ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
PPEF1 識別子 エイリアス PPEF1 、PP7、PPEF、PPP7C、PPP7CA、EFハンドドメイン1を持つタンパク質ホスファターゼ 外部ID オミム ：300109; MGI : 1097157; ホモロジーン : 55960; ジーンカード ：PPEF1; OMA :PPEF1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） キリスト X染色体（マウス） [2] バンド X F4|X 73.95 cM 始める 159,406,090 bp [2] 終わり 159,518,761 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） 上位の表現 精子 二次卵母細胞 内皮細胞 脊髄神経節 睾丸 左精巣 右精巣 C1セグメント 前頭前皮質 眼窩前頭皮質
上位の表現 精子細胞 二次卵母細胞 接合子 睾丸 一次卵母細胞 精母細胞 脊髄神経節 胚 胚 神経節
より多くの参照表現データ
バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能
鉄イオン結合 カルシウムイオン結合 タンパク質セリン/スレオニンホスファターゼ活性 リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性 マンガンイオン結合 加水分解酵素活性 金属イオン結合 タンパク質結合 細胞成分 生物学的プロセス
タンパク質の脱リン酸化 感覚知覚に関わる刺激の検出 ロドプシンを介したシグナル伝達経路の調節 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_006240 NM_152223 NM_152224 NM_152225 NM_152226 NM_001377986 NM_001377993 NM_001377994 NM_001377995 NM_001377996 NM_001378381 NM_001378382 NM_001389620 NM_001389621 NM_001389623 NM_001389624
RefSeq（タンパク質） NP_006231 NP_689410 NP_689412 NP_001364915 NP_001364922 NP_001364923 NP_001364924 NP_001364925 NP_001365310 NP_001365311
場所（UCSC） 染色体X: 18.68 – 18.83 Mb 染色体X: 159.41 – 159.52 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
EFハンド1を有するセリン/スレオニンタンパク質ホスファターゼは、 ヒトでは PPEF1 遺伝子によってコードされる 酵素 である 。 [5] [6] [7]
関数 この遺伝子は、EFハンドモチーフファミリーを有するセリン/スレオニンプロテインホスファターゼのメンバーをコードしています。このタンパク質は、プロテインホスファターゼ触媒ドメインと、C末端に少なくとも2つのEFハンドカルシウム結合モチーフを有しています。基質は不明ですが、コードされているタンパク質は、特定の感覚ニューロンの機能および/または発達において何らかの役割を果たすことが示唆されています。この遺伝子は、ショウジョウバエ網膜変性C遺伝子（rdgC）と高い配列相同性を有しています。それぞれ異なるアイソフォームをコードする、複数の選択的スプライシング転写バリアントが報告されています。 [7]
相互作用 PPEF1はカルモジュリン1 と 相互作用する ことが示されている 。 [8]
参考文献
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さらに読む
Herzig S, Neumann J (2000年1月). 「興奮性膜におけるセリン／スレオニンプロテインホスファターゼのイオンチャネルへの影響」. Physiological Reviews . 80 (1): 173– 210. doi :10.1152/physrev.2000.80.1.173. PMID 10617768. S2CID 17770945. Huang X, Honkanen RE (1998年1月). 「ショウジョウバエ網膜変性C遺伝子産物（rdgC）と相同性を持つ新規ヒトセリン／スレオニンプロテインホスファターゼPP7の分子クローニング、発現、および特性解析」 The Journal of Biological Chemistry . 273 (3): 1462–8 . doi : 10.1074/jbc.273.3.1462 . PMID 9430683. Ramulu P, Kennedy M, Xiong WH, Williams J, Cowan M, Blesh D, Yau KW, Hurley JB, Nathans J (2001年12月). 「EFハンドを持つタンパク質ホスファターゼ（PPEF-1およびPPEF-2）を欠損したマウスにおける正常な光反応、光受容体の完全性、およびロドプシンの脱リン酸化」. Molecular and Cellular Biology . 21 (24): 8605–14 . doi :10.1128/MCB.21.24.8605-8614.2001. PMC 100021. PMID 11713293 . Kutuzov MA、Solov'eva OV、Andreeva AV、Bennett N (2002 年 5 月)。 「タンパク質 Ser/Thr ホスファターゼ PPEF はカルモジュリンと相互作用します。」 生化学および生物物理学研究コミュニケーション 。 293 (3): 1047–52 。 ビブコード :2002BBRC..293.1047K。 土井 ：10.1016/S0006-291X(02)00338-8。 PMID 12051765。 Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (2003年5月). 「N末端ペプチドの質量分析によるプロテオームの探索とタンパク質プロセシングの解析」 Nature Biotechnology 21 ( 5): 566–9 . doi :10.1038/nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563. Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). 「RNAサーベイランスの過小評価された役割」. Genome Biology . 5 (2) R8. doi : 10.1186/gb-2004-5-2-r8 . PMC 395752. PMID 14759258 . ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット・スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。 自然 。 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
