パラディン

パルド
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
エイリアスPALLD、CGI-151、CGI151、MYN、PNCA1、SIH002、パラジン、細胞骨格関連タンパク質
外部IDオミム: 608092 ; MGI : 1919583 ;ホモロジーン: 75052 ;ジーンカード: PALLD ; OMA : PALLD - オルソログ
オーソログ
人間ねずみ
エントレズ
アンサンブル
ユニプロット
RefSeq (mRNA)

NM_001081390 NM_001293772 NM_001293773 NM_001293774

RefSeq(タンパク質)

NP_001074859 NP_001280701 NP_001280702 NP_001280703

場所(UCSC)4号線: 168.5 – 168.93 Mb8章: 61.96 – 62.36 Mb
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ウィキデータ
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パラディンは、ヒトではPALLD遺伝子によってコードされるタンパク質である。[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]パラディンは、細胞の形状、接着、収縮を制御するアクチンを含む微小フィラメントの成分である。 [ 8 ]

発見

パラディンは、2つの研究グループによって独立して特徴付けられました。最初はCarol Otey研究室(2000年)[ 6 ]、次にOlli Carpén研究室(2001年)[ 9 ]です。これは、ミオチリン-ミオパラディン-パラディンファミリーの一部であり、アクチン細胞骨格の調整に重要な役割を果たす可能性があります。[ 10 ]パラディンは、横紋筋でのみ発現するミオチリンミオパラディンとは対照的に、間葉系起源の細胞に広く発現しています。

パラディンは、イタリアのルネサンス建築家アンドレア・パラディオにちなんで名付けられ、セルの建築要素への局在を反映しています。[ 6 ]

真核生物の細胞骨格。パラディンはこの複雑な細胞機構の構成要素の一つです。

アイソフォーム

ヒトでは7つの異なるアイソフォームが存在すると考えられており、そのうちのいくつかは選択的スプライシングによって生じます。[ 11 ] マウスでは、パラディンの3つの主要なアイソフォームが単一の遺伝子から生じます。これらのアイソフォームは、Ig様ドメインを3~5コピー(アイソフォームによって異なります)とポリプロリンドメインを1~2コピー含んでいます。[ 6 ]

関数

パラディンの正確な生物学的役割は十分に理解されていないが、細胞骨格の組織化、胚発生、細胞運動、皮膚の瘢痕形成、神経細胞の発達に役割を果たすことが示されている。[ 10 ]

疾患の関連性

最近、パラディンRNAは膵臓腫瘍患者で過剰発現していること、また遺伝性の膵臓癌ではパラディンが過剰発現し変異していることが実証されました。[ 12 ]家族性膵臓癌で特定されたパラディン変異は、他の2つの遺伝学的研究において、ヨーロッパや北米の他の集団では同じ変異が見つかっていないため、北米の単一家族に特有のものである可能性があります。[ 13 ] [ 14 ]

さらに、Salariaらは、パラディンが膵臓癌の非腫瘍性間質で過剰発現しているものの、癌細胞自体ではほとんど発現していないことを明らかにしており[ 15 ] 、この疾患におけるパラディンの役割は腫瘍微小環境の変化に関与している可能性を示唆している。このタンパク質とその腫瘍形成における役割を完全に理解するには、さらなる研究が必要であることは明らかである。

この遺伝子ファミリーの他の2つのメンバーにも、疾患を引き起こす変異が特定されています。 ミオチリンの変異は肢帯型筋ジストロフィーの一種を引き起こし、ミオパラディンの変異は遺伝性の心疾患(拡張型心筋症)を引き起こします。

相互作用

PALLDはEZR相互作用することが示されている。[ 9 ]

