オープンソースの創薬

オープンソース創薬（OSDD）は、インド科学産業研究会議（CSIR）が主導し、世界中から参加しているチームインディアコンソーシアムです[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]研究ベースの製薬企業の注目が限られているリーシュマニア症などの顧みられない熱帯病のための共同創薬プラットフォームを提供しています。 [ 1 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] このプログラムには、研究者、学界、学生、産業界、教育機関など、130か国から7500人を超える参加者がいるグローバルコミュニティがあります。[ 7 ] [ 9 ]オープンソースモードでの顧みられない病気の治療薬の発見に取り組んでいる人なら誰でもプログラムに参加できます。[ 10 ] OSDDは、熱帯感染症に対する手頃な価格の薬の発見と開発に焦点を当てるために、多様なバックグラウンドを持つ専門家を集めて機能します。

歴史

CSIR-OSDDは2008年9月に開始されました。[ 9 ] [ 11 ]このプロジェクトは、CSIR-ゲノム科学・統合生物学研究所の創設所長であるサミール・K・ブラマチャリ氏によって、CSIRの第11次5カ年計画プロジェクトとして考案されました。 [ 12 ]これは、インド政府によって承認され、総支出額は4億5,960万ルピー（約1,200万ドル）でした。[ 13 ] このプロジェクトのモットーは「すべての人に手頃な医療を」であり、オープンソース哲学、クラウドソーシングの概念、共同研究モデルを活用し、[ 14 ] Webベースのツールを活用してイノベーションを促進し、新しい治療法を発見します。[ 13 ] [ 15 ]コミュニティによって生成されたすべてのデータとリソースは、この目的のために特別に設計されたSysborg 2.0と呼ばれるWebベースのポータルを通じて公開されています[ 5 ] [ 16 ] [ 17 ]

このプロジェクトは、特許取得とオープンソース研究の政策を融合させたヘルスケアモデルを採用しており、知的財産権の制限なしに新薬をジェネリック医薬品として利用できるようにし、手頃な価格とアクセス性を確保することを目指しています。[ 18 ] [ 19 ]

最初の活動は結核菌（Mycobacterium tuberculosis）に対する治療薬の開発でした。[ 20 ]このプロジェクトは2つのフェーズに分かれています。

  1. フェーズ I (2008 ～ 2012 年) では、新薬の発見と開発が行われます。
  2. フェーズII（2012～2017年）では臨床試験が行われます。

プロセス

OSDDは、参加機関がウェブサイトのコンテンツに容易に貢献したり、修正したりできるよう、Wikiモデルに基づいたウェブポータルの構築から始まりました。アップロードされた情報はピアレビューを受けることができます。開発中の新薬はパブリックドメインとなります。ジェネリック医薬品は製薬会社に引き継がれ、適正な価格で販売されることになります。[ 21 ]

運用方法論

創薬プロセスは10の作業パッケージに分かれており、[ 21 ]

  1. WP1 - 創薬標的の特定。これは、潜在的な創薬標的の特定に向けたシステム生物学研究を含む計算科学研究活動を促進するものです。オープンソースへの強い関心を持つ学界、研究機関、産業界の参加を促します。
  2. WP2 - 標的の発現。これには、潜在的な薬物標的に関する実験結果の共有とアッセイの開発が含まれます。
  3. WP3 - スクリーニング開発。これは、様々なターゲット向けに開発された特定のアッセイを用いて、大規模な化合物ライブラリをスクリーニングするものです。
  4. WP4 - インシリコドッキング。これは、ヒット化合物上の標的部位を特定し、類似体合成のための潜在的な部位を特定することで、最大の効力と最小の毒性を達成することを指します。
  5. WP5 - 最適な阻害剤を用いたヒト細胞および組織におけるマイクロアレイ遺伝子発現。宿主細胞の発現プロファイルを変化させることなく、標的に対する結合親和性が高い化合物を同定します。
  6. WP6 -医薬品化学。これには改良化合物の合成が含まれます。
  7. WP7 - リード化合物の最適化。宿主に影響を与えずに、望ましい効果を持つリード化合物を生産することを目指します。
  8. WP8 -ヒト細胞タンパク質結合を調べるためのプロテオミクスベースのリードアフィニティーカラム
  9. WP9 - リード化合物の前臨床毒性
  10. WP10 - 新規分子化合物の臨床開発

作業パッケージ 1 ～ 8 はフェーズ I に含まれ、WP9 と 10 はフェーズ II に含まれます。

組織

OSDDは共同プロジェクトであり、CSIRの一部門である。CSIR元所長のサミール・K・ブラマチャリ氏がオープンソース創薬プロジェクトの「チーフメンター」を務めている。ギャン・ビンドゥ・アカデミー会長のM・ヴィジャヤン氏、インド医学研究評議会（ICMR）所長のVM・カトック氏、ICMR元所長のNK・ガングリ氏がメンターを務める。個々のプロジェクトは参加機関によって担当され、主任研究員によって管理されている。[ 21 ]これらのプロジェクトは、CSIRのOSDDプロジェクトディレクターであるサララ・バラチャンドラン氏によって一元的に監督されている。

資金調達

OSDDの資金源は主にインド政府である。2008年9月から2012年3月までの期間、インド政府はこのプロジェクトに4億5960万ルピー（約1200万ドル）を割り当てた。[ 22 ]この資金は科学プロジェクトへの資金提供、インフラ整備、プロジェクトの継続活動の支援に充てられる。[ 23 ] 2012年まで、OSDDはCSIRの「国立研究所制度」に基づくプロジェクトであった。2013年から2017年の第12次5カ年計画では、計画委員会がCSIRのオープンイノベーション制度の一環としてOSDDを継続することを承認した。

