PKNOX2

Protein-coding gene in the species Homo sapiens

PKNOX2
識別子
エイリアスPKNOX2、PREP2、PBX/knotted 1 ホメオボックス 2
外部IDOMIM : 613066; MGI : 2445415; HomoloGene : 32527; GeneCards : PKNOX2; OMA :PKNOX2 - オルソログ
オーソログ
人間ねずみ
エントレズ
アンサンブル
ユニプロット
RefSeq (mRNA)

NM_022062

NM_001029838
NM_148950

RefSeq(タンパク質)

NP_001025009
NP_683752

場所(UCSC)11章: 125.16 – 125.43 Mb9章: 36.8 – 37.06 MB
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
人間の表示/編集マウスの表示/編集

PBX/Knotted 1 Homeobox 2 (PKNOX2)タンパク質は、ホメオドメインタンパク質の3アミノ酸ループ拡張(TALE)クラスに属し、ヒトではPKNOX2遺伝子によってコードされています。このタンパク質は他の遺伝子の転写を制御し、解剖学的発達に影響を与えます。[5]

関数

PKNOX2タンパク質は、 DNA配列特異的に、すなわち特定のDNA配列結合することで、他の遺伝子の発現を制御します。PKNOX2は、DNA認識モチーフに結合し、核転写因子として機能します。[6]核転写因子は DNAからメッセンジャーRNAの遺伝情報の転写を制御するタンパク質です。PKNOX2の他の機能には、アクチンフィラメントへの結合が含まれます。PKNOX2遺伝子の重要なパラログはPKNOX1です

構造

PKNOX2は、ホメオドメインタンパク質の3アミノ酸ループ拡張(TALE)クラスに属します。このクラスは、ホメオドメインのαヘリックス1と2の間に3アミノ酸の延長があることを特徴とします。[7]

ホメオドメインタンパク質は、高度に保存されたDNA結合ドメインを共有する配列特異的転写因子であり、細胞の増殖、分化、死に重要な役割を果たします。[7]

臨床的意義

2014年に発表されたアルコール依存症に関するゲノムワイド関連研究のレビュー記事では、機能解析(因果関係の証明)に基づき、 PKNOX2遺伝子に関連する遺伝子変異は、アルコール脱水素酵素クラスターに位置する遺伝子の役割と比較すると小さい役割ではあるものの、アルコール依存症リスクにおいて何らかの役割を果たしている可能性があると研究者らは結論付けています。[9]

参照

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000165495 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000035934 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  5. ^ Imoto I, Sonoda I, Yuki Y, Inazawa J (2001年9月). 「新規ホメオボックス含有遺伝子、ヒトPKNOX2の同定と特性解析」.生化学および生物理学的研究通信. 287 (1): 270–6 . Bibcode :2001BBRC..287..270I. doi :10.1006/bbrc.2001.5578. PMID  11549286.
  6. ^ Fognani C, Kilstrup-Nielsen C, Berthelsen J, Ferretti E, Zappavigna V, Blasi F (2002年5月). 「PREP1のパラログであるPREP2の特性評価。MEINOX TALEホメオドメイン転写因子の新規サブファミリーを定義する」Nucleic Acids Research 30 ( 9): 2043–51 . doi :10.1093/nar/30.9.2043. PMC 113854. PMID  11972344 . 
  7. ^ ab "PKNOX2 PBX/knotted 1 homeobox 2 - Gene - GTR - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov . 国立生物工学情報センター. 2020年8月31日閲覧.ホメオドメインタンパク質は、高度に保存されたDNA結合ドメインを共有する配列特異的な転写因子であり、細胞の増殖、分化、および死において基本的な役割を果たします。PKNOX2は、ホメオドメイン内のαヘリックス1と2の間に3アミノ酸の延長があるTALE(3アミノ酸ループ延長)クラスのホメオドメインタンパク質に属します。パブリックドメインこの記事には、パブリック ドメインであるこのソースからのテキストが組み込まれています
  8. ^ Iwata BA, Dozier CL (2008). 「機能分析法の臨床応用」.行動分析の実践. 1 (1): 3– 9. doi :10.1007/BF03391714. PMC 2846577. PMID  22477673 . 
  9. ^ Zuo L, Lu L, Tan Y, Pan X, Cai Y, Wang X, Hong J, Zhong C, Wang F, Zhang XY, Vanderlinden LA, Tabakoff B, Luo X (2014). 「アルコール依存症のゲノムワイド関連発見」. The American Journal on Addictions . 23 (6): 526–39 . doi :10.1111/j.1521-0391.2014.12147.x. PMC 4187224. PMID 25278008  . 
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