PPP1R8

PPP1R8
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3V4Y
識別子
エイリアス	PPP1R8、ARD-1、ARD1、NIPP-1、NIPP1、PRO2047、タンパク質ホスファターゼ1調節サブユニット8
外部ID	オミム：602636; MGI : 2140494;ホモロジーン: 8555;ジーンカード: PPP1R8; OMA :PPP1R8 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 染色体1（ヒト）[1] バンド 1p35.3 始める 27,830,782 bp [1] 終わり 27,851,676 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 4番染色体（マウス）[2] バンド 4|4 D2.3 始める 132,554,240 bp [2] 終わり 132,570,480 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 アキレス腱 心室帯 ランゲルハンス島 神経節隆起 子宮内膜間質細胞 平滑筋組織 リンパ節 C1セグメント 顆粒球 S状結腸粘膜 上位の表現 体節 下顎突出 上顎突出 胚葉上層 内側神経節隆起 腹壁 手 耳小胞 顆頭 人間の胎児 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質セリン/スレオニンホスファターゼ阻害活性 DNA結合 タンパク質結合 RNA結合 タンパク質ホスファターゼ阻害活性 ヌクレアーゼ活性 エンドヌクレアーゼ活性 リボヌクレアーゼE活性 加水分解酵素活性 mRNA結合 タンパク質ホスファターゼ調節活性 細胞成分 細胞質 核の粒子 核質 スプライセオソーム複合体 核 生物学的プロセス 転写の制御、DNAテンプレート 核酸ホスホジエステル結合の加水分解 mRNA処理 RNA分解プロセス 転写、DNAテンプレート RNAスプライシング 細胞集団の増殖 RNAホスホジエステル結合の加水分解 タンパク質脱リン酸化の負の制御 リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性の負の調節 リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性の調節 miRNAによる遺伝子サイレンシングに関与するmiRNAの産生 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 5511 100336 アンサンブル ENSG00000117751 ENSMUSG00000028882 ユニプロット Q12972 Q8R3G1 RefSeq (mRNA) NM_138558 NM_002713 NM_014110 NM_001290725 NM_146154 NM_001355198 NM_001355199 RefSeq（タンパク質） NP_002704 NP_054829 NP_612568 NP_001277654 NP_666266 NP_001342127 NP_001342128 場所（UCSC） 1章: 27.83 – 27.85 Mb 4号線: 132.55 – 132.57 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

核タンパク質ホスファターゼ阻害因子1は、ヒトではPPP1R8遺伝子によってコードされる酵素である。^{[5] [6] [7]}

この遺伝子は、選択的スプライシングによって3つの異なるアイソフォームをコードします。この遺伝子によってコードされるタンパク質アイソフォームのうち2つは、1型セリン／スレオニンタンパク質ホスファターゼの特異的阻害剤であり、RNAに結合するものの切断は行いません。3つ目のタンパク質アイソフォームはホスファターゼ阻害機能を欠いていますが、大腸菌のRNase Eに匹敵する一本鎖エンドリボヌクレアーゼです。このアイソフォームは機能するためにマグネシウムを必要とし、RNAのA+Uに富む領域内の特定の部位を切断します。^[7]

