OPN3

OPN3
識別子
エイリアス	OPN3、ECPN、PPP1R116、オプシン3
外部ID	オミム: 606695 ; MGI : 1338022 ;ホモロジーン: 40707 ;ジーンカード：OPN3 ; OMA : OPN3 - オルソログ
遺伝子の位置（マウス） キリスト 染色体1（マウス）[ 1 ] バンド 1|1 H3 始める 1億7548万9987塩基対[ 1 ] 終わり 1億7552万342bp [ 1 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 中側頭回 胎盤 脛骨 ブロードマン領域46 眼瞼結膜 臓側胸膜 前頭前皮質 羊水 ブロードマン野23 単球 上位の表現 白色脂肪組織 蝸牛管の前庭膜 運動ニューロン 皮下脂肪組織 外側膝状体 内側膝状体 二次卵母細胞 一次卵母細胞 精細管 脊髄神経節 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 Gタンパク質共役受容体の活性 光受容体活動 信号伝達活性 Gタンパク質共役光受容体活性 細胞成分 膜の不可欠な構成要素 細胞膜の不可欠な構成要素 膜 光受容体外節 生物学的プロセス Gタンパク質共役受容体シグナル伝達経路 概日リズムの調節 シグナル伝達 刺激に対する反応 光刺激の検出 可視光の検出 光伝達 光刺激に対する細胞反応 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 23596 13603 アンサンブル 該当なし ENSMUSG00000026525 ユニプロット Q9H1Y3 Q9WUK7 RefSeq (mRNA) NM_014322 NM_001030011 NM_001030012 NM_001381855 NM_001381856 NM_010098 RefSeq（タンパク質） NP_055137 NP_001368784 NP_001368785 NP_034228 場所（UCSC） 該当なし 1 章: 175.49 – 175.52 Mb PubMed検索 [ 2 ] [ 3 ]
ウィキデータ
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オプシン3はエンセファロプシンまたはパノプシンとも呼ばれ^{[ 4 ]}、ヒトではOPN3遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}この遺伝子の選択的スプライシングにより、異なるタンパク質アイソフォームをコードする複数の転写変異体が生じる。^{[ 8 ]}

関数

オプシンはGタンパク質共役受容体スーパーファミリーのメンバーです。視覚オプシンに加えて、哺乳類は眼以外の組織で発現する光受容性の非視覚オプシンをいくつか持っています。オプシン3遺伝子は脳と精巣で強く発現し、肝臓、胎盤、心臓、肺、骨格筋、腎臓、膵臓で弱く発現しています。この遺伝子は皮膚で発現しており^{[ 8 ]} 、網膜でも発現している可能性があります。このタンパク質は光受容性オプシンタンパク質の標準的な特徴を持っていますが^{[ 7 ]} 、ヒトの皮膚ではOPN3は光受容性ではなく、メラニン生成の負の調節因子として機能します^{[ 9 ]}。

アプリケーション

OPN3類似体がニューロンで発現すると、光による活性化により神経伝達物質の放出が抑制されます。^{[ 10 ] [ 11 ]}このため、これらの類似体は、特定のニューロンが脳機能に与える影響を研究する方法であるオプトジェネティックサイレンシングに有用なツールとなります。

参考文献

1. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000026525 – Ensembl、2017年5月
2. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
3. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 小柳 正之、高田 栄治、永田 剛志、塚本 秀、寺北 明 (2013年3月). 「脊椎動物Opn3ホモログは非光受容組織において光センサーとして機能する可能性がある」 .米国科学アカデミー紀要. 110 (13): 4998–5003 . Bibcode : 2013PNAS..110.4998K . doi : 10.1073/pnas.1219416110 . PMC 3612648. PMID 23479626 .  
5. Blackshaw S, Snyder SH (1999年5月). 「エンセファロプシン：脳内に明確に局在する新規哺乳類網膜外オプシン」 . The Journal of Neuroscience . 19 (10): 3681– 3690. doi : 10.1523 / JNEUROSCI.19-10-03681.1999 . PMC 6782724. PMID 10234000 .  
6. Halford S, Freedman MS, Bellingham J, Inglis SL, Poopalasundaram S, Soni BG, et al. (2001年3月). 「広範な組織発現を示す新規ヒトオプシン遺伝子の特性評価と染色体1q43上の埋め込み遺伝子および隣接遺伝子の同定」Genomics . 72 (2): 203– 208. doi : 10.1006/geno.2001.6469 . PMID 11401433 . 
7. 「Entrez遺伝子：OPN3オプシン3（エンセファロプシン、パノプシン）」。
8. Haltaufderhyde K, Ozdeslik RN, Wicks NL, Najera JA, Oancea E (2015年1月). 「ヒト表皮におけるオプシン発現」 .光化学と光生物学. 91 ( 1): 117– 123. doi : 10.1111/php.12354 . PMC 4303996. PMID 25267311 .  
9. Olinski LE, Lin EM, Oancea E (2020年1月). 「皮膚におけるオプシン3の機能に関する新たな知見」 . Advances in Biological Regulation . 75 100668. doi : 10.1016/j.jbior.2019.100668 . PMC 7059126. PMID 31653550 .  
10. Mahn M, Saraf-Sinik I, Patil P, Pulin M, Bitton E, Karalis N, et al. (2021年5月). 「蚊のロドプシンを用いた神経伝達物質放出の効率的な光遺伝学的サイレンシング」 . Neuron . 109 ( 10): 1621–1635.e8. doi : 10.1016/j.neuron.2021.03.013 . PMC 7611984. PMID 33979634 .  
11. Copits BA, Gowrishankar R, O'Neill PR, Li JN, Girven KS, Yoo JJ, et al. (2021年6月). 「シナプス前抑制のための光スイッチ可能なGPCRベースのオプシン」 . Neuron . 109 (11): 1791–1809.e11. doi : 10.1016/ j.neuron.2021.04.026 . PMC 8194251. PMID 33979635 .  

さらに読む

• Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996年9月). 「正規化と減算：遺伝子発見を促進する2つのアプローチ」 . Genome Research . 6 (9): 791–806 . doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID  8889548 .
• Halford S, Bellingham J, Ocaka L, Fox M, Johnson S, Foster RG, Hunt DM (2002). 「in situハイブリダイゼーションおよび体細胞ハイブリッドによるヒト染色体バンド1q43へのパノプシン（OPN3）の割り当て」. Cytogenetics and Cell Genetics . 95 ( 3–4 ): 234– 235. doi : 10.1159/000059351 . PMID  12063405. S2CID  24099335 .
• Kasper G, Taudien S, Staub E, Mennerich D, Rieder M, Hinzmann B, et al. (2002年7月). 「ヒトとマウスにおけるエンセファロプシン遺伝子の構造的構成の相違」. Gene . 295 (1): 27– 32. doi : 10.1016/S0378-1119(02)00799-0 . PMID  12242008 .
• Alam NA, Gorman P, Jaeger EE, Kelsell D, Leigh IM, Ratnavel R, et al. (2003年12月). 「EXO1の生殖細胞系列欠失は大腸腫瘍を引き起こさず、EXO1がヌルの病変はマイクロサテライト不安定性を示さない」. Cancer Genetics and Cytogenetics . 147 (2): 121– 127. doi : 10.1016/S0165-4608(03)00196-1 . PMID  14623461 .

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