実績

OSDDには世界各地から7,500人の登録参加者が参加しています。現在、約110の研究プロジェクトが進行中です。共同研究により、M. tuberculosisの潜在的な薬剤ターゲットが60以上特定され、7つのターゲットが調査中です。コンソーシアムの最初の国際出版物は、2009年にM. tuberculosisの統合ゲノミクスマップに関するものでした。[ 24 ]それ以来、12件以上の研究が発表されています。[ 25 ] OSDDは現在、OSDD化学アウトリーチプログラム（OSDDChem）を運営しています。このシステムでは、学生が合成化学のトレーニングを受け、OSDDChemセンターの大学、研究所、カレッジで合成された化合物がOSDDChemデータベースに登録され、CSIR-CDRIに送られます。これらの分子はその後、CSIR-CDRIで抗結核および抗マラリア活性のスクリーニングに使用されます。[ 26 ] [ 27 ]

参照

参考文献

  1. ^ a b cバルドワジ、アンシュ;スカリア、ヴィノッド。ラガヴァ、ガジェンドラ・パル・シン。リン、アンドリュー・マイケル。チャンドラ、長妻。バナジー、スラニャ。ラグナンダナン、ムトゥクルッシ V.。パンディ、ヴィカス。タネジャ、ブペシュ;ヤダブ、ジョティ。ダッシュ、デバシス。バタチャリヤ、ジャイジット。ミスラ、アミット。クマール、アニル。ラマチャンドラン、スリニバサン。トーマス、ザキル。ブラフマチャリ、サミール K.サウスカロライナ州ブラマチャリ (2011)。 「オープンソース創薬 – 結核治療薬開発における共同研究の新しいパラダイム」。結核。91 (5): 479–486。土井: 10.1016/j.tube.2011.06.004。PMID  21782516 . S2CID  5556982 .
  2. ^ Årdal, Christine; Røttingen, John-Arne (2012-09-20). 「PLOS Neglected Tropical Diseases：オープンソースによる創薬の実践：ケーススタディ」 . PLOS Neglected Tropical Diseases . 6 (9) e1827. Plosntds.org. doi : 10.1371/journal.pntd.0001827 . PMC 3447952. PMID 23029588 .  
  3. ^ Pallava Bagla (2012-02-24). 「クラウドソーシングによる創薬」. Science . 335 (6071). Sciencemag.org: 909. Bibcode : 2012Sci...335..909B . doi : 10.1126/science.335.6071.909 . PMID 22362985 . 
  4. ^ Deepa Kurup (2010年12月17日). 「オープンソース哲学を受け入れよ、カラム氏が科学者や研究者に語る」 . The Hindu . Thehindu.com . 2015年4月30日閲覧。
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  6. ^ Dhruba Jyoti Purkait (2013年5月12日). 「熱帯病の薬はどこにあるのか？ | Business Line」 . Thehindubusinessline.com . 2015年4月30日閲覧。
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  8. ^ 「オープンソース創薬（OSDD）」 Openhealthnews.com 2015年4月30日閲覧。
  9. ^ a b「政府、より安価な医薬品の発明に若者の才能を活用 - timesofindia-economictimes」 Articles.economictimes.indiatimes.com. 2007年12月20日. 2011年8月12日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2015年4月30日閲覧。
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  12. ^ 「Samir Brahmachari - Fierce's Top 10 Biotech Techies」 FierceBiotechit.com、2012年3月23日。2012年4月2日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2015年4月30日閲覧。
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  14. ^ 「オープンソースの創薬 - timesofindia-economictimes」 . Articles.economictimes.indiatimes.com. 2007年12月21日. 2015年6月19日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2015年4月30日閲覧。
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  17. ^ 「Jaimon Josephのブログ：白衣を着た人のためのFacebook」 Ibnlive.in.com、2011年9月23日。2011年9月26日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2015年4月30日閲覧。
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  19. ^ 「オープンソース創薬（OSDD）」 Zunia.org、2012年3月2日。 2015年4月30日閲覧。
  20. ^ Press Information Bureau (2008年9月15日). 「CSIRがオープンソース創薬を開始：国民の、国民による、国民のための画期的な研究」 . dst.gov.in.インド科学技術省. 2014年1月7日閲覧。
  21. ^ a b cオープンソース創薬プロジェクトディレクター。「オープンソース創薬」：結核のためのオープンな共同創薬モデル（PDF）。www.who.int 。世界保健機関、ジュネーブ。2014年1月7日閲覧。
  22. ^ 「センター、CSIRのオープンソース創薬プロジェクトに15億ルピーの資金提供を約束 | CSIRのニュース」 Csirindia.wordpress.com、2011年5月27日。 2015年4月30日閲覧。
  23. ^ 「Forbes India Magazine - オープンソースの創薬がインドの新薬開発にどのように貢献しているか」 Forbesindia.com 2015年4月30日閲覧。
  24. ^バルドワジ、A;バーティヤ、D;クマール、N;オープンソース創薬コンソーシアム。スカリア、V (2009)。 「TBrowse: 結核菌の統合ゲノムマップ」。結核（スコットランド、エディンバラ）。89 (5): 386–7 .土井: 10.1016/j.tube.2009.07.005。PMID 19683474。 
  25. ^ NCBI. 「オープンソース創薬コンソーシアム [法人著者]」 . www.ncbi.nlm.nih.gov . 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館. 2014年1月7日閲覧。
  26. ^ Himanshi Dhawan (2013年9月18日). 「CSIR、結核とマラリア治療薬の発見を推進」 . The Times of India . Bennett, Coleman & Co. Ltd. 2013年9月20日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2014年1月7日閲覧。
  27. ^ 「Open Pharma Project」 . open-pharma.org . 2021年6月25日閲覧。
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