Protein-coding gene in the species Homo sapiens
| POLR2C |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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5IYC、5IY6、5IYD、5IY8、5IY7、5IY9、5IYA、5IYB、%%s5IYD、5IY8、5IYC、5IY6、5IY7、5IYA、5IY9、5IYB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | POLR2C、RPB3、RPB31、hRPB33、hsRPB3、ポリメラーゼ(RNA)IIサブユニットC、RNAポリメラーゼIIサブユニットC |
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| 外部ID | オミム:180663; MGI : 109299;ホモロジーン: 2017;ジーンカード:POLR2C; OMA :POLR2C - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 8番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 8|8 C5 | 始める | 95,584,078 bp [2] |
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| 終わり | 95,600,163 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - ランゲルハンス島
- 二次卵母細胞
- 下垂体前葉
- 心室帯
- 腓腹筋
- 左卵巣
- 膝窩動脈
- 脛骨動脈
- 右卵巣
- 下行胸部大動脈
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| | 上位の表現 | - 小腸上皮
- 腸絨毛
- 回腸上皮
- 胚
- 卵黄嚢
- 胚
- 心室帯
- 太ももの筋肉
- 神経節隆起
- 神経管
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合
- タンパク質二量体化活性
- RNAポリメラーゼII活性
- DNA指向性5'-3' RNAポリメラーゼ活性
- タンパク質結合
| | 細胞成分 |
- 微小管細胞骨格
- RNAポリメラーゼII、コア複合体
- 核
- 核質
- 細胞質
- 細胞質
| | 生物学的プロセス |
- スプライソソームを介したmRNAスプライシング
- RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写伸長
- 7-メチルグアノシンmRNAキャッピング
- 転写連動ヌクレオチド除去修復
- RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始
- RNAポリメラーゼIIによるsnRNA転写
- 線維芽細胞増殖因子受容体シグナル伝達経路
- RNAポリメラーゼIIによる転写
- RNA代謝プロセス
- miRNAによる遺伝子サイレンシングの制御
- 転写、DNAテンプレート
- 体性幹細胞集団の維持
- ウイルス転写の正の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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DNA標的RNAポリメラーゼIIサブユニットRPB3は、ヒトではPOLR2C遺伝子によってコードされている酵素である。[5]
関数
この遺伝子は、真核生物においてメッセンジャーRNAの合成を担うポリメラーゼであるRNAポリメラーゼIIの3番目に大きいサブユニットをコードしている。この遺伝子産物はシステインに富む領域を含み、別のポリメラーゼサブユニットであるPOLR2Jとヘテロ二量体として存在する。これら2つのサブユニットは、ポリメラーゼのコアサブアセンブリユニットを形成する。21番染色体上に偽遺伝子が同定されている。 [6]
相互作用
POLR2C は以下と相互作用することが示されています。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000102978 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000031783 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Acker J, Mattei MG, Wintzerith M, Roeckel N, Depetris D, Vigneron M, Kedinger C (1994年8月). 「ヒトRNAポリメラーゼIIサブユニット遺伝子の染色体局在」. Genomics . 20 (3): 496–9 . doi :10.1006/geno.1994.1208. PMID 8034326.
- ^ 「Entrez Gene: POLR2Cポリメラーゼ(RNA)II(DNA指向性)ポリペプチドC、33kDa」。
- ^ デ・アンジェリス R、イエッツィ S、ブルーノ T、コルビ N、ディ・パドバ M、フロリディ A、ファンシウリ M、パッサナンティ C (2003 年 7 月)。 「RNA ポリメラーゼ II のサブユニット 3 (RPB3) と転写因子 4 (ATF4) の機能的相互作用」。FEBS レット。547 ( 1–3 ): 15–9 .土井:10.1016/s0014-5793(03)00659-8。PMID 12860379。S2CID 33230891 。
- ^ Corbi N, Bruno T, De Angelis R, Di Padova M, Libri V, Di Certo MG, Spinardi L, Floridi A, Fanciulli M, Passananti C (2005年9月). 「RNAポリメラーゼIIサブユニット3は、尋常性乾癬の候補遺伝子産物であるHCRとの相互作用により細胞質内に保持される」. J. Cell Sci . 118 (Pt 18): 4253–60 . doi : 10.1242/jcs.02545 . PMID 16141233.
