POLR2E

POLR2E
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 5IY6、5IY9、5IY8、5IYA、5IYB、5IY7、5IYC、5IYD
識別子
エイリアス	POLR2E、RPABC1、RPB5、XAP4、hRPB25、hsRPB5、ポリメラーゼ（RNA）IIサブユニットE、RNAポリメラーゼIIサブユニットE、RNAポリメラーゼII、IおよびIIIサブユニットE
外部ID	オミム: 180664; MGI : 1913670;ホモロジーン: 2018;ジーンカード：POLR2E; OMA :POLR2E - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 19番染色体（ヒト）[1] バンド 19p13.3 始める 1,086,574 bp [1] 終わり 1,095,380 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 10番染色体（マウス）[2] バンド 10|10 C1 始める 79,871,783 bp [2] 終わり 79,875,629 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 子宮内膜間質細胞 肝臓の右葉 前頭前皮質 右前頭葉 太ももの筋肉 S状結腸の筋層 右副腎 膝窩動脈 腹部の脂肪 脛骨動脈 上位の表現 卵黄嚢 胚 桑実胚 胚 体節 胚盤胞 胚葉上層 下顎突出 上顎突出 耳板 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 RNAポリメラーゼII活性 RNAポリメラーゼIII活性 タンパク質結合 RNAポリメラーゼI活性 DNA指向性5'-3' RNAポリメラーゼ活性 細胞成分 細胞質 RNAポリメラーゼI複合体 RNAポリメラーゼIII複合体 RNAポリメラーゼII、コア複合体 核 核質 生物学的プロセス RNAポリメラーゼI転写の終結 スプライソソームを介したmRNAスプライシング 転写能のある構造におけるクロマチンのエピジェネティックな維持 RNAポリメラーゼIプロモーターからの転写開始 RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写伸長 7-メチルグアノシンmRNAキャッピング RNAポリメラーゼIIによる転写 転写連動ヌクレオチド除去修復 RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始 ウイルスプロセス RNAポリメラーゼIIIによる転写 線維芽細胞増殖因子受容体シグナル伝達経路 RNAポリメラーゼIIによるsnRNA転写 RNA代謝プロセス miRNAによる遺伝子サイレンシングの制御 転写、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIプロモーターからの転写伸長 I型インターフェロン産生の正の調節 体性幹細胞集団の維持 ウイルス転写の正の制御 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 5434 66420 アンサンブル ENSG00000099817 ENSMUSG00000004667 ユニプロット P19388 Q80UW8 RefSeq (mRNA) NM_002695 NM_001316323 NM_001316324 NM_025554 RefSeq（タンパク質） NP_001303252 NP_001303253 NP_002686 NP_079830 場所（UCSC） 19章: 1.09 – 1.1 Mb 10章: 79.87 – 79.88 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

DNA標的RNAポリメラーゼI、II、IIIサブユニットRPABC1は、ヒトではPOLR2E遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]

この遺伝子は、真核生物においてメッセンジャーRNAの合成を担うRNAポリメラーゼIIの5番目に大きいサブユニットをコードしています。このサブユニットは、他の2つのDNA標的RNAポリメラーゼと共有されており、他のポリメラーゼサブユニットよりも2倍モル過剰に存在します。このサブユニットと肝炎ウイルスの転写活性化タンパク質との相互作用が実証されており、転写活性化因子とポリメラーゼとの相互作用がこのサブユニットを介して起こり得ることを示唆しています。擬遺伝子は11番染色体上に位置しています。^[6]