相互作用

PPP1R8はPPP1CA、^{[8] [9]}ヒストン脱アセチル化酵素2、^[8] SF3B1 ^[10] EED ^[8]およびPRC2のEZH2ドメインと相互作用することが示されている。^[11]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000117751 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000028882 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Wang M, Cohen SN (1994年11月). 「ard-1：大腸菌rne遺伝子における温度感受性および欠失変異の影響を逆転させ、RNase E様切断を引き起こす活性をコードするヒト遺伝子」Proc Natl Acad Sci USA . 91 (22): 10591–5 . Bibcode :1994PNAS...9110591W. doi : 10.1073/pnas.91.22.10591 . PMC 45067. PMID  7524097 . 
6. 三島 功、土屋 正之、ナイチンゲール MS、モス J、ヴォーン M (1993年5月). 「ARD 1、カルボキシル末端にADPリボシル化因子ドメインを有する64kDaグアニンヌクレオチド結合タンパク質」J Biol Chem . 268 (12): 8801–7 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)52945-8 . PMID  8473324.
7. "Entrez Gene: PPP1R8 タンパク質ホスファターゼ 1、調節 (阻害剤) サブユニット 8".
8. Jin Q, van Eynde Aleyde, Beullens Monique, Roy Nivedita, Thiel Gerald, Stalmans Willy, Bollen Mathieu (2003年8月). 「タンパク質ホスファターゼ1（PP1）調節因子であり、PP1の核内阻害剤（NIPP1）は、ポリコーム群タンパク質である胚性外胚葉発生（EED）と相互作用し、転写抑制因子として機能する」. J. Biol. Chem . 278 (33): 30677–85 . doi : 10.1074/jbc.M302273200 . ISSN  0021-9258. PMID  12788942.
9. Ajuh PM, Browne GJ, Hawkes NA, Cohen PT, Roberts SG, Lamond AI (2000年2月). 「タンパク質ホスファターゼ1活性とヒト因子C1（HCF）複合体との関連」. Nucleic Acids Res . 28 (3): 678–86 . doi :10.1093/nar/28.3.678. PMC 102561. PMID 10637318  . 
10. Boudrez A, Beullens Monique, Waelkens Etienne, Stalmans Willy, Bollen Mathieu (2002年8月). 「スプライシング因子SAP155とNIPP1間のリン酸化依存性相互作用」. J. Biol. Chem . 277 (35): 31834–41 . doi : 10.1074/jbc.M204427200 . ISSN  0021-9258. PMID  12105215.
11. Ferreira M, Verbinnen I, Fardilha M, Van Eynde A, Bollen M (2018年11月). 「精巣におけるタンパク質ホスファターゼ1調節因子NIPP1の欠失は、ヒストンメチルトランスフェラーゼEZH2の過剰リン酸化および分解を引き起こす」J. Biol. Chem . 293 (47): 18031– 18039. doi : 10.1074/jbc.AC118.005577 . PMC 6254331. PMID  30305391 . 