参考文献

  1. ^ a b c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000129116Ensembl、2017年5月
  2. ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000058056Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「ヒトPubMedリファレンス:」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス:」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  5. ^永瀬 剛志、石川 功、須山 正之、菊野 亮、広澤 正治、宮島 暢志、田中 明、小谷 秀、野村 暢志、小原 修 (1999年7月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測. XIII. 脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列。in vitroで巨大タンパク質をコードする」 . DNA Res . 6 (1): 63– 70. doi : 10.1093/dnares/6.1.63 . PMID 10231032 . 
  6. ^ a b c d Parast MM, Otey CA (2000年9月). 「ストレスファイバーと細胞接着に局在する新規タンパク質、パラディンの特性評価」 . J Cell Biol . 150 (3): 643–56 . doi : 10.1083/jcb.150.3.643 . PMC 2175193. PMID 10931874 .  
  7. ^ヴィーマン S、ヴァイル B、ヴェレンロイター R、ガッセンフーバー J、グラスル S、アンゾルゲ W、ベッヒャー M、ブロッカー H、バウアーザックス S、ブルーム H、ラウバー J、デュスターホフト A、バイエル A、ケーラー K、ストラック N、メーヴェス HW、オッテンヴェルダー B、オーバーマイヤー B、タンペ J、ホイブナー D、ワンブットR、コーン B、クライン M、プストカ A (2001)。「ヒトの遺伝子とタンパク質のカタログに向けて: ヒト cDNA をコードする 500 個の新規完全タンパク質の配列決定と分析」ゲノム解析11 (3): 422–35 .土井: 10.1101/gr.GR1547RPMC 311072PMID 11230166  
  8. ^ a b「Entrez Gene: PALLD パラディン、細胞骨格関連タンパク質」。nih.gov。
  9. ^ a bミッカネン OM、グロンホルム M、ロンティ M、ラロウスキー M、サルミカンガス P、スイラ H、カルペン O (2001)。「マイクロフィラメント関連タンパク質であるヒトパラディンの特性評価」モル。バイオル。セル12 (10): 3060– 73.土井: 10.1091/mbc.12.10.3060PMC 60155PMID 11598191  
  10. ^ a b Otey CA, Rachlin A, Moza M, Arneman D, Carpen O (2005).アクチン関連足場におけるパラディン/ミオチリン/ミオパラディンファミリー. International Review of Cytology. Vol. 246. pp.  31– 58. doi : 10.1016/S0074-7696(05)46002-7 . ISBN 9780123646507. PMID  16164966 .{{cite book}}:|journal=無視されました (ヘルプ)
  11. ^ Rachlin AS, Otey CA (2006). 「パラディンアイソフォームの同定とLasp-1とパラディン間のアイソフォーム特異的相互作用の特徴づけ」 . J. Cell Sci . 119 (Pt 6): 995–1004 . doi : 10.1242/jcs.02825 . PMID 16492705 . 
  12. ^ Pogue-Geile KL, Chen R, Bronner MP, Crnogorac-Jurcevic T, Moyes KW, Dowen S, Otey CA, Crispin DA, George RD, Whitcomb DC, Brentnall TA (2006). 「パラディン変異は家族性膵臓がんを引き起こし、新たながん発症メカニズムを示唆する」 . PLOS Med . 3 (12): e516. doi : 10.1371/journal.pmed.0030516 . PMC 1751121. PMID 17194196 .  
  13. ^ Slater E, Amrillaeva V, Fendrich V, Bartsch D, Earl J, Vitone LJ, Neoptolemos JP, Greenhalf W (2007). パラディン変異は家族性膵臓がんを引き起こす:欧州系家族では認められない」 . PLOS Med . 4 (4): e164. doi : 10.1371/journal.pmed.0040164 . PMC 1855695. PMID 17455999 .  
  14. ^ Zogopoulos G, Rothenmund H, Eppel A, Ash C, Akbari MR, Hedley D, Narod SA, Gallinger S (2007). 「P239Sパラディン変異体は、遺伝性膵臓がんや早期発症膵臓がんの大きな割合を占めるわけではない」. Hum. Genet . 121 (5): 635–7 . doi : 10.1007 / s00439-007-0361-z . PMID 17415588. S2CID 2445261 .  
  15. ^ Salaria SN, Illei P, Sharma R, Walter KM, Klein AP, Eshleman JR, Maitra A, Schulick R, Winter J, Ouellette MM, Goggins M, Hruban R (2007). 「パラディンは膵臓の浸潤性乳管腺癌の非腫瘍性間質で過剰発現するが、腫瘍性細胞ではまれにしか過剰発現しない」 . Cancer Biol. Ther . 6 (3): 324–8 . doi : 10.4161/cbt.6.3.3904 . PMC 3144721. PMID 17404500 .  

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