PDCD2
識別子
エイリアス	PDCD2、RP8、ZMYND7、プログラム細胞死2
外部ID	オミム: 600866 ; MGI : 104643 ;ホモロジーン: 1951 ;ジーンカード: PDCD2 ; OMA : PDCD2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 6番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 6q27 始める 1億7057万5295bp [ 1 ] 終わり 1億7058万4692塩基対[ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 17番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 17 A2|17 8.95 cM 始める 15,739,470 bp [ 2 ] 終わり 15,747,563 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 生殖腺 膵臓の体 直腸 顆粒球 アキレス腱 胃の体 単球 右冠動脈 神経節隆起 ランゲルハンス島 上位の表現 胚の尾 窩 原始的な条線 胚葉上層 顔面運動核 性器結節 顆頭 内側神経節隆起 胚 胚 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 酵素結合 DNA結合 タンパク質結合 金属イオン結合 細胞成分 細胞質 細胞外エクソソーム 核 生物学的プロセス アポトーシス過程の正の調節 造血幹細胞の増殖の正の制御 造血前駆細胞の分化の制御 アポトーシス過程に関与するシステイン型エンドペプチダーゼ活性の活性化 プログラム細胞死 アポトーシス過程 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 5134 18567 アンサンブル ENSG00000071994 ENSMUSG00000014771 ユニプロット Q16342 P4671​​8 RefSeq (mRNA) NM_001199461 NM_001199462 NM_001199463 NM_001199464 NM_002598 NM_144781 NM_001363655 NM_008799 RefSeq（タンパク質） NP_001186390 NP_001186391 NP_001186392 NP_001186393 NP_002589 NP_659005 NP_001350584 NP_032825 場所（UCSC） 6 章: 170.58 – 170.58 Mb 17章: 15.74 – 15.75 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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プログラム細胞死タンパク質2は、ヒトではPDCD2遺伝子によってコードされているタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ]}

関数

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この遺伝子は、様々な組織で発現する核タンパク質をコードしています。ラットのホモログであるRp8は、未熟胸腺細胞で一過性に発現し、プログラム細胞死に関与していると考えられています。ヒト遺伝子の発現は、リンパ節胚中心の発達に必要な転写抑制因子であるBCL6によって抑制されることが示されており、BCL6がPDCD2に作用することでアポトーシスを制御していることが示唆されています。この遺伝子は、6番染色体上でTATA結合タンパク質であるTBP遺伝子と密接に連鎖しています。異なるタンパク質をコードする6つの転写産物が同定されています。^{[ 6 ]}

相互作用

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PDCD2は宿主細胞因子C1 ^{[ 7 ]}およびパーキン（リガーゼ）^{[ 8 ]}と相互作用することが示されている。

参考文献

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1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000071994 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000014771 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. 川上 剛志​​、古川 雄志、須藤 健、斎藤 秀、高見 誠、高橋 栄、中村 雄志 (1995年8月). 「ラットのプログラム細胞死関連遺伝子Rp8と高い相同性を示すヒト遺伝子（PDCD2）の単離とマッピング」. 細胞遺伝学および細胞遺伝学. 71 (1): 41–3 . doi : 10.1159/000134058 . PMID 7606924 . 
6. 「Entrez Gene：PDCD2プログラム細胞死2」。
7. Scarr RB, Sharp PA (2002年8月). 「PDCD2はHCF-1（C1）の負の調節因子である」 . Oncogene . 21 (34): 5245–54 . doi : 10.1038/sj.onc.1205647 . PMID 12149646 . 
8. Fukae J, Sato S, Shiba K, Sato K, Mori H, Sharp PA, Mizuno Y, Hattori N (2009年2月). 「Programmed cell death-2 isoform1 is ubiquitinated by parkin and increased in the substantia black urethromyces with autosomal conservativeive Parkinson's disease. FEBS Letters . 583 (3): 521–5 . doi : 10.1016/j.febslet.2008.12.055 . hdl : 1721.1/96274 . PMID 19146857. S2CID 7121769 .  

さらに読む

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• Baron BW, Anastasi J, Thirman MJ, Furukawa Y, Fears S, Kim DC, Simone F, Birkenbach M, Montag A, Sadhu A, Zeleznik-Le N, McKeithan TW (2002年3月). 「ヒトプログラム細胞死2（PDCD2）遺伝子はBCL6抑制の標的である：アポトーシスのダウンレギュレーションにおけるBCL6の役割への示唆」 . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 99 (5): 2860–5 . Bibcode : 2002PNAS...99.2860B . doi : 10.1073 / pnas.042702599 . PMC  122438. PMID 11854457  .
• Scarr RB, Sharp PA (2002年8月). 「PDCD2はHCF-1（C1）の負の調節因子である」 . Oncogene . 21 (34): 5245–54 . doi : 10.1038/sj.onc.1205647 . PMID  12149646 .
• バウミースター T、ボーフ A、ラフナー H、アングランド PO、ベルガミニ G、クロートン K、クルシア C、エバーハルト D、ガグヌール J、ギデッリ S、ホップ C、フーセ B、マンガノ R、ミション AM、シルル M、シュレーグル J、シュワブ M、スタイン MA、バウアー A、カサリ G、ドリューズ G、ギャビン AC、ジャクソン DB、ジョバティG、ノイバウアー G、リック J、クスター B、スーパーティフルガ G (2004 年 2 月)。 「ヒト TNF-α/NF-κ B シグナル伝達経路の物理的および機能的マップ」。自然の細胞生物学。6 (2): 97–105 .土井: 10.1038/ncb1086。PMID  14743216。S2CID  11683986。
• Lehner B , Sanderson CM (2004年7月). 「ヒトmRNA分解におけるタンパク質相互作用フレームワーク」 . Genome Research . 14 (7): 1315–23 . doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC  442147. PMID  15231747 .
• Chen Q, Qian K, Yan C (2005年12月). 「PDCD2(C)ドメインを持つcDNAのクローニングとHEK293T細胞のアポトーシスにおける発現」. Molecular and Cellular Biochemistry . 280 ( 1–2 ): 185–91 . doi : 10.1007/s11010-005-8910-z . PMID  16311922. S2CID  6208880 .
• Baron BW, Zeleznik-Le N, Baron MJ, Theisler C, Huo D, Krasowski MD, Thirman MJ, Baron RM, Baron JM (2007年5月). 「BCL6によるPDCD2遺伝子の抑制とヒトB細胞およびT細胞リンパ腫の病態への影響」 . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 104 (18): 7449–54 . Bibcode : 2007PNAS..104.7449B . doi : 10.1073/pnas.0701770104 . PMC  1863460. PMID  17468402 .