PTPN6

PTPN6
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1FPR、1GWZ、1X6C、2B3O、2RMX、2YU7、3PS5、4GRY、4GRZ、4GS0、4HJP、4HJQ​​​​​​
識別子
エイリアス	PTPN6、HCP、HCPH、HPTP1C、PTP-1C、SH-PTP1、SHP-1、SHP-1L、SHP1、タンパク質チロシンホスファターゼ、非受容体型6、タンパク質チロシンホスファターゼ非受容体型6
外部ID	オミム: 176883 ; MGI : 96055 ;ホモロジーン: 56589 ;ジーンカード：PTPN6 ; OMA : PTPN6 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 12番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 12p13.31 始める 6,946,468 bp [ 1 ] 終わり 6,961,316 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 6番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 6 F2|6 59.17 cM 始める 1億2469万7670bp [ 2 ] 終わり 1億2471万5677bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 顆粒球 脾臓 単球 血 骨髄細胞 付録 リンパ節 横行結腸粘膜 右肺 左肺の上葉 上位の表現 顆粒球 脾臓 胸腺 腸間膜リンパ節 血 脛大腿関節 骨髄間質 原腸胚 右肺葉 右腎臓 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性 SH3ドメイン結合 ホスファターゼ活性 リン酸化チロシン残基結合 SH2ドメイン結合 タンパク質結合 膜貫通受容体タンパク質チロシンホスファターゼ活性 加水分解酵素活性 タンパク質キナーゼ結合 細胞接着分子の結合 タンパク質チロシンホスファターゼ活性 リン酸化依存性タンパク質結合 細胞成分 細胞質 細胞質 膜 細胞間接合 α-βT細胞受容体複合体 核小体 細胞外エクソソーム 核 細胞外領域 特定の顆粒腔 三次顆粒腔 核質 タンパク質含有複合体 生物学的プロセス B細胞受容体シグナル伝達経路 巨核球の発達 Gタンパク質共役受容体シグナル伝達経路 細胞分化 細胞内シグナル伝達 細胞質への隔離されたカルシウムイオンの放出の調節 不完全有糸分裂細胞周期 T細胞共刺激 タンパク質の脱リン酸化 血小板形成 T細胞受容体シグナル伝達経路の負の制御 血小板活性化 循環免疫グロブリンを介した体液性免疫応答の負の調節 有糸分裂細胞周期のG1/S移行の調節 T細胞増殖の負の制御 I型インターフェロンを介したシグナル伝達経路の調節 ペプチジルチロシンリン酸化の負の制御 MAPキナーゼ活性の負の制御 造血前駆細胞の分化 細胞集団増殖の正の調節 MAPKカスケードの負の制御 ERK1とERK2カスケードの調節 B細胞受容体シグナル伝達経路の負の制御 ペプチジルチロシンリン酸化 ホスファチジルイノシトール3キナーゼシグナル伝達の正の制御 インテグリンを介した細胞接着の正の調節 細胞集団の増殖 血小板凝集 B細胞分化の調節 白血球遊走 ナチュラルキラー細胞を介した細胞傷害 細胞集団増殖の負の調節 脱リン酸化 アポトーシス過程 好中球脱顆粒 ペプチジルチロシン脱リン酸化 サイトカインを介したシグナル伝達経路 インターロイキン-6産生の負の調節 腫瘍壊死因子産生の負の調節 サイトカイン刺激に対する細胞応答 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 5777 15170 アンサンブル ENSG00000111679 ENSMUSG00000004266 ユニプロット P29350 P29351 RefSeq (mRNA) NM_002831 NM_080548 NM_080549 NM_001077705 NM_013545 RefSeq（タンパク質） NP_002822 NP_536858 NP_536859 NP_001071173 NP_038573 場所（UCSC） 12章: 6.95 – 6.96 Mb 6番目の文字: 124.7 – 124.72 MB PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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チロシンタンパク質ホスファターゼ非受容体型6は、 Src相同領域2ドメイン含有ホスファターゼ-1（SHP-1）としても知られ、ヒトではPTPN6遺伝子によってコードされる酵素である。^{[ 5 ]}

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、タンパク質チロシンホスファターゼ（PTP）ファミリーのメンバーである。PTPは、細胞増殖、分化、有糸分裂周期、および癌化など、様々な細胞プロセスを制御するシグナル伝達分子として知られている。このPTPのN末端部には、タンパク質リン酸化チロシン結合ドメインとして機能し、このPTPとその基質との相互作用を媒介する2つのタンデムSrcホモログ（ SH2 ）ドメインが含まれる。このPTPは主に造血細胞で発現し、造血細胞における複数のシグナル伝達経路の重要な調節因子として機能する。このPTPは、造血細胞シグナル伝達に関与する広範囲のリン酸化タンパク質と相互作用し、脱リン酸化することが示されている（例えば、LYN - CD22 - SHP-1経路）。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする複数の選択的スプライシングバリアントが報告されている。^{[ 6 ]}

表現

SHP-1遺伝子には、上皮細胞で活性化するP-1プロモーターと、造血細胞で活性化するP-2プロモーターという2つのプロモーターが存在する。さらに、SHP-1の発現は上皮細胞では低く、造血細胞では高い。癌細胞では、上皮細胞におけるSHP-1レベルが上昇し、造血細胞におけるSHP-1レベルは低下する。^{[ 7 ]}

相互作用

PTPN6 は以下と相互作用することが示されています。

• BCR遺伝子、^{[ 8 ]}
• CD117 , ^{[ 9 ] [ 10 ]}
• CD22、^{[ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]}
• CD31、^{[ 16 ] [ 17 ]}
• CTNND1 , ^{[ 18 ]}
• EGFR , ^{[ 19 ] [ 20 ]}
• EPOR、^{[ 21 ]}
• FCRL3 , ^{[ 22 ]}
• Grb2 , ^{[ 23 ] [ 24 ] [ 25 ]}
• HOXA10 , ^{[ 26 ]}
• JAK2 , ^{[ 27 ] [ 28 ]}
• LAIR1、^{[ 29 ] [ 30 ] [ 31 ] [ 32 ] [ 33 ]}
• LILRB2 , ^{[ 34 ] [ 35 ]}
• LILRB4、^{[ 36 ]}
• Lck、^{[ 37 ] [ 38 ] [ 39 ]}
• LCP2 , ^{[ 40 ] [ 41 ]}
• PRKCD , ^{[ 42 ]}
• PTK2B、^{[ 23 ] [ 43 ]}
• ROS1 , ^{[ 44 ]}
• シルパ、^{[ 29 ] [ 45 ]}
• SYK、^{[ 23 ] [ 46 ]} および
• TYK2 . ^{[ 47 ]}

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