51 (3): 1133– 1142. doi : 10.1099/00207713-51-3-1133 . PMID  11411682.
  3. ^ Xu、Y.;ワン、Z。シュエ、Y.周、Ｐ． 5月。;ヴェントーサ、A.グラント、WD (2001 年 9 月)。 「Natrialba hulunbeirensis sp. nov. および Natrialba chahannaoensis sp. nov.、中国内モンゴル自治区のソーダ湖由来の新規好塩アルカリ性古細菌」。系統的および進化的微生物学の国際ジャーナル。51 (Pt 5): 1693 ～ 1698 年。土井: 10.1099/00207713-51-5-1693。ISSN  1466-5026。PMID  11594597。
  4. ^ ab Sayers; et al. "Natrialba".国立生物工学情報センター（NCBI）分類データベース. 2023年10月10日閲覧。
  5. ^ 亀倉 正弘; ダイアル＝スミス, マイケル L. (1995). 「Halobacteriaceae科の分類と2つの新属HalorubrobacteriumおよびNatrialbaの記載」.一般応用微生物学ジャーナル. 41 (4): 333– 350. doi : 10.2323/jgam.41.333 . ISSN  0022-1260.
  6. ^ 亀倉正史;ダイアル・スミス、ML;ウパサニ、V.ヴェントーサ、A.ケイツ、M. (1997 年 7 月)。 「好アルカリ性好塩菌の多様性：Natronobacterium v​​acuolatum、Natronobacterium magadii、Natronobacterium pharaonis を、それぞれ Halorubrum vacuolatum comb. nov.、Natrialba magadii comb. nov. として、Halorubrum、Natrialba、Natronomonas gen. nov. に移管する提案Natronomonas pharaonis comb.、それぞれ。系統的細菌学の国際ジャーナル。47 (3): 853–857。土井: 10.1099/00207713-47-3-853。ISSN  0020-7713. PMID  9226918.
  7. ^ Reed, Christopher J.; Lewis, Hunter; Trejo, Eric; Winston, Vern; Evilia, Caryn (2013). 「古細菌極限環境細菌におけるタンパク質適応」Archaea . 2013 373275. doi : 10.1155/2013/373275 . ISSN  1472-3646. PMC 3787623 . PMID  24151449. 
  8. ^ Kozlowski, Lukasz P. (2017-01-04). 「Proteome-pI：プロテオーム等電点データベース」. Nucleic Acids Research . 45 (D1): D1112 – D1116 . doi :10.1093/nar/gkw978. PMC 5210655. PMID  27789699 .  
  9. ^ シダラマッパ、シヴァクマラ;チャラコム、ジーン F.デカストロ、ロザナ E.ファイファー、フリードヘルム。サストレ、ディエゴ E.ヒメネス、マリア I.パッジ、ロベルト A.デッター、ジョン C.ダベンポート、カレン W. (2012-05-04)。 「好アルカリ性塩古古細菌 Natrialba magadii ATCC 43099T の遺伝的内容に関する比較ゲノミクスの観点」。BMC ゲノミクス。13 : 165.土井: 10.1186/1471-2164-13-165。PMC 3403918。PMID  22559199。 
  10. ^ ケブッシュ・ガナ、サリマ;ガナ、モハメド・ラミン。フェリオーネ、イメン。ケミリ、スアド。レンチ、ネスリン。シヘム州アクムーシ・トゥミ。ブアナン・ダレンフェド、ナビラ・アメル。ジェラリ、ナセル・エディン (2013-11-01)。 「塩水条件下で、天日塩田から単離された極めて好塩性の細菌であるナトリアルバ種 E21 株の捕捉細胞による、生理食塩水条件下での粗デーツシロップ上でのバイオサーファクタントの生成 (アイン・サラー、アルジェリア)」。極限環境微生物。17 (6): 981–993。土井:10.1007/s00792-013-0580-2。ISSN  1431-0651。PMID  24061687。S2CID 15583238  。
  11. ^ JP Euzéby. 「Natrialba」.原核生物名一覧（LPSN） . 2023年10月10日閲覧。
  12. ^ 「The LTP」 . 2024年12月10日閲覧。
  13. ^ 「LTP_all tr​​ee in newick format」 . 2024年12月10日閲覧。
  14. ^ 「LTP_10_2024 リリースノート」(PDF) . 2024年12月10日閲覧。
  15. ^ 「GTDBリリース10-RS226」ゲノム分類データベース。 2025年5月1日閲覧。
  16. ^ "ar53_r226.sp_label".ゲノム分類データベース. 2025年5月1日閲覧。
  17. ^ 「分類の歴史」ゲノム分類データベース. 2025年5月1日閲覧。

さらに読む

科学雑誌

  • コンデ、JD;ギレン、J.ネルセシアン、D.オルドネス、MV;他。 (2011 年 9 月)。 「ナトリアルバ・マガディ由来の古細菌ユビキチン様ポリペプチドのFTIRによる二次構造決定」。ヨーロッパ生物物理学ジャーナル。40 (9): 1101–1107。土井:10.1007/s00249-011-0719-y。hdl : 11336/13062。PMID  21701865。S2CID 13480537  。
  • Oren A; Ventosa A (2000). 「国際細菌分類学委員会 ハロバクテリア科の分類に関する小委員会 議事録、1999年8月16日、オーストラリア、シドニー」Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 50 (3): 1405–1407 . doi : 10.1099/00207713-50-3-1405 . PMID  10843089.

科学書

  • ギボンズ, NE (1974). 「Halobacteriaceae科 V. 新種」. RE Buchanan; NE Gibbons (編). Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (第8版). ボルチモア: The Williams & Wilkins Co.
  • BacDiveのNatrialba - 細菌多様性メタデータ
  • タンパク質の極端な電荷分布を示すProteme-pIデータベースのNatrialba magadii


スタブアイコン

このアーキア関連の記事はスタブです。記事を充実させることでWikipediaに貢献できます。

Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Natrialba&oldid=1326001336"