相互作用

POLR2EはTAF15、^[7] POLR2C、^[8] POLR2G、^[8] POLR2H、^[8] POLR2A、^[8] POLR2B、^[8] POLR2L ^[8]およびGTF2F2と相互作用することが示されている。^[9]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000099817 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000004667 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Acker J, Mattei MG, Wintzerith M, Roeckel N, Depetris D, Vigneron M, Kedinger C (1994年8月). 「ヒトRNAポリメラーゼIIサブユニット遺伝子の染色体局在」. Genomics . 20 (3): 496– 499. doi :10.1006/geno.1994.1208. PMID  8034326.
6. 「Entrez Gene: POLR2Eポリメラーゼ(RNA)II(DNA指向)ポリペプチドE、25kDa」。
7. Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (1998年3月). 「EWSはTFIIDとRNAポリメラーゼIIの両方と関連するが、EWS-FLI-1は関連しない：TETファミリーの2つのメンバー、EWSとhTAFII68、およびTFIIDおよびRNAポリメラーゼII複合体のサブユニット間の相互作用」Mol. Cell. Biol . 18 (3). アメリカ合衆国: 1489– 1497. doi :10.1128/mcb.18.3.1489. ISSN  0270-7306. PMC 108863. PMID 9488465  . 
8. Acker J, de Graaff M, Cheynel I, Khazak V, Kedinger C, Vigneron M (1997年7月). 「ヒトRNAポリメラーゼIIサブユニット間の相互作用」. J. Biol. Chem . 272 (27). アメリカ合衆国: 16815– 16821. doi : 10.1074/jbc.272.27.16815 . ISSN  0021-9258. PMID  9201987.
9. Wei W, Dorjsuren D, Lin Y, Qin W, Nomura T, Hayashi N, Murakami S (2001年4月). 「転写因子IIF（TFIIF）のサブユニットRAP30とRNAポリメラーゼサブユニット5の直接的な相互作用は、TFIIFとRNAポリメラーゼIIの会合に寄与する」J. Biol. Chem . 276 (15). 米国: 12266– 12273. doi : 10.1074/jbc.M009634200 . ISSN  0021-9258. PMID  11278533.

