古王国時代の個体（NUE001）
エジプトの骸骨

NUE001
ヌワイラット個体の頭蓋骨から作成された顔の復元と描写[1]
死亡紀元前2700年頃
休憩所世界博物館、イングランド、イギリス
ヌワイラットの場所

NUE001 （紀元前 2700年頃死亡）は、カイロの南265kmの崖にあるヌワイラット（ヌエラト、ノーイラト）で発掘された、比較的高い地位にあった古王国時代のエジプト人成人男性の遺伝子コード名である。この人物の全ゲノム祖先は、2025年にネイチャー誌に掲載された論文で発表された。この個体は放射性炭素年代測定によって紀元前2855～2570年と測定され、葬儀の慣習や関連遺物は考古学的に第3王朝および第4王朝に帰属するとされている。

NUE001は、これまでに配列決定に成功した最初の初期王朝時代のエジプト人であり、その遺伝的祖先の約20％がメソポタミアを含む東部肥沃三日月地帯に遡ることができるという発見で注目に値します。これは、少なくとも紀元前6千年紀から始まる既知の文化の流れに加えて、メソポタミアからエジプトへの初期の人類の移動を示唆しています。[2]

勉強

2025年に初めて、カイロの南265kmの崖にあるヌワイラット（ヌエラト、ノヴァラト）で発掘された、比較的地位が高く、放射性炭素年代測定で紀元前2855～2570年頃のエジプト古王国時代の成人男性で、考古学的には第3王朝と第4王朝に由来する葬儀習慣を持つとされる人物の全ゲノム配列を解析することで、初期王朝時代のエジプト人の遺伝的背景に関する知見が得られる研究が行われた。[2] [3]

陶器の棺を備えた墓の平面図
NUE001の炭素14年代測定と歴史上の王朝との関係

この研究以前は、エジプト王朝史の最初期における古代エジプト人の全ゲノム配列解読は、主にエジプトにおけるDNA保存条件の厳しさのために、未だ達成されていませんでした。これまでの考古遺伝学的研究では、紀元前1388年から紀元後426年までの古代エジプト人の部分的なDNA解析は成功していましたが、許容できる核汚染率を示したサンプルはわずか3つだけでした。そのうち2つはプトレマイオス朝前期（新王国時代から後期）のもので、1つはプトレマイオス朝時代のものでした。これらのサンプルは古王国時代から数千年後のものであり、エジプトが幾度もの重要な激動を経験した後のことです。これらの激動は、エジプト人集団内で大幅な遺伝子交代をもたらしたかどうかは定かではありません。その結果、古代エジプト初期王朝人の遺伝子構造は依然として不明のままでした。[2]

遺体は1902年に最初に発掘され、リバプールの世界博物館に保管されていました。第二次世界大戦中のロンドン大空襲の爆撃を生き延び、2025年の研究のためにサンプルが採取されるまで保管されていました。[4]発見者であるリバプール大学のジョン・ガースタングは、1902年から1904年にかけてベニ・ハッサンの墓地で行われた発掘調査の報告書である『中王国時代の墓に描かれた古代エジプトの埋葬習慣』の中で、この発見について簡潔に説明しています（26～28ページ）。[5]

ゲノム解析

ヌワイラットゲノムの遺伝的祖先●：a) ヌワイラット（NUE001）からの古王国時代エジプトゲノムの投影を伴う、現在の世界各地の集団のPCA。b) 古代北アフリカと西アジアのゲノムの投影を伴う、現在の北アフリカと西アジアの集団のPCA [2]

遺体は、当時としては一般的ではなかった防腐処理やミイラ化を行わず、大きな円形の土器にそのまま納められ、崖の墓に安置された。そのため、遺骨とDNAの保存状態は比較的良好であった。この特別な埋葬方法は、遺体が比較的高い社会的地位にあったことを示唆している。しかしながら、遺骨には筋骨格に大きなストレスがかかっており、激しい肉体労働を示唆する特徴が見られ、陶工という職業に合致すると考えられる。[2]

DNAは歯根のセメント質から抽出され、DNAの保存に優れた材料です。ショットガンシーケンシング法を用いることで、ゲノム全体を網羅的に網羅することができました。[3]

