ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| PES1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | PES1、PES、ペスカディージョリボソーム生合成因子1、NOP7 |
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| 外部ID | オミム:605819; MGI : 1890613;ホモロジーン: 5984;ジーンカード:PES1; OMA :PES1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 11番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 11|11 A1 | 始める | 3,913,975 bp [2] |
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| 終わり | 3,930,004 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 腓骨神経
- 膵臓の体
- ランゲルハンス島
- 脚の皮膚
- 横行結腸粘膜
- 腹部の皮膚
- 左精巣
- 子宮内膜間質細胞
- 胃の体
- 右精巣
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| | 上位の表現 | - 心室中隔
- 卵黄嚢
- 精母細胞
- 心室帯
- 網膜の神経層
- 胚の尾
- 精子細胞
- 耳小胞
- 胚
- 胚葉上層
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- RNA結合
- リボ核タンパク質複合体結合
| | 細胞成分 |
- 膜
- PeBoW複合体
- 染色体
- 核小体
- 凝縮染色体
- 核
- 核質
- 細胞質
- プレリボソーム、大サブユニット前駆体
| | 生物学的プロセス |
- タンパク質の細胞小器官への局在
- リボソーム生合成
- 細胞周期の調節
- 核小体の組織
- トリシストロン性rRNA転写産物(SSU-rRNA、5.8S rRNA、LSU-rRNA)からのLSU-rRNAの成熟
- 細胞集団の増殖
- rRNA処理
- トリシストロン性rRNA転写産物からの5.8S rRNAの成熟(SSU-rRNA、5.8S rRNA、LSU-rRNA)
- リボソーム大サブユニットの生合成
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001243225 NM_001282327 NM_001282328 NM_014303 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001230154 NP_001269256 NP_001269257 NP_055118 |
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| 場所(UCSC) | 22章: 30.58 – 30.61 Mb | 11章: 3.91 – 3.93 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ペスカディージョホモログは、ヒトではPES1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7] [8]
この遺伝子は、アストロサイトーシス由来の悪性腫瘍において異常に増加するタンパク質をコードする。この遺伝子は、この遺伝子産物の活性に必須のBRCTドメインを含む、強く保存された遺伝子である。この遺伝子は細胞増殖において重要な役割を果たしており、腫瘍形成および腫瘍の進行に必要である可能性がある。[8]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000100029 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000020430 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Allende ML, Amsterdam A, Becker T, Kawakami K, Gaiano N, Hopkins N (1997年1月). 「ゼブラフィッシュにおける挿入変異により、胚発生に必須の2つの新規遺伝子、pescadilloとdead eyeが同定された」. Genes Dev . 10 (24): 3141–55 . doi : 10.1101/gad.10.24.3141 . PMID 8985183.
- ^ Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN, Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP, et al. (1999年12月). 「ヒト22番染色体のDNA配列」. Nature . 402 (6761): 489–95 . Bibcode :1999Natur.402..489D. doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208.
- ^ Rohrmoser M, Holzel M, Grimm T, Malamoussi A, Harasim T, Orban M, Pfisterer I, Gruber-Eber A, Kremmer E, Eick D (2007年5月). 「Pes1、Bop1、WDR12の相互依存性が、60Sリボソームサブユニットの成熟に必要なPeBoW複合体の核小体局在と集合を制御する」Mol Cell Biol . 27 (10): 3682–94 . doi :10.1128/MCB.00172-07. PMC 1899993. PMID 17353269 .
- ^ ab "Entrez Gene: PES1 pescadillo homolog 1、BRCT ドメインを含む (ゼブラフィッシュ)".
さらに読む
- サンガーセンターT、ワシントン大学ゲノムシーケンシングセンターT (1999). 「完全なヒトゲノム配列の解明に向けて」Genome Res . 8 (11): 1097–108 . doi : 10.1101/gr.8.11.1097 . PMID 9847074.
- Kinoshita Y, Jarell AD, Flaman JM, et al. (2001). 「Pescadillo、悪性細胞で異常発現する新規細胞周期制御タンパク質」J. Biol. Chem . 276 (9): 6656–65 . doi : 10.1074/jbc.M008536200 . PMID 11071894.
- Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, et al. (2002). 「ヒト核小体の指向性プロテオーム解析」. Curr. Biol . 12 (1): 1– 11. Bibcode :2002CBio...12....1A. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298.
- Oeffinger M, Leung A, Lamond A, et al. (2002). 「酵母Pescadilloは60Sリボソームサブユニット合成における複数の活性に必要である」. RNA . 8 (5): 626–36 . doi :10.1017/S1355838202020022. PMC 1370283. PMID 12022229 .
- Scherl A, Couté Y, Déon C, et al. (2003). 「ヒト核小体の機能的プロテオーム解析」. Mol. Biol. Cell . 13 (11): 4100–9 . doi :10.1091/mbc.E02-05-0271. PMC 133617. PMID 12429849 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
- Lapik YR, Fernandes CJ, Lau LF, Pestov DG (2004). 「哺乳類リボソーム生合成におけるPes1とBop1の物理的および機能的相互作用」. Mol. Cell . 15 (1): 17– 29. doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.020 . PMID 15225545.
- Maiorana A, Tu X, Cheng G, Baserga R (2004). 「哺乳類細胞の形質転換と不死化におけるペスカディージョの役割」. Oncogene . 23 (42): 7116–24 . doi : 10.1038/sj.onc.1207916 . PMID 15273728.
- Collins JE, Wright CL, Edwards CA, et al. (2005). 「ゲノムアノテーションに基づくヒトORFeomeクローニングへのアプローチ」Genome Biol . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604. PMID 15461802 .
- Killian A, Le Meur N, Sesboüé R, et al. (2004). 「リボソーム生合成に関与するRRB1-Pescadillo経路の不活性化は染色体不安定性を誘導する」Oncogene . 23 (53): 8597–602 . doi :10.1038/sj.onc.1207845. PMID 15467761. S2CID 7435460.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクト:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)の現状、品質、そして拡大」Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et al. (2005). 「核小体プロテオームダイナミクス」. Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
- Hölzel M, Rohrmoser M, Schlee M, et al. (2005). 「哺乳類WDR12はPes1-Bop1複合体の新規メンバーであり、リボソーム生合成と細胞増殖に必須である」. J. Cell Biol . 170 (3): 367–78 . doi :10.1083/jcb.200501141. PMC 2171466. PMID 16043514 .
- 木村 功、若松 明、鈴木 雄一、他 (2006). 「転写調節の多様化:ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特性解析」Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
- Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). 「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 .