さらに読む

• Jeang KT (1998). 「Tat、Tat関連キナーゼ、および転写」. J. Biomed. Sci . 5 (1): 24– 27. doi :10.1007/BF02253352. PMID  9570510.
• Yankulov K, Bentley D (1998). 「転写制御：Tat補因子と転写伸長」. Curr. Biol . 8 (13): R447–9. Bibcode :1998CBio....8.R447Y. doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . PMID  9651670. S2CID  15480646.
• Romano G, Kasten M, De Falco G, et al. (2000). 「HIV tatトランス活性化経路遺伝子発現におけるCdk9およびサイクリンT1の調節機能」. J. Cell. Biochem . 75 (3): 357– 368. doi :10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. PMID  10536359. S2CID  43685090.
• Marcello A, Zoppé M, Giacca M (2002). 「HIV-1 Tatトランスアクチベーターによる多様な転写制御モード」IUBMB Life . 51 (3): 175– 181. doi : 10.1080/152165401753544241 . PMID  11547919. S2CID  10931640.
• Stevens M, De Clercq E, Balzarini J (2007). 「HIV-1転写の制御：化学療法介入のための分子標的」Med Res Rev . 26 (5): 595– 625. doi :10.1002/med.20081. PMC  7168390. PMID 16838299  .
• Harrich D, McMillan N, Munoz L, et al. (2007). 「多様なTat相互作用は新たな抗レトロウイルス薬の標的につながるか？」Current Drug Targets . 7 (12): 1595– 1606. doi :10.2174/138945006779025338. PMID  17168834.
• Kato H, Sumimoto H, Pognonec P, et al. (1992). 「HIV-1 Tatは細胞伸長因子と共存し、in vitroでプロセッシング因子として作用する」. Genes Dev . 6 (4): 655– 666. doi : 10.1101/gad.6.4.655 . PMID  1559613.
• Pati UK, Weissman SM (1991). 「ヒトRNAポリメラーゼIIの23kDaサブユニットをコードするcDNAの単離と分子的特性解析」. J. Biol. Chem . 266 (20): 13468. doi : 10.1016/S0021-9258(18)98863-0 . PMID  2071613.
• Southgate C, Zapp ML, Green MR (1990). 「新生RNAに別のタンパク質を介して結合したHIV-1 Tatタンパク質による転写活性化」Nature 345 (6276): 640– 642. Bibcode :1990Natur.345..640S. doi :10.1038/345640a0. PMID  2190099. S2CID  4233742.
• Pati UK, Weissman SM (1989). 「ヒトRNAポリメラーゼIIの23kDaサブユニットをコードするcDNAの単離と分子的特性解析」. J. Biol. Chem . 264 (22): 13114– 13121. doi : 10.1016/S0021-9258(18)51603-3 . PMID  2753903.
• Wu-Baer F, Sigman D, Gaynor RB (1995). 「RNAポリメラーゼIIのヒト免疫不全ウイルストランス活性化領域RNAへの特異的結合は、細胞内補因子およびTatによって制御される」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (16): 7153– 7157. Bibcode :1995PNAS...92.7153W. doi : 10.1073/pnas.92.16.7153 . PMC  41297. PMID  7638159 .
• Cheong JH, Yi M, Lin Y, Murakami S (1995). 「真核生物の核RNAポリメラーゼに共通するサブユニットであるヒトRPB5は、ヒトB型肝炎ウイルスXタンパク質に結合し、Xのトランス活性化に関与する可能性がある」EMBO J. 14 ( 1): 143– 150. doi :10.1002/j.1460-2075.1995.tb06984.x. PMC  398061. PMID  7828586 .
• Herrmann CH, Rice AP (1995). 「レンチウイルスのTatタンパク質は、RNAポリメラーゼIIのラージサブユニットのカルボキシル末端ドメインを過リン酸化させる細胞性タンパク質キナーゼTAKと特異的に結合する：Tat補因子の候補」J. Virol . 69 (3): 1612– 1620. doi :10.1128/jvi.69.3.1612-1620.1995. PMC  188757. PMID  7853496 .
• Keen NJ, Gait MJ, Karn J (1996). 「ヒト免疫不全ウイルス1型Tatは活性化転写伸長複合体の不可欠な構成要素である」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (6): 2505– 2510. Bibcode :1996PNAS...93.2505K. doi : 10.1073/pnas.93.6.2505 . PMC  39827. PMID 8637904  .
• Yang X, Herrmann CH, Rice AP (1996). 「ヒト免疫不全ウイルスTatタンパク質は生体内でTAKと特異的に会合し、その機能にはRNAポリメラーゼIIのカルボキシル末端ドメインを必要とする」. J. Virol . 70 (7): 4576– 4584. doi :10.1128/jvi.70.7.4576-4584.1996. PMC  190394. PMID  8676484 .
• Agostini I, Navarro JM, Rey F, et al. (1996). 「ヒト免疫不全ウイルス1型Vprトランスアクチベーター：プロモーター結合アクチベータードメインとの協調およびTFIIBへの結合」J. Mol. Biol . 261 (5): 599– 606. doi :10.1006/jmbi.1996.0485. PMID  8800208.
• Zhou Q, Sharp PA (1996). 「Tat-SF1：HIV-1 Tatによる転写伸長の刺激における補因子」. Science . 274 (5287): 605– 610. Bibcode :1996Sci...274..605Z. doi :10.1126/science.274.5287.605. PMID  8849451. S2CID  13266489.
• Okamoto H, Sheline CT, Corden JL, et al. (1996). 「ヒト免疫不全ウイルスTatタンパク質によるトランス活性化にはRNAポリメラーゼIIのC末端ドメインが必要である」Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 93 (21): 11575– 11579. Bibcode :1996PNAS...9311575O. doi : 10.1073/pnas.93.21.11575 . PMC  38099. PMID  8876177.
• Chun RF, Jeang KT (1996). 「ヒトレトロウイルス（ヒトT細胞リンパ球向性ウイルスIおよびHIV-1）の活性化転写におけるRNAポリメラーゼIIカルボキシル末端ドメインの要件」J. Biol. Chem . 271 (44): 27888– 27894. doi : 10.1074/jbc.271.44.27888 . PMID  8910388.