主な調査結果

ヌワイラットのエジプト人ゲノムの祖先モデル

ヌワイラット個人の遺伝子プロファイルは、2ソースモデルによって最もよく表され、祖先の77.6% ± 3.8%が中期新石器時代モロッコの遺跡、スキラト・ルアジ（SKH、紀元前4780～4230年と推定）のゲノムと一致した。この遺跡自体は、主に（76.4 ± 4%）レバント新石器時代祖先と（22.4 ± 3.8%）少数のイベロマウルス祖先で構成され、残り（22.4% ± 3.8%）は新石器時代メソポタミア（紀元前9000～8000年と推定）の既知のゲノムに最も関連していた。 [2] [6]その他の2ソースモデルはいずれも有意基準を満たさなかった（P>0.05）。 2つの3つの起源モデルもデータと一致しており、同様の祖先の割合で構成されており、銅器時代レバントの人口からのより小さな直接的な寄与が加えられています。[2]

qpAdmによる古代東アフリカゲノムの祖先モデル化（研究の図7）[7]では、ヌワイラットゲノムが、銅器時代レバントの集団であるケニアとタンザニアの古代牧畜民における西ユーラシア関連の祖先の同様に強力な候補であると特定され、これは現代東アフリカまたは1千年紀スーダンの初期キリスト教徒のゲノムのADMIXTURE分析の結果と一致しています。

ヌワイラット個体のY染色体ハプログループとミトコンドリアハプログループは、それぞれE1b1b1b2b（E-V1515とも呼ばれる）とI/N1a1b2と同定された（Trombetta et al., 2015）。[8]両ハプログループの頻度は、北アフリカと西アジアの現代集団でピークに達しており、これは本研究の全ゲノム解析の結果と一致している。

新石器時代北アフリカ成分（77.6% ± 3.8%）

ヌワイラット人のゲノムの大部分（約78%）は新石器時代北アフリカの祖先に由来し、具体的にはモロッコのスキラト・ルアジ遺跡（SKH、紀元前4780～4230年）のサンプルと一致している。[2]これは、この時期の北アフリカ全域で共通の新石器時代祖先が見られたこと、そしてそれが初期王朝時代および古王国時代の人々への特定の遺伝的貢献を反映していると思われる。[2]しかし、この共通の新石器時代北アフリカ祖先自体は、約76%がレヴァント新石器時代祖先（おそらく青銅器時代以前のレヴァント人移住イベントの1つまたは複数を反映している）と約24%がイベロマウルス祖先の組み合わせであることが以前に示されていた。[2]

2023年の遺伝子研究によると、スキラト・ルアジ（SKH）の祖先は、実際には新石器時代に北西アフリカで相互作用し、徐々に混ざり合った3つの主要な遺伝子グループの1つに相当します。[9]

石器時代のマグリブにおける推定人口史の要約。スキラト・ルアジ（SKH）支族は、紀元前5000年頃のレヴァント人移住の波（■）を表しており、ある程度の地域的な混合（■）を伴う。[6]

このSkhirat-Rouazi (SKH) 集団は、 Nuwayrat NUE001 の エジプト古王国時代の個人の祖先の大部分 (約 77.6%) を形成する集団です。

メソポタミア成分（22.4±3.8％）

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ヌワイラット（）、メソポタミア新石器時代の参照サンプルの場所と日付（):ネムリク 9 世(紀元前 9500 ～ 8000 年)、ボンジュクル タルラ(紀元前 9000 ～ 8500 年)、チャヨニュ(紀元前 8300 ～ 7500 年) [13]

ヌワイラット人の遺伝的祖先の残り約22%は、新石器時代のメソポタミア関連集団に由来し、メソポタミアを含む東部肥沃な三日月地帯を起源とする可能性が高い。[2] 言及されている「メソポタミア_新石器時代」クラスターは、上部メソポタミアと中央メソポタミアに位置する先土器新石器時代文化（先土器新石器時代Aまたは先土器新石器時代B ）であるネムリク9（紀元前9500-8000年）、ボンジュクル・タルラ（紀元前9000- 8500年）、チャイョヌ（紀元前8300-7500年）からの12個のサンプルで構成されていた。[13]チャイョヌやボンジュクル・タルラなどの遺跡は、ギョベクリ・テペのタシュ・テペレル文化の伝統から発展したもので、チャイョヌのような遺跡では、最初の動物の家畜化が行われた場所（豚は紀元前8500年に初めて家畜化された可能性がある）であり、農業は紀元前9千年紀から発展しました。[14] [15] [16]