さらに読む

• Van Eynde A, Wera S, Beullens M, et al. (1996). 「タンパク質ホスファターゼ-1の核内阻害剤であるNIPP-1の分子クローニングにより、RNAプロセシングに関与するポリペプチドとの相同性が明らかになった」. J. Biol. Chem . 270 (47): 28068–74 . doi : 10.1074/jbc.270.47.28068 . PMID  7499293.
• Claverie-Martin F, Wang M, Cohen SN (1997). 「ヒト細胞由来のARD-1 cDNAは、大腸菌RNase Eに機能的に類似する部位特異的な一本鎖エンドリボヌクレアーゼをコードする。」J. Biol. Chem . 272 (21): 13823–8 . doi : 10.1074/jbc.272.21.13823 . PMID  9153239.
• Vulsteke V, Beullens M, Waelkens E, et al. (1998). 「バキュロウイルス発現核内タンパク質ホスファターゼ阻害剤-1（NIPP-1）の特性とリン酸化部位」. J. Biol. Chem . 272 (52): 32972–8 . doi : 10.1074/jbc.272.52.32972 . PMID  9407077.
• ファン・エインデA、ペレス＝カジェホンE、シェーンメイカーズEなど。 （1999年）。 「プロテインホスファターゼ核阻害剤-1 (NIPP-1) をコードする遺伝子の構成と選択的スプライス産物」。ユーロ。 Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．261 (1): 291–300 .土井: 10.1046/j.1432-1327.1999.00272.x。PMID  10103062。
• Jin Q, Beullens M, Jagiello I, et al. (1999). 「タンパク質ホスファターゼ1の核標的サブユニットであるNIPP1のRNA結合ドメインおよびエンドリボヌクレアーゼドメインのマッピング」Biochem. J. 342. ( Pt 1) (1): 13–9 . doi :10.1042/0264-6021:3420013. PMC  1220430. PMID 10432294  .
• Chang AC, Sohlberg B, Trinkle-Mulcahy L, et al. (2000). 「選択的スプライシングは、ARD-1エンドリボヌクレアーゼと、タンパク質ホスファターゼ-1阻害剤であるNIPP-1の、同一遺伝子によってコードされるアイソフォームの産生を制御する」Gene . 240 (1): 45– 55. doi : 10.1016/S0378-1119(99)00435-7 . PMID  10564811.
• Boudrez A, Beullens M, Groenen P, et al. (2000). 「NIPP1を介したタンパク質ホスファターゼ1とCDC5L（pre-mRNAスプライシングおよび有糸分裂開始の制御因子）との相互作用」J. Biol. Chem . 275 (33): 25411–7 . doi : 10.1074/jbc.M001676200 . PMID  10827081.
• Jagiello I, Van Eynde A, Vulsteke V, et al. (2001). 「タンパク質ホスファターゼ-1調節因子NIPP1の核および核下標的配列」. J. Cell Sci . 113. Pt 21 (21): 3761–8 . doi :10.1242/jcs.113.21.3761. PMID  11034904.
• Beullens M, Vulsteke V, Van Eynde A, et al. (2001). 「NIPP1（核内タンパク質ホスファターゼ-1阻害剤）のC末端には、チロシンリン酸化とRNA結合によって制御されるタンパク質ホスファターゼ-1の新規結合部位が存在する」Biochem. J. 352. Pt 3 (Pt 3): 651–8 . PMC  1221501. PMID  11104670 .
• Trinkle-Mulcahy L, Sleeman JE, Lamond AI (2002). 「生きた哺乳類細胞の核内におけるタンパク質ホスファターゼ1の動的ターゲティング」 . J. Cell Sci . 114 (Pt 23): 4219–28 . doi :10.1242/jcs.114.23.4219. PMID  11739654.
• Beullens M, Bollen M (2002). 「タンパク質ホスファターゼ-1調節因子NIPP1は、スプライソソーム構築の後期段階に関与するスプライシング因子でもある」. J. Biol. Chem . 277 (22): 19855–60 . doi : 10.1074/jbc.M200847200 . PMID  11909864.
• Boudrez A, Beullens M, Waelkens E, et al. (2002). 「スプライシング因子SAP155とNIPP1間のリン酸化依存性相互作用」J. Biol. Chem . 277 (35): 31834–41 . doi : 10.1074/jbc.M204427200 . PMID  12105215.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Ammosova T, Jerebtsova M, Beullens M, et al. (2003). 「核タンパク質ホスファターゼ-1はHIV-1転写を制御する」. J. Biol. Chem . 278 (34): 32189–94 . doi : 10.1074/jbc.M300521200 . PMID  12788939.
• Jin Q, van Eynde A, Beullens M, et al. (2003). 「タンパク質ホスファターゼ1（PP1）制御因子であり、PP1の核内阻害剤であるNIPP1は、ポリコーム群タンパク質である胚性外胚葉発生（EED）と相互作用し、転写抑制因子として機能する」J. Biol. Chem . 278 (33): 30677–85 . doi : 10.1074/jbc.M302273200 . PMID  12788942.
• Vulsteke V, Beullens M, Boudrez A, et al. (2004). 「細胞周期制御性タンパク質キナーゼMELKによるスプライソソーム形成の阻害とスプライシング因子NIPP1の関与」J. Biol. Chem . 279 (10): 8642–7 . doi : 10.1074/jbc.M311466200 . PMID  14699119.
• Colland F, Jacq X, Trouplin V, et al. (2004). 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」Genome Res . 14 (7): 1324–32 . doi :10.1101/gr.2334104. PMC  442148. PMID  15231748 .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928.  PMID 15489334  .