- ^ ab Corbi N, Di Padova M, De Angelis R, Bruno T, Libri V, Iezzi S, Floridi A, Fanciulli M, Passananti C (2002年10月). 「α様RNAポリメラーゼIIコアサブユニット3(RPB3)は、筋原性因子ミオジェニンとの相互作用を介して組織特異的転写および筋分化に関与する」FASEB J. 16 ( 12): 1639–41 . doi : 10.1096/fj.02-0123fje . PMID 12207009. S2CID 30243193.
- ^ abcdefghi アッカー J、デ グラーフ M、シェイネル I、カザク V、ケディンガー C、ヴィニュロン M (1997 年 7 月)。 「ヒトRNAポリメラーゼIIサブユニット間の相互作用」。J.Biol.化学。272 (27): 16815–21 .土井: 10.1074/jbc.272.27.16815。PMID 9201987。
- ^ Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (1998年3月). 「EWSはTFIIDとRNAポリメラーゼIIの両方と関連するが、EWS-FLI-1はそうではない:TETファミリーの2つのメンバー、EWSとhTAFII68、およびTFIIDおよびRNAポリメラーゼII複合体のサブユニット間の相互作用」Mol. Cell. Biol . 18 (3): 1489–97 . doi :10.1128/mcb.18.3.1489. PMC 108863. PMID 9488465 .
さらに読む
- Jeang KT (1998). 「Tat、Tat関連キナーゼ、および転写」. J. Biomed. Sci . 5 (1): 24–7 . doi :10.1007/BF02253352. PMID 9570510.
- Yankulov K, Bentley D (1998). 「転写制御:Tat補因子と転写伸長」. Curr. Biol . 8 (13): R447–9. Bibcode :1998CBio....8.R447Y. doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . PMID 9651670. S2CID 15480646.
- Romano G, Kasten M, De Falco G, Micheli P, Khalili K, Giordano A (2000). 「HIV tatトランス活性化経路遺伝子発現におけるCdk9とサイクリンT1の調節機能」. J. Cell. Biochem . 75 (3): 357– 68. doi :10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. PMID 10536359. S2CID 43685090.
- Marcello A, Zoppé M, Giacca M (2002). 「HIV-1 Tatトランスアクチベーターによる多様な転写制御モード」IUBMB Life . 51 (3): 175–81 . doi : 10.1080/152165401753544241 . PMID 11547919. S2CID 10931640.
- Stevens M, De Clercq E, Balzarini J (2007). 「HIV-1転写の制御:化学療法介入のための分子標的」Med Res Rev . 26 (5): 595– 625. doi :10.1002/med.20081. PMC 7168390. PMID 16838299 .
- Harrich D, McMillan N, Munoz L, Apolloni A, Meredith L (2007). 「多様なTat相互作用は新たな抗レトロウイルス薬の標的につながるか?」Current Drug Targets . 7 (12): 1595– 606. doi :10.2174/138945006779025338. PMID 17168834.
- Kato H, Sumimoto H, Pognonec P, Chen CH, Rosen CA, Roeder RG (1992). 「HIV-1 Tatは細胞伸長因子と共存し、in vitroでプロセッシング因子として作用する」. Genes Dev . 6 (4): 655–66 . doi : 10.1101/gad.6.4.655 . PMID 1559613.
- Pati UK, Weissman SM (1990). 「ヒトRNAポリメラーゼII 33kDaサブユニットhRPB 33のアミノ酸配列は真核生物間で高度に保存されている」. J. Biol. Chem . 265 (15): 8400–3 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)38900-8 . PMID 2187864.
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- Herrmann CH, Rice AP (1995). 「レンチウイルスのTatタンパク質は、RNAポリメラーゼIIのラージサブユニットのカルボキシル末端ドメインを過リン酸化させる細胞性タンパク質キナーゼTAKと特異的に結合する:Tat補因子の候補」J. Virol . 69 (3): 1612–20 . doi :10.1128/JVI.69.3.1612-1620.1995. PMC 188757. PMID 7853496 .
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- Chun RF, Jeang KT (1996). 「ヒトレトロウイルス(ヒトT細胞リンパ球向性ウイルスIおよびHIV-1)の活性化転写におけるRNAポリメラーゼIIカルボキシル末端ドメインの要件」J. Biol. Chem . 271 (44): 27888–94 . doi : 10.1074/jbc.271.44.27888 . PMID 8910388.
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