2022年の遺伝子研究では、チャイヨヌ（紀元前8300-7500年）の集団が、ギョベクリ・テペの記念碑的な建造物を建設し、上部メソポタミアでヒトツブコムギ、エンマーコムギ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、ウシなどの様々な動植物を家畜化した、知られている中で最も初期の狩猟採集定住集団の代表として分析されました。[ 17]チャイヨヌの集団は遺伝的に多様であり、西部と東部の両方の肥沃な三日月地帯の祖先を持ち、約48％のアナトリア亜旧石器時代、33％の中央ザグロス新石器時代、19％の南レバント新石器時代の要素を組み合わせた祖先によって最もよくモデル化されました。[18]

歴史的背景

ネフェルティアベト王女（紀元前2590年頃-2565年頃）の写実的な描写。彼女はクフ王の妹で、NUE001と同時代の人物であったと考えられている。[19]石碑の元の色彩は、彼女の肌の色を含め、今日までよく保存されている。[20]

2022年のDNA研究では、新石器時代にメソポタミアとザグロス地域からアナトリアを含む周辺地域への遺伝子流動の証拠がすでに示されていましたが、エジプトまではまだ至っていませんでした。[9]

年代学的に見ると、エジプトは紀元前6千年紀という早い時期に西アジアから出現した新石器時代の文化を最初に取り入れた地域の一つであった。ナイル渓谷の集団遺伝学は、歯計測学的および歯組織の変化に見られるように、この時期に顕著な変化を観察した。その後、両地域間の文化交流と交易は紀元前4千年紀まで継続し、メソポタミア後期ウルク期の特徴が後期先王朝時代のナイル渓谷に伝播したことがそれを示している。こうした文化交流には、メソポタミアからの移住が伴い、地中海や紅海の航路、あるいはレヴァント地方における未調査の中継地を経由していた可能性が考えられる。これは、既知の銅石器時代/青銅器時代のレヴァント人集団からの遺伝的影響が比較的小さかったことを説明できる。DNA分析によると、メソポタミアの遺伝的影響はエジプトへの本質的に直接的なものであり、メソポタミアのレヴァント地方への進出による二次的な影響ではなかった。[21]

また、この分析では、ヌワイラットのゲノム中に、エチオピアのモタ洞窟で以前に公開された4,500年前の狩猟採集民のゲノムや、アフリカ中央部、東部、南部の他の個人に関連する実質的な祖先も除外された。

表現型

ヌワイラットの人物は、茶色の目、茶色の髪、そして黒から黒までの皮膚の色素を有していたと推定されています。さらに骨学的検査を行った結果、身長は157.4～160.5cmであったことが判明しました。これらの身体的特徴は、現代のエジプト人や北アフリカ人に見られる特徴と概ね一致しています。

著者らは、エジプト人のゲノム1つに依存していることや、研究が十分に行われていない集団における表現型予測の精度が限られていることなど、本研究の限界を認めている。参考までに、本研究で用いられたHIrisPlex-S表現型解析では、様々な目、髪、肌の色の確率が以下のように算出された。目については、茶色が約98.79%、中間色が約1.19%、青色が約0.02%。髪については、黒色が約52.89%、赤色が約0.14%、茶色が約45.04%、金髪が約1.92%。肌については、濃い色から黒色が約37.84%、濃い色が約56.78%、中間色が約5.28%、薄い色が約0.1%。[22]

補足的な顔の復元に関して、研究者らは、DNA分析は集団の起源を示しているものの、肌の色、目の色、髪の色に関する決定的なデータは存在しないと指摘した。そのため、復元は頭髪や顔の毛を除いた白黒で作成された。[2]

メソポタミア人のエジプトへの移住の時期と方法

メソポタミアからエジプトへの文化と移住の流れ、遺伝的寄与（紀元前6千年紀～4千年紀）[23]
新石器時代の農耕文化が近東からヨーロッパ、エジプトに広がった地図と日付。エジプトには紀元前6000年頃に到達した[24] [23]

新石器時代の移住仮説（紀元前9000～6000年頃）

2025年の遺伝子研究から混合イベントの時期を直接計算することはできない。[23] 2025年の研究では、ヌワイラットのサンプルが紀元前9000～8000年の新石器時代メソポタミアのサンプル（先土器新石器時代A期と先土器新石器時代B期のネムリク9、ボンジュクル・タルラ、チャイョヌの個体で構成）と最も類似性が高いことが示された。 [13] [23]同時に、他の研究により、新石器時代、紀元前10,000～5000年に、メソポタミアとザグロス山脈の人々が近東、特にアナトリアに拡大し、新石器時代の技術革新パッケージ（栽培植物、陶器、より大規模な定住生活）をもたらしたことが明らかになっている。エジプトもこのような移住の影響を受けた可能性がある。[23] [25]紀元前6000年頃のナイル渓谷では、歯計測学と歯組織のさらなる変化が観察されています。[23]その後、メソポタミアからの文化流入は紀元前4千年紀（紀元前3999-3000年）まで記録されており、エジプトの後期先王朝時代には後期ウルクの芸術的特徴が現れています。[23]

銅器時代（紀元前5000～3300年頃）の仮説

メソポタミア人の近東へのさらなる進出は、銅器時代（紀元前5000-3300年）とそれに続く青銅器時代にまで遡り、アナトリアと銅器時代のレヴァント地方でこの時代の人間のサンプルに高い割合でメソポタミアの祖先が見つかっている。 [23]しかし、今回の2025年の研究では、 qpAdmによる追跡分析により、これらの銅器時代の近東の集団がヌワイラットのサンプルの潜在的な供給源ではないことも示された。[23]これは、提案されている銅器時代にメソポタミアの祖先がエジプトに到達したのは、近東を横断するまだ知られていない移住経路か、地中海や紅海を越える海上交易ルートを経由してであったに違いないことを示唆している。[23]

歴史的背景

全体として、2025年の研究は「古代エジプトの東部肥沃三日月地帯に関連する遺伝的祖先の直接的な証拠を提供している」。この遺伝的つながりは、既に観察されている物品やイメージ（家畜化された動植物、文字体系など）の交流に加えて、東部肥沃三日月地帯からエジプトへの古代の移住の流れがあったことを示唆している。これは、この時期にアナトリアとエジプトの両方に影響を与えたメソポタミア地域からの広範な文化的および人口動態的拡大のパターンを示唆している。[2]

その後の遺伝的進化

青銅器時代のカナン人の拡大（紀元前1800年頃）

第三中間期ゲノムの祖先割合（ベストフィット3ソースモデル（qpAdm））[26]

2025年の研究では、以前に発表された第三中間期（紀元前787-544年）のミイラの遺伝子データを再分析した。[23] [27]ヌワイラットのサンプルとの限界的な連続性が示され、それに加えてレヴァント系の祖先の流入が顕著であった。その主な起源は青銅器時代のレヴァント系祖先であり、メインモデルでは約64%に現れている（P=0.32）。[23]最も適合した3つの起源モデルでは、レヴァント系祖先が46%、メソポタミア系祖先が18%、モロッコ系祖先が36%であることが示された（P=0.24）。[26]このレヴァント人の祖先が多数派になる傾向は、中王国末期の青銅器時代のカナン人の拡大とエジプト第二中間期の到来、そしてヒクソスの台頭と後期青銅器時代の崩壊に起因している可能性がある。[23]

現代エジプト

最適モデル（qpAdm）における、NUE001祖先を持つ、いくつかの現代エジプト人ゲノムの祖先比率●

遺伝子モデリングによると、現代エジプト人のほとんどは、5つの古代集団の組み合わせに祖先を持つと示唆されている。最大約75%は、ヌワイラットの古王国時代の個人、またはモロッコの中期新石器時代の個人に関連する集団に遡ることができ、モロッコの中期新石器時代の個人はヌワイラットの個人の祖先の約80%を占めている。その他の要素としては、青銅器時代のレバントに関連する祖先があり、研究者らはこれが2番目に多い祖先の要素であると指摘している。また、著者らは、以前に発表された分析とモデルから、サハラ以南のアフリカ（東アフリカと西アフリカの祖先）からのより最近の混合が示唆されていると指摘している。

参照

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